RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460120.5

HPS3-202, Transcript of HPS3, biogenesis of lysosomal organelles complex 2 subunit 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HPS3, Length 2,745 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS3-202ENST00000460120 TEX12Q9BXU0 123 aa16.87■□□□□ 0.29
HPS3-202ENST00000460120 PRRG3Q9BZD7 231 aa16.87■□□□□ 0.29
HPS3-202ENST00000460120 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa16.87■□□□□ 0.29
HPS3-202ENST00000460120 A0A1B0GVC2 190 aa16.87■□□□□ 0.29
HPS3-202ENST00000460120 IQCMA0A1B0GVH7 501 aa16.87■□□□□ 0.29
HPS3-202ENST00000460120 A6NIN4 97 aa16.87■□□□□ 0.29
HPS3-202ENST00000460120 CLUP10909 449 aa16.87■□□□□ 0.29
HPS3-202ENST00000460120 GABRA3P34903 492 aa16.87■□□□□ 0.29
HPS3-202ENST00000460120 STAT5AP42229 794 aa16.87■□□□□ 0.29
HPS3-202ENST00000460120 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP16.87■□□□□ 0.29
HPS3-202ENST00000460120 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP16.87■□□□□ 0.29
HPS3-202ENST00000460120 ALG11Q2TAA5 492 aa16.87■□□□□ 0.29
HPS3-202ENST00000460120 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa16.87■□□□□ 0.29
HPS3-202ENST00000460120 TMEM53Q6P2H8 277 aa16.87■□□□□ 0.29
HPS3-202ENST00000460120 OR2L13Q8N349 312 aa16.87■□□□□ 0.29
HPS3-202ENST00000460120 TMEM99Q8N816 258 aa16.87■□□□□ 0.29
HPS3-202ENST00000460120 SERINC2Q96SA4 455 aa16.87■□□□□ 0.29
HPS3-202ENST00000460120 SARGQ9BW04 601 aa16.87■□□□□ 0.29
HPS3-202ENST00000460120 HOXD1Q9GZZ0 328 aa16.87■□□□□ 0.29
HPS3-202ENST00000460120 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP16.87■□□□□ 0.29
HPS3-202ENST00000460120 DZANK1Q9NVP4 752 aa16.87■□□□□ 0.29
HPS3-202ENST00000460120 PHF11Q9UIL8 331 aa16.87■□□□□ 0.29
HPS3-202ENST00000460120 C12orf71A8MTZ7 269 aa16.86■□□□□ 0.29
HPS3-202ENST00000460120 GABRA5P31644 462 aa16.86■□□□□ 0.29
HPS3-202ENST00000460120 TNFRSF4P43489 277 aa16.86■□□□□ 0.29
HPS3-202ENST00000460120 SRP54P61011 504 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
HPS3-202ENST00000460120 ZNF155Q12901 538 aaPredicted RBP16.86■□□□□ 0.29
HPS3-202ENST00000460120 P2RY14Q15391 338 aa16.86■□□□□ 0.29
HPS3-202ENST00000460120 OR1Q1Q15612 314 aa16.86■□□□□ 0.29
HPS3-202ENST00000460120 CEBPEQ15744 281 aa16.86■□□□□ 0.29
HPS3-202ENST00000460120 KLHL36Q8N4N3 616 aa16.86■□□□□ 0.29
HPS3-202ENST00000460120 C7orf57Q8NEG2 295 aa16.86■□□□□ 0.29
HPS3-202ENST00000460120 OR10H4Q8NGA5 316 aa16.86■□□□□ 0.29
HPS3-202ENST00000460120 NEIL3Q8TAT5 605 aa16.86■□□□□ 0.29
HPS3-202ENST00000460120 UBASH3BQ8TF42 649 aa16.86■□□□□ 0.29
HPS3-202ENST00000460120 RFKQ969G6 155 aa16.86■□□□□ 0.29
HPS3-202ENST00000460120 PTCHD1Q96NR3 888 aa16.86■□□□□ 0.29
HPS3-202ENST00000460120 NEK6Q9HC98 313 aa16.86■□□□□ 0.29
HPS3-202ENST00000460120 IL20Q9NYY1 176 aa16.86■□□□□ 0.29
HPS3-202ENST00000460120 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
HPS3-202ENST00000460120 CDH10Q9Y6N8 788 aa16.86■□□□□ 0.29
HPS3-202ENST00000460120 GABRPO00591 440 aa16.86■□□□□ 0.29
HPS3-202ENST00000460120 TSFMP43897 325 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
HPS3-202ENST00000460120 TPBGQ13641 420 aa16.86■□□□□ 0.29
HPS3-202ENST00000460120 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa16.86■□□□□ 0.29
HPS3-202ENST00000460120 PRAMEF8Q5VWM4 474 aa16.86■□□□□ 0.29
HPS3-202ENST00000460120 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa16.86■□□□□ 0.29
HPS3-202ENST00000460120 IL20RBQ6UXL0 311 aa16.86■□□□□ 0.29
