RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000364561.1

RNU6-1277P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1277, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1277P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1277P-201ENST00000364561 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa-2.69□□□□□ -2.84
RNU6-1277P-201ENST00000364561 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa-2.69□□□□□ -2.84
RNU6-1277P-201ENST00000364561 LRRC42Q9Y546 428 aa-2.69□□□□□ -2.84
RNU6-1277P-201ENST00000364561 NUP98P52948 1817 aa-2.7□□□□□ -2.84
RNU6-1277P-201ENST00000364561 TAF1P21675 1872 aa-2.7□□□□□ -2.84
RNU6-1277P-201ENST00000364561 NPIPA5A0A0B4J1W7 369 aa-2.7□□□□□ -2.84
RNU6-1277P-201ENST00000364561 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa-2.7□□□□□ -2.84
RNU6-1277P-201ENST00000364561 C2orf81A6NN90 581 aa-2.7□□□□□ -2.84
RNU6-1277P-201ENST00000364561 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa-2.7□□□□□ -2.84
RNU6-1277P-201ENST00000364561 K7EQG2 157 aa-2.7□□□□□ -2.84
RNU6-1277P-201ENST00000364561 DNM1LO00429 736 aa-2.7□□□□□ -2.84
RNU6-1277P-201ENST00000364561 PRRG1O14668 218 aa-2.7□□□□□ -2.84
RNU6-1277P-201ENST00000364561 RASGRF2O14827 1237 aa-2.7□□□□□ -2.84
RNU6-1277P-201ENST00000364561 KMOO15229 486 aa-2.7□□□□□ -2.84
RNU6-1277P-201ENST00000364561 SHOXO15266 292 aa-2.7□□□□□ -2.84
RNU6-1277P-201ENST00000364561 SLC31A1O15431 190 aa-2.7□□□□□ -2.84
RNU6-1277P-201ENST00000364561 HCRTR1O43613 425 aa-2.7□□□□□ -2.84
RNU6-1277P-201ENST00000364561 CNTN5O94779 1100 aa-2.7□□□□□ -2.84
RNU6-1277P-201ENST00000364561 KIAA0754O94854 1291 aa-2.7□□□□□ -2.84
RNU6-1277P-201ENST00000364561 H6PDO95479 791 aa-2.7□□□□□ -2.84
RNU6-1277P-201ENST00000364561 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP-2.7□□□□□ -2.84
RNU6-1277P-201ENST00000364561 HSPA6P17066 643 aa-2.7□□□□□ -2.84
RNU6-1277P-201ENST00000364561 CD1CP29017 333 aa-2.7□□□□□ -2.84
RNU6-1277P-201ENST00000364561 CD70P32970 193 aa-2.7□□□□□ -2.84
RNU6-1277P-201ENST00000364561 PPM1AP35813 382 aa-2.7□□□□□ -2.84
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ZAP70P43403 619 aa-2.7□□□□□ -2.84
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP-2.7□□□□□ -2.84
RNU6-1277P-201ENST00000364561 NDST2P52849 883 aa-2.7□□□□□ -2.84
RNU6-1277P-201ENST00000364561 CLDN2P57739 230 aa-2.7□□□□□ -2.84
RNU6-1277P-201ENST00000364561 GPR85P60893 370 aa-2.7□□□□□ -2.84
RNU6-1277P-201ENST00000364561 DCAF7P61962 342 aa-2.7□□□□□ -2.84
RNU6-1277P-201ENST00000364561 HERVK_113P63132 956 aa-2.7□□□□□ -2.84
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ERVK-8P63133 956 aa-2.7□□□□□ -2.84
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ERVK-25P63136 954 aa-2.7□□□□□ -2.84
RNU6-1277P-201ENST00000364561 PDE1BQ01064 536 aa-2.7□□□□□ -2.84
RNU6-1277P-201ENST00000364561 AMPD2Q01433 879 aa-2.7□□□□□ -2.84
RNU6-1277P-201ENST00000364561 SLC38A11Q08AI6 406 aa-2.7□□□□□ -2.84
RNU6-1277P-201ENST00000364561 CHAF1BQ13112 559 aa-2.7□□□□□ -2.84
RNU6-1277P-201ENST00000364561 IKQ13123 557 aaPredicted RBP-2.7□□□□□ -2.84
RNU6-1277P-201ENST00000364561 GALNT3Q14435 633 aa-2.7□□□□□ -2.84
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ITIH4Q14624 930 aa-2.7□□□□□ -2.84
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ACOX1Q15067 660 aa-2.7□□□□□ -2.84
RNU6-1277P-201ENST00000364561 BSXQ3C1V8 233 aa-2.7□□□□□ -2.84
RNU6-1277P-201ENST00000364561 RUNDC3AQ59EK9 446 aa-2.7□□□□□ -2.84
RNU6-1277P-201ENST00000364561 PDZD11Q5EBL8 140 aa-2.7□□□□□ -2.84
RNU6-1277P-201ENST00000364561 OR4C11Q6IEV9 310 aa-2.7□□□□□ -2.84
RNU6-1277P-201ENST00000364561 TAF2Q6P1X5 1199 aa-2.7□□□□□ -2.84
RNU6-1277P-201ENST00000364561 AAGABQ6PD74 315 aa-2.7□□□□□ -2.84
RNU6-1277P-201ENST00000364561 TSSK4Q6SA08 328 aa-2.7□□□□□ -2.84
RNU6-1277P-201ENST00000364561 TBPL2Q6SJ96 375 aa-2.7□□□□□ -2.84
