RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000342084.8

PTPRR-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene PTPRR, Length 2,037 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRR-202ENST00000342084 RFLNBQ8N5W9 214 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 BMPERQ8N8U9 685 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 MFSD9Q8NBP5 474 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 TTLQ8NG68 377 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 OR2T33Q8NG76 320 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 OR10H4Q8NGA5 316 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 OR4M1Q8NGD0 313 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 OR13C2Q8NGS9 318 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 FANK1Q8TC84 345 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 GRHL3Q8TE85 626 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 RFKQ969G6 155 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 TIMP4Q99727 224 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 SOSTQ9BQB4 213 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 KXD1Q9BQD3 176 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 PRSS27Q9BQR3 290 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 TMEM43Q9BTV4 400 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 ALG8Q9BVK2 526 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 HDHD2Q9H0R4 259 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 OR52D1Q9H346 318 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 ADAP2Q9NPF8 381 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 ISYNA1Q9NPH2 558 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 KLHL28Q9NXS3 571 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 IL20Q9NYY1 176 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 EXTL2Q9UBQ6 330 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 DPP7Q9UHL4 492 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 FBXL4Q9UKA2 621 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 CLEC4AQ9UMR7 237 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 EXOGQ9Y2C4 368 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 MRPS2Q9Y399 296 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 CDH10Q9Y6N8 788 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 C2orf16Q68DN1 1984 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 TRANK1O15050 2925 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 EYSQ5T1H1 3165 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 TRAV27A0A087WT01 109 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 A0A0B4J203 849 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 A0A1W2PPK0 400 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 UNC119BA6NIH7 251 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 LRRC72A6NJI9 287 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 SEC14L5O43304 696 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 HCN1O60741 890 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 LDB3O75112 727 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 HLA-DPB1P04440 258 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 FAM157BP0CG42 384 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 IFI30P13284 250 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 ALAS2P22557 587 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 CPN2P22792 545 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 NOS3P29474 1203 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 INPP1P49441 399 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 HCCSP53701 268 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 RPS7P62081 194 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 PPP2CBP62714 309 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 PPP2CAP67775 309 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 EEF1A1P68104 462 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 SLC3A1Q07837 685 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 SGCGQ13326 291 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 RUNX3Q13761 415 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 TMEM31Q5JXX7 168 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 TMEM240Q5SV17 173 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 MRPL2Q5T653 305 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 ZNF425Q6IV72 752 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 CADM2Q8N3J6 435 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 CYB561A3Q8NBI2 242 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 TMEM52Q8NDY8 209 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 OR10G6Q8NH81 332 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 LCN9Q8WX39 176 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 MOAP1Q96BY2 351 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 MS4A4EQ96PG1 132 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 TIMM29Q9BSF4 260 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 OR51V1Q9H2C8 321 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 RBFOX1Q9NWB1 397 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 MCUBQ9NWR8 336 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 KCNE5Q9UJ90 142 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 POM121BA6NF01 834 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 J3QRE1 110 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 ERVH48-1M5A8F1 160 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 SCO2O43819 266 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 CTSVO60911 334 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 OR5F1O95221 314 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 YES1P07947 543 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 TRAPPC2P0DI81 140 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 TRAPPC2BP0DI82 140 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 PRKAR1AP10644 381 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 PVRP15151 417 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 IL9P15248 144 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 IFNA8P32881 189 aa6.76□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41 ms