RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496574.6

PKD1-222, Transcript of polycystin 1, transient receptor potential channel interacting, human

TSL 5

Gene PKD1, Length 4,419 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PKD1-222	ENST00000496574	OR5T2	Q8NGG2	359 aa		13.32	□□□□□ -0.28
PKD1-222	ENST00000496574	ST8SIA4	Q92187	359 aa		13.32	□□□□□ -0.28
PKD1-222	ENST00000496574	PHB2	Q99623	299 aa		13.32	□□□□□ -0.28
PKD1-222	ENST00000496574	TDP1	Q9NUW8	608 aa		13.32	□□□□□ -0.28
PKD1-222	ENST00000496574	CLEC4E	Q9ULY5	219 aa		13.32	□□□□□ -0.28
PKD1-222	ENST00000496574	ARID1B	Q8NFD5	2236 aa	Predicted RBP	13.32	□□□□□ -0.28
PKD1-222	ENST00000496574	LCMT2	O60294	686 aa	Known RBP	13.31	□□□□□ -0.28
PKD1-222	ENST00000496574	AKAIN1	P0CW23	69 aa		13.31	□□□□□ -0.28
PKD1-222	ENST00000496574	ELAVL4	P26378	380 aa	Known RBP	13.31	□□□□□ -0.28
PKD1-222	ENST00000496574	S100A11	P31949	105 aa		13.31	□□□□□ -0.28
PKD1-222	ENST00000496574	PBX2	P40425	430 aa		13.31	□□□□□ -0.28
PKD1-222	ENST00000496574	ALG10B	Q5I7T1	473 aa		13.31	□□□□□ -0.28
PKD1-222	ENST00000496574	NXNL2	Q5VZ03	156 aa		13.31	□□□□□ -0.28
PKD1-222	ENST00000496574	ENPP7	Q6UWV6	458 aa		13.31	□□□□□ -0.28
PKD1-222	ENST00000496574	KLHDC8A	Q8IYD2	350 aa		13.31	□□□□□ -0.28
PKD1-222	ENST00000496574	OR10K1	Q8NGX5	313 aa		13.31	□□□□□ -0.28
PKD1-222	ENST00000496574	SMAP2	Q8WU79	429 aa	Predicted RBP	13.31	□□□□□ -0.28
PKD1-222	ENST00000496574	TMEM239	Q8WW34	195 aa		13.31	□□□□□ -0.28
PKD1-222	ENST00000496574	SFXN2	Q96NB2	322 aa		13.31	□□□□□ -0.28
PKD1-222	ENST00000496574	ACTL8	Q9H568	366 aa		13.31	□□□□□ -0.28
PKD1-222	ENST00000496574	VNN3	Q9NY84	501 aa		13.31	□□□□□ -0.28
PKD1-222	ENST00000496574	WNT6	Q9Y6F9	365 aa		13.31	□□□□□ -0.28
PKD1-222	ENST00000496574	SLC9B1P1	A6NJY1	282 aa		13.31	□□□□□ -0.28
PKD1-222	ENST00000496574	DCN	P07585	359 aa	Known RBP	13.31	□□□□□ -0.28
PKD1-222	ENST00000496574	VEGFC	P49767	419 aa		13.31	□□□□□ -0.28
PKD1-222	ENST00000496574	CCR6	P51684	374 aa		13.31	□□□□□ -0.28
PKD1-222	ENST00000496574	RPS27A	P62979	156 aa	Known RBP	13.31	□□□□□ -0.28
PKD1-222	ENST00000496574	UBA52	P62987	128 aa	Known RBP	13.31	□□□□□ -0.28
PKD1-222	ENST00000496574	ZMAT1	Q5H9K5	638 aa		13.31	□□□□□ -0.28
PKD1-222	ENST00000496574	MRPL10	Q7Z7H8	261 aa	Known RBP	13.31	□□□□□ -0.28
