RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415409.5

HDAC8-211, Transcript of histone deacetylase 8, humanhuman

TSL 5

Gene HDAC8, Length 913 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC8-211ENST00000415409 NUP107P57740 925 aa6.13□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 ESRRGP62508 458 aa6.13□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 CSNK2BP67870 215 aa6.13□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 TUBA4AP68366 448 aa6.13□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 RPP38P78345 283 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 E2F1Q01094 437 aa6.13□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 IL5RAQ01344 420 aa6.13□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 MC2RQ01718 297 aa6.13□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 COX10Q12887 443 aa6.13□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP6.13□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 NPTX1Q15818 432 aa6.13□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 ZNF141Q15928 474 aa6.13□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 MAPK14Q16539 360 aa6.13□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 ENTPD8Q5MY95 495 aa6.13□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 PODNL1Q6PEZ8 512 aa6.13□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 ISLR2Q6UXK2 745 aa6.13□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 NPSR1Q6W5P4 371 aa6.13□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 ZNF730Q6ZMV8 503 aa6.13□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 C20orf204Q6ZNR8 217 aa6.13□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 COX15Q7KZN9 410 aa6.13□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 SLC29A4Q7RTT9 530 aa6.13□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 OVCH1Q7RTY7 1134 aa6.13□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 COMTD1Q86VU5 262 aa6.13□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 CLIP4Q8N3C7 705 aa6.13□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 ZNF614Q8N883 585 aa6.13□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 BCORP1Q8N888 145 aa6.13□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 ZNF527Q8NB42 609 aa6.13□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 OR9Q2Q8NGE9 314 aa6.13□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 PIGXQ8TBF5 258 aa6.13□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 SLC41A3Q96GZ6 507 aa6.13□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 UCN2Q96RP3 112 aa6.13□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 PITX2Q99697 317 aa6.13□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 CDC6Q99741 560 aa6.13□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 CTRCQ99895 268 aa6.13□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa6.13□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 WFDC6Q9BQY6 131 aa6.13□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 ZNF559Q9BR84 538 aa6.13□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 DGCR6LQ9BY27 220 aa6.13□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 STRADBQ9C0K7 418 aa6.13□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 ADNPQ9H2P0 1102 aa6.13□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 TMEM27Q9HBJ8 222 aa6.13□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 ZFP64Q9NPA5 681 aa6.13□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 FBXO8Q9NRD0 319 aa6.13□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 SLC22A11Q9NSA0 550 aa6.13□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 RXFP3Q9NSD7 469 aa6.13□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 RLIMQ9NVW2 624 aa6.13□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 FBXO34Q9NWN3 711 aa6.13□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 SCN3BQ9NY72 215 aa6.13□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 NDUFA13Q9P0J0 144 aa6.13□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 CTSFQ9UBX1 484 aa6.13□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa6.13□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 PCM1Q15154 2024 aa6.13□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa6.13□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 USP34Q70CQ2 3546 aa6.12□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 NPIPA5A0A0B4J1W7 369 aa6.12□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa6.12□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 TRAPPC13A5PLN9 417 aa6.12□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 SERINC4A6NH21 518 aa6.12□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 VSTM2BA6NLU5 285 aa6.12□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 IDSB3KWA1 339 aa6.12□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 C9J4A7 227 aa6.12□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 NPIPA7E9PJI5 369 aa6.12□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 FRS3O43559 492 aa6.12□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 TPST2O60704 377 aa6.12□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 SEMA7AO75326 666 aa6.12□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 ALOX12BO75342 701 aa6.12□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 TIAF1O95411 115 aa6.12□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 IL33O95760 270 aa6.12□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 IGKV1D-16P01601 117 aa6.12□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 CLPSP04118 112 aa6.12□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 IGKV3-11P04433 115 aa6.12□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 SMIM18P0DKX4 95 aa6.12□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 NPIPA8P0DM63 369 aa6.12□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 CT45A8P0DMV1 189 aa6.12□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 CT45A9P0DMV2 189 aa6.12□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 OSMP13725 252 aa6.12□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 CD59P13987 128 aa6.12□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 POU2F1P14859 743 aa6.12□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 ATP6V1B1P15313 513 aa6.12□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 HPGDP15428 266 aa6.12□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 POU1F1P28069 291 aa6.12□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 CCKBRP32239 447 aa6.12□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 GGT2P36268 569 aa6.12□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 HLCSP50747 726 aa6.12□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 CRISP1P54107 249 aa6.12□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 NR1H2P55055 460 aa6.12□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 CDC42P60953 191 aa6.12□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 ISL1P61371 349 aa6.12□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 HOXC5Q00444 222 aa6.12□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 CD47Q08722 323 aa6.12□□□□□ -1.43
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