RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366197.9

ZNF548-202, Transcript of zinc finger protein 548, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZNF548, Length 4,955 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548-202ENST00000366197 GDF1P27539 372 aa9.69□□□□□ -0.86
ZNF548-202ENST00000366197 MGAT3Q09327 533 aa9.69□□□□□ -0.86
ZNF548-202ENST00000366197 ERV3-1Q14264 604 aa9.69□□□□□ -0.86
ZNF548-202ENST00000366197 TMEM240Q5SV17 173 aa9.69□□□□□ -0.86
ZNF548-202ENST00000366197 TRIM46Q7Z4K8 759 aa9.69□□□□□ -0.86
ZNF548-202ENST00000366197 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP9.69□□□□□ -0.86
ZNF548-202ENST00000366197 PPP1R35Q8TAP8 253 aa9.69□□□□□ -0.86
ZNF548-202ENST00000366197 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa9.69□□□□□ -0.86
ZNF548-202ENST00000366197 OR4K3Q96R72 315 aa9.69□□□□□ -0.86
ZNF548-202ENST00000366197 FUNDC2Q9BWH2 189 aa9.69□□□□□ -0.86
ZNF548-202ENST00000366197 HDAC8Q9BY41 377 aa9.69□□□□□ -0.86
ZNF548-202ENST00000366197 ACTR6Q9GZN1 396 aa9.69□□□□□ -0.86
ZNF548-202ENST00000366197 DNTTIP1Q9H147 329 aa9.69□□□□□ -0.86
ZNF548-202ENST00000366197 ZNF696Q9H7X3 374 aa9.69□□□□□ -0.86
ZNF548-202ENST00000366197 ZNF160Q9HCG1 818 aa9.69□□□□□ -0.86
ZNF548-202ENST00000366197 FGF21Q9NSA1 209 aa9.69□□□□□ -0.86
ZNF548-202ENST00000366197 TAS2R8Q9NYW2 309 aa9.69□□□□□ -0.86
ZNF548-202ENST00000366197 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP9.69□□□□□ -0.86
ZNF548-202ENST00000366197 RABL2BQ9UNT1 228 aa9.69□□□□□ -0.86
ZNF548-202ENST00000366197 GMEB1Q9Y692 573 aa9.69□□□□□ -0.86
ZNF548-202ENST00000366197 TRBV11-1A0A0K0K1C0 115 aa9.69□□□□□ -0.86
ZNF548-202ENST00000366197 CD79AP11912 226 aa9.69□□□□□ -0.86
ZNF548-202ENST00000366197 HBA1P69905 142 aa9.69□□□□□ -0.86
ZNF548-202ENST00000366197 HOXC5Q00444 222 aa9.69□□□□□ -0.86
ZNF548-202ENST00000366197 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa9.69□□□□□ -0.86
ZNF548-202ENST00000366197 GTF2H4Q92759 462 aa9.69□□□□□ -0.86
ZNF548-202ENST00000366197 CHFRQ96EP1 664 aa9.69□□□□□ -0.86
ZNF548-202ENST00000366197 TREM1Q9NP99 234 aa9.69□□□□□ -0.86
ZNF548-202ENST00000366197 INIPQ9NRY2 104 aa9.69□□□□□ -0.86
ZNF548-202ENST00000366197 CDC14CA4D256 554 aa9.68□□□□□ -0.86
ZNF548-202ENST00000366197 HHLA1C9JL84 531 aa9.68□□□□□ -0.86
ZNF548-202ENST00000366197 LSM1O15116 133 aaKnown RBP9.68□□□□□ -0.86
ZNF548-202ENST00000366197 SNAPC5O75971 98 aa9.68□□□□□ -0.86
ZNF548-202ENST00000366197 ACTL6BO94805 426 aa9.68□□□□□ -0.86
ZNF548-202ENST00000366197 WNT4P56705 351 aa9.68□□□□□ -0.86
ZNF548-202ENST00000366197 EEF1A1P68104 462 aaKnown RBP9.68□□□□□ -0.86
ZNF548-202ENST00000366197 TRIM61Q5EBN2 209 aa9.68□□□□□ -0.86
ZNF548-202ENST00000366197 FAM76BQ5HYJ3 339 aa9.68□□□□□ -0.86
ZNF548-202ENST00000366197 IL20RBQ6UXL0 311 aa9.68□□□□□ -0.86
ZNF548-202ENST00000366197 WDR53Q7Z5U6 358 aaPredicted RBP9.68□□□□□ -0.86
ZNF548-202ENST00000366197 IGFN1Q86VF2 1251 aa9.68□□□□□ -0.86
ZNF548-202ENST00000366197 DTX3Q8N9I9 347 aa9.68□□□□□ -0.86
ZNF548-202ENST00000366197 TCEAL3Q969E4 200 aa9.68□□□□□ -0.86
ZNF548-202ENST00000366197 CLMPQ9H6B4 373 aa9.68□□□□□ -0.86
ZNF548-202ENST00000366197 CEP290O15078 2479 aa9.68□□□□□ -0.86
ZNF548-202ENST00000366197 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa9.68□□□□□ -0.86
ZNF548-202ENST00000366197 H3BNC9 293 aa9.68□□□□□ -0.86
ZNF548-202ENST00000366197 E2F3O00716 465 aa9.68□□□□□ -0.86
ZNF548-202ENST00000366197 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP9.68□□□□□ -0.86
ZNF548-202ENST00000366197 GCH1P30793 250 aa9.68□□□□□ -0.86