HPS3-202ENST00000460120 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa16.86■□□□□ 0.29
HPS3-202ENST00000460120 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP16.86■□□□□ 0.29
HPS3-202ENST00000460120 POGLUT1Q8NBL1 392 aa16.86■□□□□ 0.29
HPS3-202ENST00000460120 HMGB4Q8WW32 186 aa16.86■□□□□ 0.29
HPS3-202ENST00000460120 IFT27Q9BW83 186 aa16.86■□□□□ 0.29
HPS3-202ENST00000460120 HRASLS2Q9NWW9 162 aa16.86■□□□□ 0.29
HPS3-202ENST00000460120 FBXL4Q9UKA2 621 aa16.86■□□□□ 0.29
HPS3-202ENST00000460120 UNC119BA6NIH7 251 aa16.85■□□□□ 0.29
HPS3-202ENST00000460120 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP16.85■□□□□ 0.29
HPS3-202ENST00000460120 PAICSP22234 425 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
HPS3-202ENST00000460120 CTHP32929 405 aa16.85■□□□□ 0.29
HPS3-202ENST00000460120 EEF1A1P68104 462 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
HPS3-202ENST00000460120 SCN1BQ07699 218 aa16.85■□□□□ 0.29
HPS3-202ENST00000460120 IL18Q14116 193 aa16.85■□□□□ 0.29
HPS3-202ENST00000460120 RNLSQ5VYX0 342 aa16.85■□□□□ 0.29
HPS3-202ENST00000460120 TMEM92Q6UXU6 159 aa16.85■□□□□ 0.29
HPS3-202ENST00000460120 THSD4Q6ZMP0 1018 aa16.85■□□□□ 0.29
HPS3-202ENST00000460120 RAB43Q86YS6 212 aa16.85■□□□□ 0.29
HPS3-202ENST00000460120 GJD3Q8N144 294 aa16.85■□□□□ 0.29
HPS3-202ENST00000460120 SLC22A18Q96BI1 424 aa16.85■□□□□ 0.29
HPS3-202ENST00000460120 PRSS27Q9BQR3 290 aa16.85■□□□□ 0.29
HPS3-202ENST00000460120 NLGN3Q9NZ94 848 aa16.85■□□□□ 0.29
HPS3-202ENST00000460120 PTGFRNQ9P2B2 879 aa16.85■□□□□ 0.29
HPS3-202ENST00000460120 TRAPPC4Q9Y296 219 aa16.85■□□□□ 0.29
HPS3-202ENST00000460120 BOLA1Q9Y3E2 137 aa16.85■□□□□ 0.29
HPS3-202ENST00000460120 SLC22A7Q9Y694 548 aa16.85■□□□□ 0.29
HPS3-202ENST00000460120 LAMA1P25391 3075 aa16.85■□□□□ 0.29
HPS3-202ENST00000460120 KCNJ13O60928 360 aa16.85■□□□□ 0.29
HPS3-202ENST00000460120 OR5F1O95221 314 aa16.85■□□□□ 0.29
HPS3-202ENST00000460120 HTR3AP46098 478 aa16.85■□□□□ 0.29
HPS3-202ENST00000460120 FXYD6P3P58550 94 aa16.85■□□□□ 0.29
HPS3-202ENST00000460120 DSG2Q14126 1118 aa16.85■□□□□ 0.29
HPS3-202ENST00000460120 GLYR1Q49A26 553 aaPredicted RBP16.85■□□□□ 0.29
HPS3-202ENST00000460120 ATAD3CQ5T2N8 411 aa16.85■□□□□ 0.29
HPS3-202ENST00000460120 FAM27D1Q5T7N8 215 aa16.85■□□□□ 0.29
HPS3-202ENST00000460120 CNIH2Q6PI25 160 aa16.85■□□□□ 0.29
HPS3-202ENST00000460120 Q6ZSR6 202 aa16.85■□□□□ 0.29
HPS3-202ENST00000460120 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa16.85■□□□□ 0.29
HPS3-202ENST00000460120 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP16.85■□□□□ 0.29
HPS3-202ENST00000460120 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa16.85■□□□□ 0.29
HPS3-202ENST00000460120 ZNF221Q9UK13 617 aa16.85■□□□□ 0.29
HPS3-202ENST00000460120 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP16.85■□□□□ 0.29
HPS3-202ENST00000460120 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP16.85■□□□□ 0.29
HPS3-202ENST00000460120 STK25O00506 426 aa16.84■□□□□ 0.29
HPS3-202ENST00000460120 RDH16O75452 317 aa16.84■□□□□ 0.29
HPS3-202ENST00000460120 NDUFS1P28331 727 aa16.84■□□□□ 0.29
HPS3-202ENST00000460120 HOXD12P35452 270 aa16.84■□□□□ 0.29
HPS3-202ENST00000460120 ZNF628Q5EBL2 1059 aa16.84■□□□□ 0.29
HPS3-202ENST00000460120 ABHD13Q7L211 337 aa16.84■□□□□ 0.29
HPS3-202ENST00000460120 UBQLNLQ8IYU4 475 aa16.84■□□□□ 0.29
HPS3-202ENST00000460120 CLDN22Q8N7P3 220 aa16.84■□□□□ 0.29
HPS3-202ENST00000460120 NT5CQ8TCD5 201 aa16.84■□□□□ 0.29
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