RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435532.7

NEDD4-202, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 4, E3 ubiquitin protein ligase, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NEDD4, Length 5,869 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4-202ENST00000435532 ATG5Q9H1Y0 275 aa14.64□□□□□ -0.07
NEDD4-202ENST00000435532 DPAGT1Q9H3H5 408 aa14.64□□□□□ -0.07
NEDD4-202ENST00000435532 NELFAQ9H3P2 528 aa14.64□□□□□ -0.07
NEDD4-202ENST00000435532 POLHQ9Y253 713 aa14.64□□□□□ -0.07
NEDD4-202ENST00000435532 CMAHPQ9Y471 501 aa14.64□□□□□ -0.07
NEDD4-202ENST00000435532 NPIPA5A0A0B4J1W7 369 aa14.64□□□□□ -0.07
NEDD4-202ENST00000435532 NPIPA7E9PJI5 369 aa14.64□□□□□ -0.07
NEDD4-202ENST00000435532 GPR39O43194 453 aa14.64□□□□□ -0.07
NEDD4-202ENST00000435532 NPIPA8P0DM63 369 aa14.64□□□□□ -0.07
NEDD4-202ENST00000435532 ZXDBP98169 803 aa14.64□□□□□ -0.07
NEDD4-202ENST00000435532 NKAIN1Q4KMZ8 207 aa14.64□□□□□ -0.07
NEDD4-202ENST00000435532 RFLNAQ6ZTI6 216 aa14.64□□□□□ -0.07
NEDD4-202ENST00000435532 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP14.64□□□□□ -0.07
NEDD4-202ENST00000435532 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
NEDD4-202ENST00000435532 OR5D16Q8NGK9 328 aa14.64□□□□□ -0.07
NEDD4-202ENST00000435532 ULBP2Q9BZM5 246 aa14.64□□□□□ -0.07
NEDD4-202ENST00000435532 CDCP1Q9H5V8 836 aa14.64□□□□□ -0.07
NEDD4-202ENST00000435532 PLEK2Q9NYT0 353 aa14.64□□□□□ -0.07
NEDD4-202ENST00000435532 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
NEDD4-202ENST00000435532 ARGFXA6NJG6 315 aa14.64□□□□□ -0.07
NEDD4-202ENST00000435532 PRRG2O14669 202 aa14.64□□□□□ -0.07
NEDD4-202ENST00000435532 ITGB2P05107 769 aa14.64□□□□□ -0.07
NEDD4-202ENST00000435532 SEMA3BQ13214 749 aa14.64□□□□□ -0.07
NEDD4-202ENST00000435532 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
NEDD4-202ENST00000435532 TUBA3EQ6PEY2 450 aa14.64□□□□□ -0.07
NEDD4-202ENST00000435532 FOLH1BQ9HBA9 442 aa14.64□□□□□ -0.07
NEDD4-202ENST00000435532 LYRM4Q9HD34 91 aa14.64□□□□□ -0.07
NEDD4-202ENST00000435532 UGT2B10P36537 528 aa14.64□□□□□ -0.07
NEDD4-202ENST00000435532 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
NEDD4-202ENST00000435532 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
NEDD4-202ENST00000435532 LRR1Q96L50 414 aa14.64□□□□□ -0.07
NEDD4-202ENST00000435532 SAMD8Q96LT4 415 aa14.64□□□□□ -0.07
NEDD4-202ENST00000435532 TAF1P21675 1872 aa14.64□□□□□ -0.07
NEDD4-202ENST00000435532 SH3D21A4FU49 640 aa14.64□□□□□ -0.07
NEDD4-202ENST00000435532 SCGB1D2O95969 90 aa14.64□□□□□ -0.07
NEDD4-202ENST00000435532 PLATP00750 562 aa14.64□□□□□ -0.07
NEDD4-202ENST00000435532 FUT4P22083 530 aa14.64□□□□□ -0.07
NEDD4-202ENST00000435532 FAM205BPQ63HN1 556 aa14.64□□□□□ -0.07
NEDD4-202ENST00000435532 LCN8Q6JVE9 175 aa14.64□□□□□ -0.07
NEDD4-202ENST00000435532 CEACAM19Q7Z692 300 aa14.64□□□□□ -0.07
NEDD4-202ENST00000435532 ZNF584Q8IVC4 421 aa14.64□□□□□ -0.07
NEDD4-202ENST00000435532 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa14.64□□□□□ -0.07
NEDD4-202ENST00000435532 MOCOSQ96EN8 888 aa14.64□□□□□ -0.07
NEDD4-202ENST00000435532 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
NEDD4-202ENST00000435532 ABCA3Q99758 1704 aa14.63□□□□□ -0.07
NEDD4-202ENST00000435532 HCRTR1O43613 425 aa14.63□□□□□ -0.07
NEDD4-202ENST00000435532 TPOP07202 933 aa14.63□□□□□ -0.07
NEDD4-202ENST00000435532 DPP4P27487 766 aa14.63□□□□□ -0.07
NEDD4-202ENST00000435532 GNRHRP30968 328 aa14.63□□□□□ -0.07
