RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471880.5

SSR4-208, Transcript of signal sequence receptor subunit 4, human

TSL 5

Gene SSR4, Length 785 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF337	Q9Y3M9	751 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SSR4-208	ENST00000471880	PDZD2	O15018	2839 aa		13.4	□□□□□ -0.27
SSR4-208	ENST00000471880	DUXA	A6NLW8	204 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SSR4-208	ENST00000471880	GSN	P06396	782 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SSR4-208	ENST00000471880	OR12D1	P0DN82	309 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SSR4-208	ENST00000471880	IDO1	P14902	403 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF708	P17019	499 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SSR4-208	ENST00000471880	UQCRC2	P22695	453 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SSR4-208	ENST00000471880	MSX1	P28360	303 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SSR4-208	ENST00000471880	TIMP3	P35625	211 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SSR4-208	ENST00000471880	CLDN18	P56856	261 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF621	Q6ZSS3	439 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SSR4-208	ENST00000471880	OLIG3	Q7RTU3	272 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SSR4-208	ENST00000471880	TRIML2	Q8N7C3	387 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SSR4-208	ENST00000471880	B4GALNT2	Q8NHY0	566 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SSR4-208	ENST00000471880	RAB8B	Q92930	207 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SSR4-208	ENST00000471880	OR52B2	Q96RD2	323 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SSR4-208	ENST00000471880	TM9SF2	Q99805	663 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SSR4-208	ENST00000471880	HOXD1	Q9GZZ0	328 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SSR4-208	ENST00000471880	TMEM185B	Q9H7F4	350 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SSR4-208	ENST00000471880	CALHM2	Q9HA72	323 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SSR4-208	ENST00000471880	HHATL	Q9HCP6	504 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SSR4-208	ENST00000471880	STOML1	Q9UBI4	398 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SSR4-208	ENST00000471880	CARD8	Q9Y2G2	431 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SSR4-208	ENST00000471880	USH1C	Q9Y6N9	552 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SSR4-208	ENST00000471880	MBD3L4	A6NDZ8	208 aa	Predicted RBP	13.38	□□□□□ -0.27
SSR4-208	ENST00000471880	MBD3L3	A6NE82	208 aa	Predicted RBP	13.38	□□□□□ -0.27
SSR4-208	ENST00000471880	MBD3L5	A6NJ08	208 aa	Predicted RBP	13.38	□□□□□ -0.27
SSR4-208	ENST00000471880	HMGB1P1	B2RPK0	211 aa	Predicted RBP	13.38	□□□□□ -0.27
SSR4-208	ENST00000471880		H0YC42	278 aa		13.38	□□□□□ -0.27
SSR4-208	ENST00000471880	EIF1AY	O14602	144 aa	Known RBP	13.38	□□□□□ -0.27
SSR4-208	ENST00000471880	ANKRD28	O15084	1053 aa		13.38	□□□□□ -0.27
SSR4-208	ENST00000471880	UBD	O15205	165 aa		13.38	□□□□□ -0.27
SSR4-208	ENST00000471880	POLR3G	O15318	223 aa	Predicted RBP	13.38	□□□□□ -0.27
SSR4-208	ENST00000471880	SLC22A3	O75751	556 aa		13.38	□□□□□ -0.27
SSR4-208	ENST00000471880	SOX30	O94993	753 aa		13.38	□□□□□ -0.27
SSR4-208	ENST00000471880	ANP32D	O95626	131 aa		13.38	□□□□□ -0.27
SSR4-208	ENST00000471880	OPN1LW	P04000	364 aa		13.38	□□□□□ -0.27
SSR4-208	ENST00000471880	NGFR	P08138	427 aa		13.38	□□□□□ -0.27
SSR4-208	ENST00000471880	CTSS	P25774	331 aa		13.38	□□□□□ -0.27
SSR4-208	ENST00000471880	LCN1	P31025	176 aa		13.38	□□□□□ -0.27
SSR4-208	ENST00000471880	CPA2	P48052	419 aa		13.38	□□□□□ -0.27
SSR4-208	ENST00000471880	KHK	P50053	298 aa		13.38	□□□□□ -0.27
SSR4-208	ENST00000471880	ASCL1	P50553	236 aa		13.38	□□□□□ -0.27
