RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444658.7

CCNDBP1-202, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene CCNDBP1, Length 1,479 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-202ENST00000444658 OR2Y1Q8NGV0 311 aa8.53□□□□□ -1.04
CCNDBP1-202ENST00000444658 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
CCNDBP1-202ENST00000444658 SLC7A13Q8TCU3 470 aa8.53□□□□□ -1.04
CCNDBP1-202ENST00000444658 SLC38A4Q969I6 547 aa8.53□□□□□ -1.04
CCNDBP1-202ENST00000444658 VMP1Q96GC9 406 aa8.53□□□□□ -1.04
CCNDBP1-202ENST00000444658 HRASLS5Q96KN8 279 aa8.53□□□□□ -1.04
CCNDBP1-202ENST00000444658 HS6ST2Q96MM7 605 aa8.53□□□□□ -1.04
CCNDBP1-202ENST00000444658 TSC22D3Q99576 134 aa8.53□□□□□ -1.04
CCNDBP1-202ENST00000444658 PITX2Q99697 317 aa8.53□□□□□ -1.04
CCNDBP1-202ENST00000444658 APOL4Q9BPW4 351 aa8.53□□□□□ -1.04
CCNDBP1-202ENST00000444658 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
CCNDBP1-202ENST00000444658 WFDC6Q9BQY6 131 aa8.53□□□□□ -1.04
CCNDBP1-202ENST00000444658 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
CCNDBP1-202ENST00000444658 ULBP3Q9BZM4 244 aa8.53□□□□□ -1.04
CCNDBP1-202ENST00000444658 TRIM2Q9C040 744 aa8.53□□□□□ -1.04
CCNDBP1-202ENST00000444658 WWTR1Q9GZV5 400 aa8.53□□□□□ -1.04
CCNDBP1-202ENST00000444658 QRSL1Q9H0R6 528 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
CCNDBP1-202ENST00000444658 PARD6AQ9NPB6 346 aa8.53□□□□□ -1.04
CCNDBP1-202ENST00000444658 KRT84Q9NSB2 600 aa8.53□□□□□ -1.04
CCNDBP1-202ENST00000444658 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
CCNDBP1-202ENST00000444658 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
CCNDBP1-202ENST00000444658 SERINC4A6NH21 518 aa8.52□□□□□ -1.05
CCNDBP1-202ENST00000444658 TSPAN2O60636 221 aa8.52□□□□□ -1.05
CCNDBP1-202ENST00000444658 DLGAP3O95886 979 aa8.52□□□□□ -1.05
CCNDBP1-202ENST00000444658 GASTP01350 101 aa8.52□□□□□ -1.05
CCNDBP1-202ENST00000444658 ATP6V1B1P15313 513 aa8.52□□□□□ -1.05
CCNDBP1-202ENST00000444658 ZNF28P17035 718 aa8.52□□□□□ -1.05
CCNDBP1-202ENST00000444658 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
CCNDBP1-202ENST00000444658 GSTM3P21266 225 aa8.52□□□□□ -1.05
CCNDBP1-202ENST00000444658 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
CCNDBP1-202ENST00000444658 CRHBPP24387 322 aa8.52□□□□□ -1.05
CCNDBP1-202ENST00000444658 YAP1P46937 504 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
CCNDBP1-202ENST00000444658 NRG3P56975 720 aa8.52□□□□□ -1.05
CCNDBP1-202ENST00000444658 NUP107P57740 925 aa8.52□□□□□ -1.05
CCNDBP1-202ENST00000444658 RGS8P57771 180 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
CCNDBP1-202ENST00000444658 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
CCNDBP1-202ENST00000444658 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
CCNDBP1-202ENST00000444658 SSPNQ14714 243 aa8.52□□□□□ -1.05
CCNDBP1-202ENST00000444658 NCF4Q15080 339 aa8.52□□□□□ -1.05
CCNDBP1-202ENST00000444658 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
CCNDBP1-202ENST00000444658 ZBED5Q49AG3 693 aa8.52□□□□□ -1.05
CCNDBP1-202ENST00000444658 ENTPD8Q5MY95 495 aa8.52□□□□□ -1.05
CCNDBP1-202ENST00000444658 C6orf141Q5SZD1 244 aa8.52□□□□□ -1.05
CCNDBP1-202ENST00000444658 MRPL2Q5T653 305 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
CCNDBP1-202ENST00000444658 LCN10Q6JVE6 187 aa8.52□□□□□ -1.05
CCNDBP1-202ENST00000444658 ZNF773Q6PK81 442 aa8.52□□□□□ -1.05
CCNDBP1-202ENST00000444658 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
CCNDBP1-202ENST00000444658 HSDL2Q6YN16 418 aa8.52□□□□□ -1.05