PKD1-222	ENST00000496574	TCTE3	Q8IZS6	198 aa		13.31	□□□□□ -0.28
PKD1-222	ENST00000496574	LRIG1	Q96JA1	1093 aa		13.31	□□□□□ -0.28
PKD1-222	ENST00000496574	DGAT2	Q96PD7	388 aa		13.31	□□□□□ -0.28
PKD1-222	ENST00000496574	LMF1	Q96S06	567 aa		13.31	□□□□□ -0.28
PKD1-222	ENST00000496574	TCEAL7	Q9BRU2	100 aa		13.31	□□□□□ -0.28
PKD1-222	ENST00000496574	TMEM43	Q9BTV4	400 aa		13.31	□□□□□ -0.28
PKD1-222	ENST00000496574	SMG9	Q9H0W8	520 aa	Known RBP	13.31	□□□□□ -0.28
PKD1-222	ENST00000496574	ASB6	Q9NWX5	421 aa		13.31	□□□□□ -0.28
PKD1-222	ENST00000496574	SLC45A1	Q9Y2W3	748 aa		13.31	□□□□□ -0.28
PKD1-222	ENST00000496574	TLX3	O43711	291 aa	Predicted RBP	13.31	□□□□□ -0.28
PKD1-222	ENST00000496574	NDUFB2	O95178	105 aa		13.31	□□□□□ -0.28
PKD1-222	ENST00000496574	GNRH1	P01148	92 aa		13.31	□□□□□ -0.28
PKD1-222	ENST00000496574	HCK	P08631	526 aa		13.31	□□□□□ -0.28
PKD1-222	ENST00000496574	ITGA5	P08648	1049 aa		13.31	□□□□□ -0.28
PKD1-222	ENST00000496574	FBXO45	P0C2W1	286 aa		13.31	□□□□□ -0.28
PKD1-222	ENST00000496574	ETV6	P41212	452 aa		13.31	□□□□□ -0.28
PKD1-222	ENST00000496574	SORD	Q00796	357 aa		13.31	□□□□□ -0.28
PKD1-222	ENST00000496574	DEFB134	Q4QY38	66 aa		13.31	□□□□□ -0.28
PKD1-222	ENST00000496574	FAHD1	Q6P587	224 aa		13.31	□□□□□ -0.28
PKD1-222	ENST00000496574	CREB3L4	Q8TEY5	395 aa		13.31	□□□□□ -0.28
PKD1-222	ENST00000496574	RADIL	Q96JH8	1075 aa		13.31	□□□□□ -0.28
PKD1-222	ENST00000496574	NDUFB11	Q9NX14	153 aa		13.31	□□□□□ -0.28
PKD1-222	ENST00000496574	EPHA6	Q9UF33	1036 aa		13.31	□□□□□ -0.28
PKD1-222	ENST00000496574	NPC1	O15118	1278 aa		13.31	□□□□□ -0.28
PKD1-222	ENST00000496574	ATP5A1	P25705	553 aa	Known RBP	13.31	□□□□□ -0.28
PKD1-222	ENST00000496574	HSD11B1	P28845	292 aa		13.31	□□□□□ -0.28
PKD1-222	ENST00000496574	MAPK14	Q16539	360 aa		13.31	□□□□□ -0.28
PKD1-222	ENST00000496574	NKPD1	Q17RQ9	610 aa		13.31	□□□□□ -0.28
PKD1-222	ENST00000496574	RTP2	Q5QGT7	225 aa		13.31	□□□□□ -0.28
PKD1-222	ENST00000496574	ZNF529	Q6P280	563 aa		13.31	□□□□□ -0.28
PKD1-222	ENST00000496574	GRAMD2A	Q8IUY3	354 aa		13.31	□□□□□ -0.28
PKD1-222	ENST00000496574	OR5M3	Q8NGP4	307 aa		13.31	□□□□□ -0.28
PKD1-222	ENST00000496574	HMGCLL1	Q8TB92	370 aa		13.31	□□□□□ -0.28
PKD1-222	ENST00000496574	DDO	Q99489	341 aa		13.31	□□□□□ -0.28
PKD1-222	ENST00000496574	DPEP2	Q9H4A9	486 aa		13.31	□□□□□ -0.28