ZNF548-202ENST00000366197 CSNK1A1P48729 337 aa9.68□□□□□ -0.86
ZNF548-202ENST00000366197 SLC26A5P58743 744 aa9.68□□□□□ -0.86
ZNF548-202ENST00000366197 ACTBP60709 375 aa9.68□□□□□ -0.86
ZNF548-202ENST00000366197 ACTG1P63261 375 aa9.68□□□□□ -0.86
ZNF548-202ENST00000366197 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP9.68□□□□□ -0.86
ZNF548-202ENST00000366197 DCAF12Q5T6F0 453 aa9.68□□□□□ -0.86
ZNF548-202ENST00000366197 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa9.68□□□□□ -0.86
ZNF548-202ENST00000366197 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP9.68□□□□□ -0.86
ZNF548-202ENST00000366197 LINC01465Q8N7H1 131 aa9.68□□□□□ -0.86
ZNF548-202ENST00000366197 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP9.68□□□□□ -0.86
ZNF548-202ENST00000366197 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa9.68□□□□□ -0.86
ZNF548-202ENST00000366197 MFSD9Q8NBP5 474 aa9.68□□□□□ -0.86
ZNF548-202ENST00000366197 RCBTB1Q8NDN9 531 aa9.68□□□□□ -0.86
ZNF548-202ENST00000366197 OR9K2Q8NGE7 335 aa9.68□□□□□ -0.86
ZNF548-202ENST00000366197 GPR148Q8TDV2 347 aa9.68□□□□□ -0.86
ZNF548-202ENST00000366197 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP9.68□□□□□ -0.86
ZNF548-202ENST00000366197 OR7D2Q96RA2 312 aa9.68□□□□□ -0.86
ZNF548-202ENST00000366197 ALG8Q9BVK2 526 aa9.68□□□□□ -0.86
ZNF548-202ENST00000366197 CACNG6Q9BXT2 260 aa9.68□□□□□ -0.86
ZNF548-202ENST00000366197 GORASP2Q9H8Y8 452 aa9.68□□□□□ -0.86
ZNF548-202ENST00000366197 SPEF1Q9Y4P9 236 aa9.68□□□□□ -0.86
ZNF548-202ENST00000366197 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP9.68□□□□□ -0.86
ZNF548-202ENST00000366197 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa9.68□□□□□ -0.86
ZNF548-202ENST00000366197 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa9.68□□□□□ -0.86
ZNF548-202ENST00000366197 EFCAB7A8K855 629 aa9.68□□□□□ -0.86
ZNF548-202ENST00000366197 SIGLEC6O43699 453 aa9.68□□□□□ -0.86
ZNF548-202ENST00000366197 ACPPP15309 386 aa9.68□□□□□ -0.86
ZNF548-202ENST00000366197 UGT2B7P16662 529 aa9.68□□□□□ -0.86
ZNF548-202ENST00000366197 MSX1P28360 303 aa9.68□□□□□ -0.86
ZNF548-202ENST00000366197 UQCRC1P31930 480 aa9.68□□□□□ -0.86
ZNF548-202ENST00000366197 SGSHP51688 502 aa9.68□□□□□ -0.86
ZNF548-202ENST00000366197 RACK1P63244 317 aaKnown RBP9.68□□□□□ -0.86
ZNF548-202ENST00000366197 PTPRRQ15256 657 aa9.68□□□□□ -0.86
ZNF548-202ENST00000366197 SYPL1Q16563 259 aa9.68□□□□□ -0.86
ZNF548-202ENST00000366197 TMEM205Q6UW68 189 aa9.68□□□□□ -0.86
ZNF548-202ENST00000366197 ASRGL1Q7L266 308 aa9.68□□□□□ -0.86
ZNF548-202ENST00000366197 ADGRG5Q8IZF4 528 aa9.68□□□□□ -0.86
ZNF548-202ENST00000366197 RNF175Q8N4F7 328 aa9.68□□□□□ -0.86
ZNF548-202ENST00000366197 OR51Q1Q8NH59 317 aa9.68□□□□□ -0.86
ZNF548-202ENST00000366197 FBXO27Q8NI29 283 aa9.68□□□□□ -0.86
ZNF548-202ENST00000366197 LRRC20Q8TCA0 184 aa9.68□□□□□ -0.86
ZNF548-202ENST00000366197 SLC30A3Q99726 388 aa9.68□□□□□ -0.86
ZNF548-202ENST00000366197 ULBP3Q9BZM4 244 aa9.68□□□□□ -0.86
ZNF548-202ENST00000366197 EPHX3Q9H6B9 360 aa9.68□□□□□ -0.86
ZNF548-202ENST00000366197 EVA1AQ9H8M9 152 aa9.68□□□□□ -0.86
ZNF548-202ENST00000366197 FAM53CQ9NYF3 392 aa9.68□□□□□ -0.86
ZNF548-202ENST00000366197 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP9.68□□□□□ -0.86
ZNF548-202ENST00000366197 KCNN3Q9UGI6 736 aa9.68□□□□□ -0.86
ZNF548-202ENST00000366197 IGHEP01854 428 aa9.68□□□□□ -0.86
ZNF548-202ENST00000366197 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP9.68□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23 ms