RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449058.6

TOM1-210, Transcript of target of myb1 membrane trafficking protein, human

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene TOM1, Length 2,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TOM1-210	ENST00000449058	BHLHE40	O14503	412 aa		15.73	■□□□□ 0.11
TOM1-210	ENST00000449058	PLA2G10	O15496	165 aa		15.73	■□□□□ 0.11
TOM1-210	ENST00000449058	PLOD3	O60568	738 aa		15.73	■□□□□ 0.11
TOM1-210	ENST00000449058	KLF8	O95600	359 aa	Predicted RBP	15.73	■□□□□ 0.11
TOM1-210	ENST00000449058	HLA-DQB1	P01920	261 aa		15.73	■□□□□ 0.11
TOM1-210	ENST00000449058	TRAPPC2	P0DI81	140 aa		15.73	■□□□□ 0.11
TOM1-210	ENST00000449058	TRAPPC2B	P0DI82	140 aa		15.73	■□□□□ 0.11
TOM1-210	ENST00000449058	POLR2C	P19387	275 aa	Predicted RBP	15.73	■□□□□ 0.11
TOM1-210	ENST00000449058	EN2	P19622	333 aa	Predicted RBP	15.73	■□□□□ 0.11
TOM1-210	ENST00000449058	MAK	P20794	623 aa		15.73	■□□□□ 0.11
TOM1-210	ENST00000449058	TBXA2R	P21731	343 aa		15.73	■□□□□ 0.11
TOM1-210	ENST00000449058	ATP6V1E1	P36543	226 aa		15.73	■□□□□ 0.11
TOM1-210	ENST00000449058	DDOST	P39656	456 aa		15.73	■□□□□ 0.11
TOM1-210	ENST00000449058	BDH1	Q02338	343 aa		15.73	■□□□□ 0.11
TOM1-210	ENST00000449058	SF3B4	Q15427	424 aa	Known RBP eCLIP	15.73	■□□□□ 0.11	9e-14	■■■■■ 55.9
TOM1-210	ENST00000449058	OR1Q1	Q15612	314 aa		15.73	■□□□□ 0.11
TOM1-210	ENST00000449058	ZNF800	Q2TB10	664 aa	Predicted RBP eCLIP	15.73	■□□□□ 0.11
TOM1-210	ENST00000449058	MRPL2	Q5T653	305 aa	Known RBP	15.73	■□□□□ 0.11
TOM1-210	ENST00000449058	ATP6V1C2	Q8NEY4	427 aa		15.73	■□□□□ 0.11
TOM1-210	ENST00000449058	NEIL3	Q8TAT5	605 aa		15.73	■□□□□ 0.11
TOM1-210	ENST00000449058	SIPA1	Q96FS4	1042 aa		15.73	■□□□□ 0.11
TOM1-210	ENST00000449058	PHOX2B	Q99453	314 aa		15.73	■□□□□ 0.11
TOM1-210	ENST00000449058	MMP28	Q9H239	520 aa		15.73	■□□□□ 0.11
TOM1-210	ENST00000449058	ADAP2	Q9NPF8	381 aa		15.73	■□□□□ 0.11
TOM1-210	ENST00000449058	COMMD3	Q9UBI1	195 aa		15.73	■□□□□ 0.11
TOM1-210	ENST00000449058	N6AMT1	Q9Y5N5	214 aa		15.73	■□□□□ 0.11
TOM1-210	ENST00000449058	CDHR4	A6H8M9	788 aa		15.72	■□□□□ 0.11
TOM1-210	ENST00000449058	OR6C74	A6NCV1	312 aa		15.72	■□□□□ 0.11
TOM1-210	ENST00000449058	ZNF860	A6NHJ4	632 aa		15.72	■□□□□ 0.11
TOM1-210	ENST00000449058	TNFRSF10C	O14798	259 aa		15.72	■□□□□ 0.11
