RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318988.10

CTDNEP1-201, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-201ENST00000318988 ENPP4Q9Y6X5 453 aa25.16■■□□□ 1.62
CTDNEP1-201ENST00000318988 AKAP13Q12802 2813 aa25.15■■□□□ 1.62
CTDNEP1-201ENST00000318988 PRAMEF25A6NGN4 478 aa25.15■■□□□ 1.62
CTDNEP1-201ENST00000318988 AP3D1O14617 1153 aa25.15■■□□□ 1.62
CTDNEP1-201ENST00000318988 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
CTDNEP1-201ENST00000318988 LDLRP01130 860 aa25.15■■□□□ 1.62
CTDNEP1-201ENST00000318988 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
CTDNEP1-201ENST00000318988 ST13P50502 369 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
CTDNEP1-201ENST00000318988 CCL11P51671 97 aa25.15■■□□□ 1.62
CTDNEP1-201ENST00000318988 OC90Q02509 493 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
CTDNEP1-201ENST00000318988 MARCH3Q86UD3 253 aa25.15■■□□□ 1.62
CTDNEP1-201ENST00000318988 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
CTDNEP1-201ENST00000318988 GRAMD2AQ8IUY3 354 aa25.15■■□□□ 1.62
CTDNEP1-201ENST00000318988 MISPQ8IVT2 679 aa25.15■■□□□ 1.62
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF440Q8IYI8 595 aa25.15■■□□□ 1.62
CTDNEP1-201ENST00000318988 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
CTDNEP1-201ENST00000318988 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
CTDNEP1-201ENST00000318988 SGCZQ96LD1 299 aa25.15■■□□□ 1.62
CTDNEP1-201ENST00000318988 SECISBP2Q96T21 854 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
CTDNEP1-201ENST00000318988 NDUFAF4Q9P032 175 aa25.15■■□□□ 1.62
CTDNEP1-201ENST00000318988 FRS3O43559 492 aa25.14■■□□□ 1.62
CTDNEP1-201ENST00000318988 DNAJB5O75953 348 aa25.14■■□□□ 1.62
CTDNEP1-201ENST00000318988 CYB561P49447 251 aa25.14■■□□□ 1.62
CTDNEP1-201ENST00000318988 HLCSP50747 726 aa25.14■■□□□ 1.62
CTDNEP1-201ENST00000318988 RAPSNQ13702 412 aa25.14■■□□□ 1.62
CTDNEP1-201ENST00000318988 APOOLQ6UXV4 268 aa25.14■■□□□ 1.62
CTDNEP1-201ENST00000318988 RTL4Q6ZR62 310 aa25.14■■□□□ 1.62
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF550Q7Z398 422 aa25.14■■□□□ 1.62
CTDNEP1-201ENST00000318988 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa25.14■■□□□ 1.62
CTDNEP1-201ENST00000318988 OR6T1Q8NGN1 323 aa25.14■■□□□ 1.62
CTDNEP1-201ENST00000318988 GRHL3Q8TE85 626 aa25.14■■□□□ 1.62
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.62
CTDNEP1-201ENST00000318988 PKP2Q99959 881 aa25.14■■□□□ 1.62
CTDNEP1-201ENST00000318988 CLOCKO15516 846 aa25.13■■□□□ 1.61
CTDNEP1-201ENST00000318988 ANGPTL1O95841 491 aa25.13■■□□□ 1.61
CTDNEP1-201ENST00000318988 IFNA8P32881 189 aa25.13■■□□□ 1.61
CTDNEP1-201ENST00000318988 ISLR2Q6UXK2 745 aa25.13■■□□□ 1.61
CTDNEP1-201ENST00000318988 LINC00696Q6ZRV3 163 aa25.13■■□□□ 1.61
CTDNEP1-201ENST00000318988 LACC1Q8IV20 430 aa25.13■■□□□ 1.61
CTDNEP1-201ENST00000318988 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa25.13■■□□□ 1.61
CTDNEP1-201ENST00000318988 OR4D11Q8NGI4 311 aa25.13■■□□□ 1.61
CTDNEP1-201ENST00000318988 SLC35B4Q969S0 331 aa25.13■■□□□ 1.61
CTDNEP1-201ENST00000318988 BDH2Q9BUT1 245 aa25.13■■□□□ 1.61
CTDNEP1-201ENST00000318988 HHATLQ9HCP6 504 aa25.13■■□□□ 1.61
CTDNEP1-201ENST00000318988 SDHAF3Q9NRP4 125 aa25.13■■□□□ 1.61
CTDNEP1-201ENST00000318988 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
CTDNEP1-201ENST00000318988 DNAJB9Q9UBS3 223 aa25.13■■□□□ 1.61
CTDNEP1-201ENST00000318988 SSUH2Q9Y2M2 353 aa25.13■■□□□ 1.61
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF264O43296 627 aa25.12■■□□□ 1.61
