RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425695.5

HTATSF1-202, Transcript of HIV-1 Tat specific factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene HTATSF1, Length 885 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1-202ENST00000425695 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP22.63■■□□□ 1.21
HTATSF1-202ENST00000425695 KLHL26Q53HC5 615 aa22.63■■□□□ 1.21
HTATSF1-202ENST00000425695 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP22.63■■□□□ 1.21
HTATSF1-202ENST00000425695 TNIP2Q8NFZ5 429 aa22.63■■□□□ 1.21
HTATSF1-202ENST00000425695 LILRB4Q8NHJ6 448 aa22.63■■□□□ 1.21
HTATSF1-202ENST00000425695 RFWD2Q8NHY2 731 aa22.63■■□□□ 1.21
HTATSF1-202ENST00000425695 KLHDC3Q9BQ90 382 aa22.63■■□□□ 1.21
HTATSF1-202ENST00000425695 TUBA1CQ9BQE3 449 aa22.63■■□□□ 1.21
HTATSF1-202ENST00000425695 NPHS2Q9NP85 383 aa22.63■■□□□ 1.21
HTATSF1-202ENST00000425695 SLC6A13Q9NSD5 602 aa22.63■■□□□ 1.21
HTATSF1-202ENST00000425695 ZNF337Q9Y3M9 751 aa22.63■■□□□ 1.21
HTATSF1-202ENST00000425695 OR2M5A3KFT3 312 aa22.62■■□□□ 1.21
HTATSF1-202ENST00000425695 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
HTATSF1-202ENST00000425695 OIP5O43482 229 aa22.62■■□□□ 1.21
HTATSF1-202ENST00000425695 HCRTR2O43614 444 aa22.62■■□□□ 1.21
HTATSF1-202ENST00000425695 STX11O75558 287 aa22.62■■□□□ 1.21
HTATSF1-202ENST00000425695 TOXO94900 526 aa22.62■■□□□ 1.21
HTATSF1-202ENST00000425695 ANP32DO95626 131 aa22.62■■□□□ 1.21
HTATSF1-202ENST00000425695 AK1P00568 194 aa22.62■■□□□ 1.21
HTATSF1-202ENST00000425695 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
HTATSF1-202ENST00000425695 MSX1P28360 303 aa22.62■■□□□ 1.21
HTATSF1-202ENST00000425695 RCAN2Q14206 197 aa22.62■■□□□ 1.21
HTATSF1-202ENST00000425695 HSP90B2PQ58FF3 399 aa22.62■■□□□ 1.21
HTATSF1-202ENST00000425695 RIPPLY2Q5TAB7 128 aa22.62■■□□□ 1.21
HTATSF1-202ENST00000425695 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa22.62■■□□□ 1.21
HTATSF1-202ENST00000425695 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa22.62■■□□□ 1.21
HTATSF1-202ENST00000425695 PLXDC2Q6UX71 529 aa22.62■■□□□ 1.21
HTATSF1-202ENST00000425695 MISPQ8IVT2 679 aa22.62■■□□□ 1.21
HTATSF1-202ENST00000425695 UBQLNLQ8IYU4 475 aa22.62■■□□□ 1.21
HTATSF1-202ENST00000425695 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa22.62■■□□□ 1.21
HTATSF1-202ENST00000425695 ITCHQ96J02 903 aa22.62■■□□□ 1.21
HTATSF1-202ENST00000425695 RMND5AQ9H871 391 aa22.62■■□□□ 1.21
HTATSF1-202ENST00000425695 HHATLQ9HCP6 504 aa22.62■■□□□ 1.21
HTATSF1-202ENST00000425695 CARD8Q9Y2G2 431 aa22.62■■□□□ 1.21
HTATSF1-202ENST00000425695 NPIPB9F8W1W9 429 aa22.61■■□□□ 1.21
HTATSF1-202ENST00000425695 H3BML4 177 aa22.61■■□□□ 1.21
HTATSF1-202ENST00000425695 H3BNH8 94 aa22.61■■□□□ 1.21
HTATSF1-202ENST00000425695 AGR2O95994 175 aa22.61■■□□□ 1.21
HTATSF1-202ENST00000425695 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
HTATSF1-202ENST00000425695 CLDN18P56856 261 aa22.61■■□□□ 1.21
HTATSF1-202ENST00000425695 ZNF117Q03924 483 aa22.61■■□□□ 1.21
HTATSF1-202ENST00000425695 NDUFAF6Q330K2 333 aa22.61■■□□□ 1.21
HTATSF1-202ENST00000425695 COX20Q5RI15 118 aa22.61■■□□□ 1.21
HTATSF1-202ENST00000425695 C6orf10Q5SRN2 563 aa22.61■■□□□ 1.21
HTATSF1-202ENST00000425695 PDZK1Q5T2W1 519 aa22.61■■□□□ 1.21
HTATSF1-202ENST00000425695 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa22.61■■□□□ 1.21
HTATSF1-202ENST00000425695 LACC1Q8IV20 430 aa22.61■■□□□ 1.21
HTATSF1-202ENST00000425695 LIX1LQ8IVB5 337 aa22.61■■□□□ 1.21
HTATSF1-202ENST00000425695 ZPLD1Q8TCW7 415 aa22.61■■□□□ 1.21
