RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492657.5

PRAME-213, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRAME, Length 2,831 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-213ENST00000492657 PEX5LQ8IYB4 626 aa11.96□□□□□ -0.49
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PRAME-213ENST00000492657 DCST2Q5T1A1 773 aa11.94□□□□□ -0.5
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PRAME-213ENST00000492657 AADACL4Q5VUY2 407 aa11.94□□□□□ -0.5
PRAME-213ENST00000492657 Q6ZS52 159 aa11.94□□□□□ -0.5
PRAME-213ENST00000492657 TAF8Q7Z7C8 310 aa11.94□□□□□ -0.5
PRAME-213ENST00000492657 ELMOD2Q8IZ81 293 aa11.94□□□□□ -0.5
PRAME-213ENST00000492657 CSNK1A1LQ8N752 337 aa11.94□□□□□ -0.5
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