RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489247.1

ATG4A-208, Transcript of autophagy related 4A cysteine peptidase, human

TSL 2

Gene ATG4A, Length 623 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATG4A-208	ENST00000489247	OR5D16	Q8NGK9	328 aa		5.15	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	ZCCHC10	Q8TBK6	192 aa		5.15	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	LMX1A	Q8TE12	382 aa		5.15	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	APH1B	Q8WW43	257 aa		5.15	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	XAGE5	Q8WWM1	108 aa		5.15	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	ASB15	Q8WXK1	588 aa		5.15	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	MUL1	Q969V5	352 aa		5.15	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	SLC35A4	Q96G79	324 aa		5.15	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	C16orf58	Q96GQ5	468 aa		5.15	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	ZDHHC12	Q96GR4	267 aa		5.15	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	C16orf92	Q96LL3	132 aa		5.15	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	LMF2	Q9BU23	707 aa	Known RBP	5.15	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	RIBC2	Q9H4K1	309 aa		5.15	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	MTHFD2L	Q9H903	347 aa	Predicted RBP	5.15	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	ANKH	Q9HCJ1	492 aa		5.15	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	MAN2C1	Q9NTJ4	1040 aa		5.15	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	MAT2B	Q9NZL9	334 aa		5.15	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	SEC14L3	Q9UDX4	400 aa		5.15	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	RSL24D1	Q9UHA3	163 aa	Known RBP	5.15	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	PLCL2	Q9UPR0	1127 aa		5.15	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	WASF3	Q9UPY6	502 aa		5.15	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	IFT52	Q9Y366	437 aa		5.15	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	CHST2	Q9Y4C5	530 aa		5.15	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	TESMIN	Q9Y4I5	508 aa		5.15	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	GMPPB	Q9Y5P6	360 aa		5.15	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	PMF1-BGLAP	U3KQ54	211 aa		5.15	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	TRIOBP	Q9H2D6	2365 aa		5.15	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	IGHV1OR21-1	A0A087WYE8	117 aa		5.14	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	TRBV4-1	A0A0J9YWV2	114 aa		5.14	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	SH3D21	A4FU49	640 aa		5.14	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	SYNDIG1L	A6NDD5	238 aa		5.14	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	AGAP5	A6NIR3	686 aa		5.14	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	SLC9B1P1	A6NJY1	282 aa		5.14	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	NPIPB9	F8W1W9	429 aa		5.14	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247		H3BSA7	217 aa		5.14	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247		J3KTA2	159 aa		5.14	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	BCAT2	O15382	392 aa	Predicted RBP	5.14	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	TOX3	O15405	576 aa	Predicted RBP	5.14	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	CHST10	O43529	356 aa		5.14	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	HCRTR1	O43613	425 aa		5.14	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	KIAA0513	O60268	411 aa		5.14	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	PCDHGA12	O60330	932 aa		5.14	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	MPZL2	O60487	215 aa		5.14	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	COQ9	O75208	318 aa		5.14	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	SEC24D	O94855	1032 aa	Predicted RBP	5.14	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	OR5F1	O95221	314 aa		5.14	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	ANGPTL1	O95841	491 aa		5.14	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	ALPP	P05187	535 aa		5.14	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	C8orf89	P0DMQ9	161 aa		5.14	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	ACP2	P11117	423 aa		5.14	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	OSM	P13725	252 aa		5.14	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	IL7R	P16871	459 aa		5.14	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	CD40	P25942	277 aa		5.14	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	EPHA2	P29317	976 aa		5.14	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	SLC5A2	P31639	672 aa		5.14	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	THBS2	P35442	1172 aa		5.14	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	FNTB	P49356	437 aa		5.14	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	TMBIM6	P55061	237 aa		5.14	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	HSD17B7	P56937	341 aa		5.14	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	SNRPG	P62308	76 aa	Known RBP	5.14	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	EEF1A1	P68104	462 aa	Known RBP	5.14	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	SIM1	P81133	766 aa	Predicted RBP	5.14	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	BNC1	Q01954	994 aa		5.14	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	FUT7	Q11130	342 aa		5.14	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	FAP	Q12884	760 aa		5.14	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	RAB39A	Q14964	217 aa		5.14	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	SHB	Q15464	509 aa		5.14	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	DUSP5	Q16690	384 aa		5.14	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	EIPR1	Q53HC9	387 aa		5.14	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	ENTPD8	Q5MY95	495 aa		5.14	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	DCST1	Q5T197	706 aa		5.14	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	SLX4IP	Q5VYV7	408 aa		5.14	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	RNLS	Q5VYX0	342 aa		5.14	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	C12orf73	Q69YU5	71 aa		5.14	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	LAIR1	Q6GTX8	287 aa		5.14	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	TYW3	Q6IPR3	259 aa	Known RBP	5.14	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	C1orf94	Q6P1W5	598 aa		5.14	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	PGBD2	Q6P3X8	592 aa		5.14	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	WDR74	Q6RFH5	385 aa	Predicted RBP	5.14	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	KLHL17	Q6TDP4	642 aa		5.14	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	DBX2	Q6ZNG2	339 aa		5.14	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	KCTD8	Q6ZWB6	473 aa		5.14	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	PRSS48	Q7RTY5	328 aa		5.14	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	PRSS41	Q7RTY9	318 aa		5.14	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	DGLUCY	Q7Z3D6	616 aa		5.14	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	GPR141	Q7Z602	305 aa		5.14	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	GALNT5	Q7Z7M9	940 aa		5.14	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	ZBTB46	Q86UZ6	589 aa		5.14	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	GRAMD2A	Q8IUY3	354 aa		5.14	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	LACC1	Q8IV20	430 aa		5.14	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	ENTHD1	Q8IYW4	607 aa		5.14	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	D2HGDH	Q8N465	521 aa		5.14	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	SLC16A11	Q8NCK7	471 aa		5.14	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	SLC7A13	Q8TCU3	470 aa		5.14	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	ADAMTS15	Q8TE58	950 aa		5.14	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	TRUB1	Q8WWH5	349 aa	Known RBP	5.14	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	FGF11	Q92914	225 aa		5.14	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	SLC41A2	Q96JW4	573 aa		5.14	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	SDF2	Q99470	211 aa		5.14	□□□□□ -1.59
ATG4A-208	ENST00000489247	TSC22D3	Q99576	134 aa		5.14	□□□□□ -1.59

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