HTATSF1-202ENST00000425695 ROPN1LQ96C74 230 aa22.61■■□□□ 1.21
HTATSF1-202ENST00000425695 PIGQQ9BRB3 760 aa22.61■■□□□ 1.21
HTATSF1-202ENST00000425695 CHST11Q9NPF2 352 aa22.61■■□□□ 1.21
HTATSF1-202ENST00000425695 DTNAQ9Y4J8 743 aa22.61■■□□□ 1.21
HTATSF1-202ENST00000425695 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa22.6■■□□□ 1.21
HTATSF1-202ENST00000425695 HMGN4O00479 90 aa22.6■■□□□ 1.21
HTATSF1-202ENST00000425695 TNFRSF21O75509 655 aa22.6■■□□□ 1.21
HTATSF1-202ENST00000425695 PEPDP12955 493 aa22.6■■□□□ 1.21
HTATSF1-202ENST00000425695 ZNF708P17019 499 aa22.6■■□□□ 1.21
HTATSF1-202ENST00000425695 FUT5Q11128 374 aa22.6■■□□□ 1.21
HTATSF1-202ENST00000425695 GLYR1Q49A26 553 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
HTATSF1-202ENST00000425695 GTDC1Q4AE62 458 aa22.6■■□□□ 1.21
HTATSF1-202ENST00000425695 GPAT3Q53EU6 434 aa22.6■■□□□ 1.21
HTATSF1-202ENST00000425695 SLC2A7Q6PXP3 512 aa22.6■■□□□ 1.21
HTATSF1-202ENST00000425695 CBLN3Q6UW01 205 aa22.6■■□□□ 1.21
HTATSF1-202ENST00000425695 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
HTATSF1-202ENST00000425695 SMPDL3BQ92485 455 aa22.6■■□□□ 1.21
HTATSF1-202ENST00000425695 NPAS1Q99742 590 aa22.6■■□□□ 1.21
HTATSF1-202ENST00000425695 KCNJ16Q9NPI9 418 aa22.6■■□□□ 1.21
HTATSF1-202ENST00000425695 CCDC167Q9P0B6 97 aa22.6■■□□□ 1.21
HTATSF1-202ENST00000425695 KCNE5Q9UJ90 142 aa22.6■■□□□ 1.21
HTATSF1-202ENST00000425695 CACNA1DQ01668 2161 aa22.59■■□□□ 1.21
HTATSF1-202ENST00000425695 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa22.59■■□□□ 1.21
HTATSF1-202ENST00000425695 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa22.59■■□□□ 1.21
HTATSF1-202ENST00000425695 CD8B2A6NJW9 211 aa22.59■■□□□ 1.21
HTATSF1-202ENST00000425695 CLCA1A8K7I4 914 aa22.59■■□□□ 1.21
HTATSF1-202ENST00000425695 KRT75O95678 551 aa22.59■■□□□ 1.21
HTATSF1-202ENST00000425695 NUDT14O95848 222 aa22.59■■□□□ 1.21
HTATSF1-202ENST00000425695 IL2RAP01589 272 aa22.59■■□□□ 1.21
HTATSF1-202ENST00000425695 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
HTATSF1-202ENST00000425695 MRPL19P49406 292 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
HTATSF1-202ENST00000425695 ZNF41P51814 821 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
HTATSF1-202ENST00000425695 AGKQ53H12 422 aa22.59■■□□□ 1.21
HTATSF1-202ENST00000425695 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa22.59■■□□□ 1.21
HTATSF1-202ENST00000425695 HMGN2P46Q86SG4 172 aa22.59■■□□□ 1.21
HTATSF1-202ENST00000425695 FUNDC1Q8IVP5 155 aa22.59■■□□□ 1.21
HTATSF1-202ENST00000425695 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa22.59■■□□□ 1.21
HTATSF1-202ENST00000425695 NAXEQ8NCW5 288 aa22.59■■□□□ 1.21
HTATSF1-202ENST00000425695 ZFP90Q8TF47 636 aa22.59■■□□□ 1.21
HTATSF1-202ENST00000425695 NMUR2Q9GZQ4 415 aa22.59■■□□□ 1.21
HTATSF1-202ENST00000425695 ZNF350Q9GZX5 532 aa22.59■■□□□ 1.21
HTATSF1-202ENST00000425695 CALHM2Q9HA72 323 aa22.59■■□□□ 1.21
HTATSF1-202ENST00000425695 MED17Q9NVC6 651 aa22.59■■□□□ 1.21
HTATSF1-202ENST00000425695 WDR45Q9Y484 360 aa22.59■■□□□ 1.21
HTATSF1-202ENST00000425695 CELSR2Q9HCU4 2923 aa22.58■■□□□ 1.21
HTATSF1-202ENST00000425695 UNC79Q9P2D8 2635 aa22.58■■□□□ 1.21
HTATSF1-202ENST00000425695 A0A087WZY1 265 aa22.58■■□□□ 1.21
HTATSF1-202ENST00000425695 A0A0G2JND7 137 aa22.58■■□□□ 1.21
HTATSF1-202ENST00000425695 HSPB2A8KAH6 182 aa22.58■■□□□ 1.21
HTATSF1-202ENST00000425695 H0YC42 278 aa22.58■■□□□ 1.21
HTATSF1-202ENST00000425695 NR5A2O00482 541 aa22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63.2 ms