TOM1-210	ENST00000449058	FMO6P	O60774	539 aa		15.72	■□□□□ 0.11
TOM1-210	ENST00000449058	MAP3K8	P41279	467 aa		15.72	■□□□□ 0.11
TOM1-210	ENST00000449058	GPR18	Q14330	331 aa		15.72	■□□□□ 0.11
TOM1-210	ENST00000449058	PLBD1	Q6P4A8	553 aa		15.72	■□□□□ 0.11
TOM1-210	ENST00000449058	METAP1D	Q6UB28	335 aa	Predicted RBP	15.72	■□□□□ 0.11
TOM1-210	ENST00000449058	TMEM91	Q6ZNR0	172 aa		15.72	■□□□□ 0.11
TOM1-210	ENST00000449058	PRR23C	Q6ZRP0	262 aa		15.72	■□□□□ 0.11
TOM1-210	ENST00000449058	KLB	Q86Z14	1044 aa		15.72	■□□□□ 0.11
TOM1-210	ENST00000449058	CDRT4	Q8N9R6	151 aa		15.72	■□□□□ 0.11
TOM1-210	ENST00000449058	FANK1	Q8TC84	345 aa		15.72	■□□□□ 0.11
TOM1-210	ENST00000449058	TMEM239	Q8WW34	195 aa		15.72	■□□□□ 0.11
TOM1-210	ENST00000449058	HS6ST2	Q96MM7	605 aa		15.72	■□□□□ 0.11
TOM1-210	ENST00000449058	DEPDC7	Q96QD5	511 aa		15.72	■□□□□ 0.11
TOM1-210	ENST00000449058	STAC	Q99469	402 aa		15.72	■□□□□ 0.11
TOM1-210	ENST00000449058	TIMP4	Q99727	224 aa		15.72	■□□□□ 0.11
TOM1-210	ENST00000449058	ZFYVE21	Q9BQ24	234 aa		15.72	■□□□□ 0.11
TOM1-210	ENST00000449058	C20orf141	Q9NUB4	165 aa		15.72	■□□□□ 0.11
TOM1-210	ENST00000449058	FBXO34	Q9NWN3	711 aa		15.72	■□□□□ 0.11
TOM1-210	ENST00000449058	HMX3	A6NHT5	357 aa		15.72	■□□□□ 0.11
TOM1-210	ENST00000449058	LRRC72	A6NJI9	287 aa		15.72	■□□□□ 0.11
TOM1-210	ENST00000449058	FGF17	O60258	216 aa		15.72	■□□□□ 0.11
TOM1-210	ENST00000449058	RASGRP1	O95267	797 aa		15.72	■□□□□ 0.11
TOM1-210	ENST00000449058	GKN3P	P0CG01	181 aa		15.72	■□□□□ 0.11
TOM1-210	ENST00000449058	FUT1	P19526	365 aa		15.72	■□□□□ 0.11
TOM1-210	ENST00000449058	SSTR4	P31391	388 aa		15.72	■□□□□ 0.11
TOM1-210	ENST00000449058	PBX2	P40425	430 aa		15.72	■□□□□ 0.11
TOM1-210	ENST00000449058	RNF144A	P50876	292 aa	Predicted RBP	15.72	■□□□□ 0.11
TOM1-210	ENST00000449058	INSL4	Q14641	139 aa		15.72	■□□□□ 0.11
TOM1-210	ENST00000449058	ZCCHC12	Q6PEW1	402 aa		15.72	■□□□□ 0.11
TOM1-210	ENST00000449058	CNIH2	Q6PI25	160 aa		15.72	■□□□□ 0.11
TOM1-210	ENST00000449058	MEPCE	Q7L2J0	689 aa	Known RBP	15.72	■□□□□ 0.11
TOM1-210	ENST00000449058	PRSS41	Q7RTY9	318 aa		15.72	■□□□□ 0.11
TOM1-210	ENST00000449058	LSR	Q86X29	649 aa	Predicted RBP	15.72	■□□□□ 0.11
TOM1-210	ENST00000449058	TMEFF1	Q8IYR6	380 aa		15.72	■□□□□ 0.11
TOM1-210	ENST00000449058	SHISA5	Q8N114	240 aa		15.72	■□□□□ 0.11
TOM1-210	ENST00000449058	VWA5B2	Q8N398	1253 aa		15.72	■□□□□ 0.11