CTDNEP1-201ENST00000318988 GKN3PP0CG01 181 aa25.12■■□□□ 1.61
CTDNEP1-201ENST00000318988 RHCEP18577 417 aa25.12■■□□□ 1.61
CTDNEP1-201ENST00000318988 YAP1P46937 504 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
CTDNEP1-201ENST00000318988 SESN3P58005 492 aa25.12■■□□□ 1.61
CTDNEP1-201ENST00000318988 SLC34A1Q06495 639 aa25.12■■□□□ 1.61
CTDNEP1-201ENST00000318988 CD226Q15762 336 aa25.12■■□□□ 1.61
CTDNEP1-201ENST00000318988 ATP6AP1Q15904 470 aa25.12■■□□□ 1.61
CTDNEP1-201ENST00000318988 FNDC7Q5VTL7 733 aa25.12■■□□□ 1.61
CTDNEP1-201ENST00000318988 SLC22A10Q63ZE4 541 aa25.12■■□□□ 1.61
CTDNEP1-201ENST00000318988 AMIGO2Q86SJ2 522 aa25.12■■□□□ 1.61
CTDNEP1-201ENST00000318988 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
CTDNEP1-201ENST00000318988 UTP23Q9BRU9 249 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
CTDNEP1-201ENST00000318988 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa25.12■■□□□ 1.61
CTDNEP1-201ENST00000318988 ANKRD10Q9NXR5 420 aa25.12■■□□□ 1.61
CTDNEP1-201ENST00000318988 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
CTDNEP1-201ENST00000318988 CDK2AP1O14519 115 aa25.12■■□□□ 1.61
CTDNEP1-201ENST00000318988 DIRAS1O95057 198 aa25.12■■□□□ 1.61
CTDNEP1-201ENST00000318988 OR2T5Q6IEZ7 315 aa25.12■■□□□ 1.61
CTDNEP1-201ENST00000318988 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
CTDNEP1-201ENST00000318988 OR2T29Q8NH02 315 aa25.12■■□□□ 1.61
CTDNEP1-201ENST00000318988 WFDC6Q9BQY6 131 aa25.12■■□□□ 1.61
CTDNEP1-201ENST00000318988 RASSF4Q9H2L5 321 aa25.12■■□□□ 1.61
CTDNEP1-201ENST00000318988 CNIH4Q9P003 139 aa25.12■■□□□ 1.61
CTDNEP1-201ENST00000318988 CARD8Q9Y2G2 431 aa25.12■■□□□ 1.61
CTDNEP1-201ENST00000318988 KCNMB2Q9Y691 235 aa25.12■■□□□ 1.61
CTDNEP1-201ENST00000318988 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
CTDNEP1-201ENST00000318988 HCRTR2O43614 444 aa25.11■■□□□ 1.61
CTDNEP1-201ENST00000318988 EIF4E2O60573 245 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
CTDNEP1-201ENST00000318988 C17orf67Q0P5P2 114 aa25.11■■□□□ 1.61
CTDNEP1-201ENST00000318988 SNTA1Q13424 505 aa25.11■■□□□ 1.61
CTDNEP1-201ENST00000318988 NDUFAF6Q330K2 333 aa25.11■■□□□ 1.61
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
CTDNEP1-201ENST00000318988 LILRA2Q8N149 483 aa25.11■■□□□ 1.61
CTDNEP1-201ENST00000318988 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
CTDNEP1-201ENST00000318988 MCHR1Q99705 422 aa25.11■■□□□ 1.61
CTDNEP1-201ENST00000318988 PIP5K1AQ99755 562 aa25.11■■□□□ 1.61
CTDNEP1-201ENST00000318988 OSBPL11Q9BXB4 747 aa25.11■■□□□ 1.61
CTDNEP1-201ENST00000318988 LAT2Q9GZY6 243 aa25.11■■□□□ 1.61
CTDNEP1-201ENST00000318988 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa25.11■■□□□ 1.61
CTDNEP1-201ENST00000318988 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
CTDNEP1-201ENST00000318988 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
CTDNEP1-201ENST00000318988 ADAMDEC1O15204 470 aa25.1■■□□□ 1.61
CTDNEP1-201ENST00000318988 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
CTDNEP1-201ENST00000318988 UQCRBP14927 111 aa25.1■■□□□ 1.61
CTDNEP1-201ENST00000318988 CASP3P42574 277 aa25.1■■□□□ 1.61
CTDNEP1-201ENST00000318988 CCR4P51679 360 aa25.1■■□□□ 1.61
CTDNEP1-201ENST00000318988 UCNP55089 124 aa25.1■■□□□ 1.61
CTDNEP1-201ENST00000318988 TAS2R41P59536 307 aa25.1■■□□□ 1.61
CTDNEP1-201ENST00000318988 HOXC5Q00444 222 aa25.1■■□□□ 1.61
CTDNEP1-201ENST00000318988 SLC30A6Q6NXT4 461 aa25.1■■□□□ 1.61
CTDNEP1-201ENST00000318988 PAQR8Q8TEZ7 354 aa25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.5 ms