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF136	P52737	540 aa		13.38	□□□□□ -0.27
SSR4-208	ENST00000471880	TPD52	P55327	224 aa	Predicted RBP	13.38	□□□□□ -0.27
SSR4-208	ENST00000471880	EEFSEC	P57772	596 aa	Known RBP	13.38	□□□□□ -0.27
SSR4-208	ENST00000471880	B3GALT5-AS1	P59052	145 aa		13.38	□□□□□ -0.27
SSR4-208	ENST00000471880	RPS3A	P61247	264 aa	Known RBP	13.38	□□□□□ -0.27
SSR4-208	ENST00000471880	STX1B	P61266	288 aa		13.38	□□□□□ -0.27
SSR4-208	ENST00000471880	PHC1	P78364	1004 aa		13.38	□□□□□ -0.27
SSR4-208	ENST00000471880	HPCA	P84074	193 aa		13.38	□□□□□ -0.27
SSR4-208	ENST00000471880	TLE4	Q04727	773 aa		13.38	□□□□□ -0.27
SSR4-208	ENST00000471880	CD226	Q15762	336 aa		13.38	□□□□□ -0.27
SSR4-208	ENST00000471880	NDUFAF6	Q330K2	333 aa		13.38	□□□□□ -0.27
SSR4-208	ENST00000471880	GPAT3	Q53EU6	434 aa		13.38	□□□□□ -0.27
SSR4-208	ENST00000471880	MAVS	Q7Z434	540 aa		13.38	□□□□□ -0.27
SSR4-208	ENST00000471880	MISP	Q8IVT2	679 aa		13.38	□□□□□ -0.27
SSR4-208	ENST00000471880	RELL2	Q8NC24	303 aa	Predicted RBP	13.38	□□□□□ -0.27
SSR4-208	ENST00000471880	MBD3L2	Q8NHZ7	208 aa	Predicted RBP	13.38	□□□□□ -0.27
SSR4-208	ENST00000471880	PNPT1	Q8TCS8	783 aa	Known RBP	13.38	□□□□□ -0.27
SSR4-208	ENST00000471880	SPOCK3	Q9BQ16	436 aa		13.38	□□□□□ -0.27
SSR4-208	ENST00000471880	INPP5K	Q9BT40	448 aa		13.38	□□□□□ -0.27
SSR4-208	ENST00000471880	PINK1	Q9BXM7	581 aa		13.38	□□□□□ -0.27
SSR4-208	ENST00000471880	PRRG4	Q9BZD6	226 aa		13.38	□□□□□ -0.27
SSR4-208	ENST00000471880	SERHL2	Q9H4I8	314 aa		13.38	□□□□□ -0.27
SSR4-208	ENST00000471880	SLCO1B3	Q9NPD5	702 aa		13.38	□□□□□ -0.27
SSR4-208	ENST00000471880	INTS9	Q9NV88	658 aa	Known RBP	13.38	□□□□□ -0.27
SSR4-208	ENST00000471880	GPR45	Q9Y5Y3	372 aa		13.38	□□□□□ -0.27
SSR4-208	ENST00000471880	MPDZ	O75970	2070 aa		13.38	□□□□□ -0.27
SSR4-208	ENST00000471880	CCDC154	A6NI56	674 aa		13.37	□□□□□ -0.27
SSR4-208	ENST00000471880	SLC22A20	A6NK97	555 aa		13.37	□□□□□ -0.27
SSR4-208	ENST00000471880	KLF11	O14901	512 aa		13.37	□□□□□ -0.27
SSR4-208	ENST00000471880	TNFRSF21	O75509	655 aa		13.37	□□□□□ -0.27
SSR4-208	ENST00000471880	STX11	O75558	287 aa		13.37	□□□□□ -0.27
SSR4-208	ENST00000471880	PGR	P06401	933 aa		13.37	□□□□□ -0.27
SSR4-208	ENST00000471880	ME2	P23368	584 aa		13.37	□□□□□ -0.27
SSR4-208	ENST00000471880	IL12A	P29459	219 aa		13.37	□□□□□ -0.27
SSR4-208	ENST00000471880	SSTR2	P30874	369 aa		13.37	□□□□□ -0.27
SSR4-208	ENST00000471880	CEACAM8	P31997	349 aa	Predicted RBP	13.37	□□□□□ -0.27
SSR4-208	ENST00000471880	OPRM1	P35372	400 aa		13.37	□□□□□ -0.27
SSR4-208	ENST00000471880	EIF1AX	P47813	144 aa	Known RBP	13.37	□□□□□ -0.27
SSR4-208	ENST00000471880	ATP12A	P54707	1039 aa		13.37	□□□□□ -0.27
SSR4-208	ENST00000471880	CLDN20	P56880	219 aa		13.37	□□□□□ -0.27
SSR4-208	ENST00000471880	PPP2R2A	P63151	447 aa		13.37	□□□□□ -0.27
SSR4-208	ENST00000471880	SIRPA	P78324	504 aa		13.37	□□□□□ -0.27
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF117	Q03924	483 aa		13.37	□□□□□ -0.27
SSR4-208	ENST00000471880	TFF3	Q07654	80 aa		13.37	□□□□□ -0.27
SSR4-208	ENST00000471880	PDZK1	Q5T2W1	519 aa		13.37	□□□□□ -0.27
SSR4-208	ENST00000471880	LUZP2	Q86TE4	346 aa		13.37	□□□□□ -0.27
SSR4-208	ENST00000471880	TMEM200A	Q86VY9	491 aa		13.37	□□□□□ -0.27
SSR4-208	ENST00000471880	CNEP1R1	Q8N9A8	125 aa		13.37	□□□□□ -0.27
SSR4-208	ENST00000471880	ATP6V1C2	Q8NEY4	427 aa		13.37	□□□□□ -0.27
SSR4-208	ENST00000471880	GOT1L1	Q8NHS2	421 aa	Predicted RBP	13.37	□□□□□ -0.27
SSR4-208	ENST00000471880	ACTRT2	Q8TDY3	377 aa		13.37	□□□□□ -0.27
SSR4-208	ENST00000471880	RNF145	Q96MT1	663 aa		13.37	□□□□□ -0.27
SSR4-208	ENST00000471880	SDF2	Q99470	211 aa		13.37	□□□□□ -0.27
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF559	Q9BR84	538 aa		13.37	□□□□□ -0.27
SSR4-208	ENST00000471880	TRIM8	Q9BZR9	551 aa		13.37	□□□□□ -0.27
SSR4-208	ENST00000471880	ENKD1	Q9H0I2	346 aa		13.37	□□□□□ -0.27

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