RNU6-1277P-201ENST00000364561 MOXD1Q6UVY6 613 aa-2.7□□□□□ -2.84
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ENPP7Q6UWV6 458 aa-2.7□□□□□ -2.84
RNU6-1277P-201ENST00000364561 HRCT1Q6UXD1 115 aa-2.7□□□□□ -2.84
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa-2.7□□□□□ -2.84
RNU6-1277P-201ENST00000364561 MAEAQ7L5Y9 396 aa-2.7□□□□□ -2.84
RNU6-1277P-201ENST00000364561 PAGE2Q7Z2X7 111 aa-2.7□□□□□ -2.84
RNU6-1277P-201ENST00000364561 GALNT5Q7Z7M9 940 aa-2.7□□□□□ -2.84
RNU6-1277P-201ENST00000364561 LINC00596Q86U02 117 aa-2.7□□□□□ -2.84
RNU6-1277P-201ENST00000364561 BOD1L2Q8IYS8 172 aa-2.7□□□□□ -2.84
RNU6-1277P-201ENST00000364561 MIER2Q8N344 545 aa-2.7□□□□□ -2.84
RNU6-1277P-201ENST00000364561 CADM2Q8N3J6 435 aa-2.7□□□□□ -2.84
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP-2.7□□□□□ -2.84
RNU6-1277P-201ENST00000364561 FAM71CQ8NEG0 241 aa-2.7□□□□□ -2.84
RNU6-1277P-201ENST00000364561 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP-2.7□□□□□ -2.84
RNU6-1277P-201ENST00000364561 OR52K1Q8NGK4 314 aa-2.7□□□□□ -2.84
RNU6-1277P-201ENST00000364561 M1APQ8TC57 530 aa-2.7□□□□□ -2.84
RNU6-1277P-201ENST00000364561 GDPD5Q8WTR4 605 aa-2.7□□□□□ -2.84
RNU6-1277P-201ENST00000364561 RSAD2Q8WXG1 361 aa-2.7□□□□□ -2.84
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ASB15Q8WXK1 588 aa-2.7□□□□□ -2.84
RNU6-1277P-201ENST00000364561 SHC3Q92529 594 aa-2.7□□□□□ -2.84
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP-2.7□□□□□ -2.84
RNU6-1277P-201ENST00000364561 FAM46BQ96A09 425 aa-2.7□□□□□ -2.84
RNU6-1277P-201ENST00000364561 CPNE4Q96A23 557 aaPredicted RBP-2.7□□□□□ -2.84
RNU6-1277P-201ENST00000364561 UPRTQ96BW1 309 aa-2.7□□□□□ -2.84
RNU6-1277P-201ENST00000364561 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP-2.7□□□□□ -2.84
RNU6-1277P-201ENST00000364561 SLC47A1Q96FL8 570 aa-2.7□□□□□ -2.84
RNU6-1277P-201ENST00000364561 TPD52L3Q96J77 140 aa-2.7□□□□□ -2.84
RNU6-1277P-201ENST00000364561 EPSTI1Q96J88 318 aa-2.7□□□□□ -2.84
RNU6-1277P-201ENST00000364561 FAM167AQ96KS9 214 aa-2.7□□□□□ -2.84
RNU6-1277P-201ENST00000364561 LRGUKQ96M69 825 aa-2.7□□□□□ -2.84
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP-2.7□□□□□ -2.84
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ZFP3Q96NJ6 502 aa-2.7□□□□□ -2.84
RNU6-1277P-201ENST00000364561 CAMK2N2Q96S95 79 aa-2.7□□□□□ -2.84
RNU6-1277P-201ENST00000364561 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP-2.7□□□□□ -2.84
RNU6-1277P-201ENST00000364561 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP-2.7□□□□□ -2.84
RNU6-1277P-201ENST00000364561 CCDC3Q9BQI4 270 aa-2.7□□□□□ -2.84
RNU6-1277P-201ENST00000364561 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP-2.7□□□□□ -2.84
RNU6-1277P-201ENST00000364561 MECRQ9BV79 373 aa-2.7□□□□□ -2.84
RNU6-1277P-201ENST00000364561 EDEM2Q9BV94 578 aa-2.7□□□□□ -2.84
RNU6-1277P-201ENST00000364561 Q9H3A6 140 aa-2.7□□□□□ -2.84
RNU6-1277P-201ENST00000364561 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa-2.7□□□□□ -2.84
RNU6-1277P-201ENST00000364561 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP-2.7□□□□□ -2.84
RNU6-1277P-201ENST00000364561 CWH43Q9H720 699 aa-2.7□□□□□ -2.84
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ZMAT4Q9H898 229 aa-2.7□□□□□ -2.84
RNU6-1277P-201ENST00000364561 KCNK9Q9NPC2 374 aa-2.7□□□□□ -2.84
RNU6-1277P-201ENST00000364561 HELLSQ9NRZ9 838 aa-2.7□□□□□ -2.84
RNU6-1277P-201ENST00000364561 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa-2.7□□□□□ -2.84
RNU6-1277P-201ENST00000364561 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP-2.7□□□□□ -2.84
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ASNSD1Q9NWL6 643 aa-2.7□□□□□ -2.84
RNU6-1277P-201ENST00000364561 MARCH5Q9NX47 278 aa-2.7□□□□□ -2.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.7 ms