CCNDBP1-202ENST00000444658 DEF8Q6ZN54 512 aa8.52□□□□□ -1.05
CCNDBP1-202ENST00000444658 C9orf40Q8IXQ3 194 aa8.52□□□□□ -1.05
CCNDBP1-202ENST00000444658 TAGAPQ8N103 731 aa8.52□□□□□ -1.05
CCNDBP1-202ENST00000444658 SLC34A3Q8N130 599 aa8.52□□□□□ -1.05
CCNDBP1-202ENST00000444658 SLC5A8Q8N695 610 aa8.52□□□□□ -1.05
CCNDBP1-202ENST00000444658 FAM71CQ8NEG0 241 aa8.52□□□□□ -1.05
CCNDBP1-202ENST00000444658 M1APQ8TC57 530 aa8.52□□□□□ -1.05
CCNDBP1-202ENST00000444658 DOK4Q8TEW6 326 aa8.52□□□□□ -1.05
CCNDBP1-202ENST00000444658 MR1Q95460 341 aa8.52□□□□□ -1.05
CCNDBP1-202ENST00000444658 MCHR1Q99705 422 aa8.52□□□□□ -1.05
CCNDBP1-202ENST00000444658 BARD1Q99728 777 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
CCNDBP1-202ENST00000444658 CRB3Q9BUF7 120 aa8.52□□□□□ -1.05
CCNDBP1-202ENST00000444658 GPR87Q9BY21 358 aa8.52□□□□□ -1.05
CCNDBP1-202ENST00000444658 ZNF700Q9H0M5 742 aa8.52□□□□□ -1.05
CCNDBP1-202ENST00000444658 NXF5Q9H1B4 397 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
CCNDBP1-202ENST00000444658 VCX3AQ9NNX9 186 aa8.52□□□□□ -1.05
CCNDBP1-202ENST00000444658 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
CCNDBP1-202ENST00000444658 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa8.52□□□□□ -1.05
CCNDBP1-202ENST00000444658 RLIMQ9NVW2 624 aa8.52□□□□□ -1.05
CCNDBP1-202ENST00000444658 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa8.52□□□□□ -1.05
CCNDBP1-202ENST00000444658 FRYLO94915 3013 aa8.52□□□□□ -1.05
CCNDBP1-202ENST00000444658 WDFY4Q6ZS81 3184 aa8.52□□□□□ -1.05
CCNDBP1-202ENST00000444658 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa8.51□□□□□ -1.05
CCNDBP1-202ENST00000444658 TRAPPC13A5PLN9 417 aa8.51□□□□□ -1.05
CCNDBP1-202ENST00000444658 OR6C70A6NIJ9 312 aa8.51□□□□□ -1.05
CCNDBP1-202ENST00000444658 A8MUA0 341 aa8.51□□□□□ -1.05
CCNDBP1-202ENST00000444658 ALG1L2C9J202 215 aa8.51□□□□□ -1.05
CCNDBP1-202ENST00000444658 M0R3H8 397 aa8.51□□□□□ -1.05
CCNDBP1-202ENST00000444658 PEX12O00623 359 aa8.51□□□□□ -1.05
CCNDBP1-202ENST00000444658 BCKDKO14874 412 aa8.51□□□□□ -1.05
CCNDBP1-202ENST00000444658 CSO75390 466 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
CCNDBP1-202ENST00000444658 ZFAND5O76080 213 aa8.51□□□□□ -1.05
CCNDBP1-202ENST00000444658 STK17BO94768 372 aa8.51□□□□□ -1.05
CCNDBP1-202ENST00000444658 CLIC3O95833 236 aa8.51□□□□□ -1.05
CCNDBP1-202ENST00000444658 IGF2P01344 180 aa8.51□□□□□ -1.05
CCNDBP1-202ENST00000444658 JMJD7P0C870 316 aa8.51□□□□□ -1.05
CCNDBP1-202ENST00000444658 ICAM2P13598 275 aa8.51□□□□□ -1.05
CCNDBP1-202ENST00000444658 MMP11P24347 488 aa8.51□□□□□ -1.05
CCNDBP1-202ENST00000444658 KRT20P35900 424 aa8.51□□□□□ -1.05
CCNDBP1-202ENST00000444658 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
CCNDBP1-202ENST00000444658 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
CCNDBP1-202ENST00000444658 TAS2R41P59536 307 aa8.51□□□□□ -1.05
CCNDBP1-202ENST00000444658 TUBA3CQ13748 450 aa8.51□□□□□ -1.05
CCNDBP1-202ENST00000444658 EFR3AQ14156 821 aa8.51□□□□□ -1.05
CCNDBP1-202ENST00000444658 GANABQ14697 944 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
CCNDBP1-202ENST00000444658 EXT1Q16394 746 aa8.51□□□□□ -1.05
CCNDBP1-202ENST00000444658 CNPY1Q3B7I2 92 aa8.51□□□□□ -1.05
CCNDBP1-202ENST00000444658 PDZK1Q5T2W1 519 aa8.51□□□□□ -1.05
CCNDBP1-202ENST00000444658 FNDC7Q5VTL7 733 aa8.51□□□□□ -1.05
CCNDBP1-202ENST00000444658 BROXQ5VW32 411 aa8.51□□□□□ -1.05
CCNDBP1-202ENST00000444658 PODNL1Q6PEZ8 512 aa8.51□□□□□ -1.05
CCNDBP1-202ENST00000444658 FAM198BQ6UWH4 519 aa8.51□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.9 ms