NEDD4-202ENST00000435532 PYCR1P32322 319 aa14.63□□□□□ -0.07
NEDD4-202ENST00000435532 GPR3P46089 330 aa14.63□□□□□ -0.07
NEDD4-202ENST00000435532 MICAQ29983 383 aa14.63□□□□□ -0.07
NEDD4-202ENST00000435532 ZBED5Q49AG3 693 aa14.63□□□□□ -0.07
NEDD4-202ENST00000435532 ZNF773Q6PK81 442 aa14.63□□□□□ -0.07
NEDD4-202ENST00000435532 SNX29P2Q8IUI4 249 aa14.63□□□□□ -0.07
NEDD4-202ENST00000435532 FCAMRQ8WWV6 532 aa14.63□□□□□ -0.07
NEDD4-202ENST00000435532 MS4A8Q9BY19 250 aa14.63□□□□□ -0.07
NEDD4-202ENST00000435532 FARSAQ9Y285 508 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
NEDD4-202ENST00000435532 M0R3H8 397 aa14.63□□□□□ -0.07
NEDD4-202ENST00000435532 AHCYL1O43865 530 aa14.63□□□□□ -0.07
NEDD4-202ENST00000435532 EIF1BO60739 113 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
NEDD4-202ENST00000435532 HEXAP06865 529 aa14.63□□□□□ -0.07
NEDD4-202ENST00000435532 POU2F2P09086 479 aa14.63□□□□□ -0.07
NEDD4-202ENST00000435532 CHRNB4P30926 498 aa14.63□□□□□ -0.07
NEDD4-202ENST00000435532 CPOXP36551 454 aa14.63□□□□□ -0.07
NEDD4-202ENST00000435532 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
NEDD4-202ENST00000435532 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa14.63□□□□□ -0.07
NEDD4-202ENST00000435532 PLBD1Q6P4A8 553 aa14.63□□□□□ -0.07
NEDD4-202ENST00000435532 TSSK4Q6SA08 328 aa14.63□□□□□ -0.07
NEDD4-202ENST00000435532 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa14.63□□□□□ -0.07
NEDD4-202ENST00000435532 MS4A15Q8N5U1 240 aa14.63□□□□□ -0.07
NEDD4-202ENST00000435532 AGAP4Q96P64 663 aa14.63□□□□□ -0.07
NEDD4-202ENST00000435532 MEGF11A6BM72 1044 aa14.63□□□□□ -0.07
NEDD4-202ENST00000435532 LRRN3E7EW58 273 aa14.63□□□□□ -0.07
NEDD4-202ENST00000435532 ENPP1P22413 925 aa14.63□□□□□ -0.07
NEDD4-202ENST00000435532 TMEM196Q5HYL7 178 aa14.63□□□□□ -0.07
NEDD4-202ENST00000435532 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
NEDD4-202ENST00000435532 FNDC8Q8TC99 324 aa14.63□□□□□ -0.07
NEDD4-202ENST00000435532 GKN3PP0CG01 181 aa14.63□□□□□ -0.07
NEDD4-202ENST00000435532 TMEM225BP0DP42 221 aa14.63□□□□□ -0.07
NEDD4-202ENST00000435532 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
NEDD4-202ENST00000435532 PGBD2Q6P3X8 592 aa14.63□□□□□ -0.07
NEDD4-202ENST00000435532 ZNF675Q8TD23 568 aa14.63□□□□□ -0.07
NEDD4-202ENST00000435532 KLF13Q9Y2Y9 288 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
NEDD4-202ENST00000435532 C12orf71A8MTZ7 269 aa14.63□□□□□ -0.07
NEDD4-202ENST00000435532 M0R129 80 aa14.63□□□□□ -0.07
NEDD4-202ENST00000435532 CELP19835 753 aa14.63□□□□□ -0.07
NEDD4-202ENST00000435532 CHRNEQ04844 493 aa14.63□□□□□ -0.07
NEDD4-202ENST00000435532 OR5AK2Q8NH90 309 aa14.63□□□□□ -0.07
NEDD4-202ENST00000435532 TAAR9Q96RI9 348 aa14.63□□□□□ -0.07
NEDD4-202ENST00000435532 MPLP40238 635 aa14.62□□□□□ -0.07
NEDD4-202ENST00000435532 RAB11BQ15907 218 aa14.62□□□□□ -0.07
NEDD4-202ENST00000435532 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
NEDD4-202ENST00000435532 PRAMEF20Q5VT98 475 aa14.62□□□□□ -0.07
NEDD4-202ENST00000435532 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa14.62□□□□□ -0.07
NEDD4-202ENST00000435532 ZNF221Q9UK13 617 aa14.62□□□□□ -0.07
NEDD4-202ENST00000435532 A0A1B0GVC2 190 aa14.62□□□□□ -0.07
NEDD4-202ENST00000435532 EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 151 aa14.62□□□□□ -0.07
NEDD4-202ENST00000435532 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
NEDD4-202ENST00000435532 RBMXP38159 391 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.2 ms