TOM1-210	ENST00000449058	LNX2	Q8N448	690 aa		15.72	■□□□□ 0.11
TOM1-210	ENST00000449058		Q8N9G6	341 aa	Predicted RBP	15.72	■□□□□ 0.11
TOM1-210	ENST00000449058	TMEM52	Q8NDY8	209 aa		15.72	■□□□□ 0.11
TOM1-210	ENST00000449058	OR51G2	Q8NGK0	314 aa		15.72	■□□□□ 0.11
TOM1-210	ENST00000449058	OR10G6	Q8NH81	332 aa		15.72	■□□□□ 0.11
TOM1-210	ENST00000449058	PFN4	Q8NHR9	129 aa		15.72	■□□□□ 0.11
TOM1-210	ENST00000449058	DOK4	Q8TEW6	326 aa		15.72	■□□□□ 0.11
TOM1-210	ENST00000449058	RSC1A1	Q92681	617 aa		15.72	■□□□□ 0.11
TOM1-210	ENST00000449058	CD180	Q99467	661 aa		15.72	■□□□□ 0.11
TOM1-210	ENST00000449058	PBX4	Q9BYU1	374 aa		15.72	■□□□□ 0.11
TOM1-210	ENST00000449058	ENKD1	Q9H0I2	346 aa		15.72	■□□□□ 0.11
TOM1-210	ENST00000449058	TP63	Q9H3D4	680 aa	Predicted RBP	15.72	■□□□□ 0.11
TOM1-210	ENST00000449058	ISG20L2	Q9H9L3	353 aa	Known RBP	15.72	■□□□□ 0.11
TOM1-210	ENST00000449058	CD93	Q9NPY3	652 aa		15.72	■□□□□ 0.11
TOM1-210	ENST00000449058	NDRG2	Q9UN36	371 aa	Known RBP	15.72	■□□□□ 0.11
TOM1-210	ENST00000449058	NCKAP1	Q9Y2A7	1128 aa		15.72	■□□□□ 0.11
TOM1-210	ENST00000449058	CCDC182	A6NF36	153 aa		15.71	■□□□□ 0.11
TOM1-210	ENST00000449058		B4DXG7	233 aa		15.71	■□□□□ 0.11
TOM1-210	ENST00000449058		H0YGG7	62 aa		15.71	■□□□□ 0.11
TOM1-210	ENST00000449058	CYR61	O00622	381 aa		15.71	■□□□□ 0.11
TOM1-210	ENST00000449058	PEX12	O00623	359 aa		15.71	■□□□□ 0.11
TOM1-210	ENST00000449058	RGS13	O14921	159 aa		15.71	■□□□□ 0.11
TOM1-210	ENST00000449058	HCN1	O60741	890 aa		15.71	■□□□□ 0.11
TOM1-210	ENST00000449058	HPGDS	O60760	199 aa		15.71	■□□□□ 0.11
TOM1-210	ENST00000449058	LDB3	O75112	727 aa		15.71	■□□□□ 0.11
TOM1-210	ENST00000449058	EGF	P01133	1207 aa		15.71	■□□□□ 0.11
TOM1-210	ENST00000449058	CFL1	P23528	166 aa	Known RBP	15.71	■□□□□ 0.11
TOM1-210	ENST00000449058	PTBP1	P26599	531 aa	Known RBP eCLIP	15.71	■□□□□ 0.11
TOM1-210	ENST00000449058	APEX1	P27695	318 aa	Known RBP	15.71	■□□□□ 0.11
TOM1-210	ENST00000449058	EVX1	P49640	407 aa		15.71	■□□□□ 0.11
TOM1-210	ENST00000449058	ARF3	P61204	181 aa	Predicted RBP	15.71	■□□□□ 0.11
TOM1-210	ENST00000449058	DAB2	P98082	770 aa		15.71	■□□□□ 0.11
TOM1-210	ENST00000449058	ACBD7	Q8N6N7	88 aa		15.71	■□□□□ 0.11
TOM1-210	ENST00000449058	OR52L1	Q8NGH7	329 aa		15.71	■□□□□ 0.11

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