PKD1-222	ENST00000496574	TMEM38A	Q9H6F2	299 aa		13.31	□□□□□ -0.28
PKD1-222	ENST00000496574	SDHAF2	Q9NX18	166 aa		13.31	□□□□□ -0.28
PKD1-222	ENST00000496574	SLC6A5	Q9Y345	797 aa		13.31	□□□□□ -0.28
PKD1-222	ENST00000496574	VEGFD	O43915	354 aa		13.3	□□□□□ -0.28
PKD1-222	ENST00000496574	SRC	P12931	536 aa		13.3	□□□□□ -0.28
PKD1-222	ENST00000496574	FOSL2	P15408	326 aa		13.3	□□□□□ -0.28
PKD1-222	ENST00000496574	RAB3A	P20336	220 aa		13.3	□□□□□ -0.28
PKD1-222	ENST00000496574	CCKBR	P32239	447 aa		13.3	□□□□□ -0.28
PKD1-222	ENST00000496574	CD70	P32970	193 aa		13.3	□□□□□ -0.28
PKD1-222	ENST00000496574	DECR1	Q16698	335 aa		13.3	□□□□□ -0.28
PKD1-222	ENST00000496574	PYCR3	Q53H96	274 aa		13.3	□□□□□ -0.28
PKD1-222	ENST00000496574	PRSS36	Q5K4E3	855 aa		13.3	□□□□□ -0.28
PKD1-222	ENST00000496574	C18orf63	Q68DL7	685 aa		13.3	□□□□□ -0.28
PKD1-222	ENST00000496574	FCRLA	Q7L513	359 aa		13.3	□□□□□ -0.28
PKD1-222	ENST00000496574	SLC35F2	Q8IXU6	374 aa		13.3	□□□□□ -0.28
PKD1-222	ENST00000496574	ZNF480	Q8WV37	535 aa		13.3	□□□□□ -0.28
PKD1-222	ENST00000496574	OPALIN	Q96PE5	141 aa		13.3	□□□□□ -0.28
PKD1-222	ENST00000496574	ACER3	Q9NUN7	267 aa		13.3	□□□□□ -0.28
PKD1-222	ENST00000496574	FBXL2	Q9UKC9	423 aa		13.3	□□□□□ -0.28
PKD1-222	ENST00000496574	RFXAP	O00287	272 aa		13.3	□□□□□ -0.28
PKD1-222	ENST00000496574	AK1	P00568	194 aa		13.3	□□□□□ -0.28
PKD1-222	ENST00000496574	GYPB	P06028	91 aa		13.3	□□□□□ -0.28
PKD1-222	ENST00000496574	RAB40AL	P0C0E4	278 aa		13.3	□□□□□ -0.28
PKD1-222	ENST00000496574	TPT1	P13693	172 aa	Known RBP	13.3	□□□□□ -0.28
PKD1-222	ENST00000496574	RPL34	P49207	117 aa	Known RBP	13.3	□□□□□ -0.28
PKD1-222	ENST00000496574	KCNJ10	P78508	379 aa		13.3	□□□□□ -0.28
PKD1-222	ENST00000496574	NOG	Q13253	232 aa		13.3	□□□□□ -0.28
PKD1-222	ENST00000496574	DEFB115	Q30KQ5	88 aa		13.3	□□□□□ -0.28
PKD1-222	ENST00000496574	RAB40A	Q8WXH6	277 aa		13.3	□□□□□ -0.28
PKD1-222	ENST00000496574	DCUN1D4	Q92564	292 aa		13.3	□□□□□ -0.28
PKD1-222	ENST00000496574	OR2A14	Q96R47	310 aa		13.3	□□□□□ -0.28
PKD1-222	ENST00000496574	SLAMF7	Q9NQ25	335 aa		13.3	□□□□□ -0.28
PKD1-222	ENST00000496574	PRMT8	Q9NR22	394 aa	Predicted RBP	13.3	□□□□□ -0.28
PKD1-222	ENST00000496574	MED17	Q9NVC6	651 aa		13.3	□□□□□ -0.28
PKD1-222	ENST00000496574	EDDM13	A0A1B0GTR0	161 aa		13.3	□□□□□ -0.28

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