RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000308394.8

CASP3-201, Transcript of caspase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CASP3, Length 2,673 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP3-201ENST00000308394 CDC6Q99741 560 aa9.97□□□□□ -0.81
CASP3-201ENST00000308394 SIAEQ9HAT2 523 aa9.97□□□□□ -0.81
CASP3-201ENST00000308394 NECTIN3Q9NQS3 549 aa9.97□□□□□ -0.81
CASP3-201ENST00000308394 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
CASP3-201ENST00000308394 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa9.97□□□□□ -0.81
CASP3-201ENST00000308394 DBTP11182 482 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
CASP3-201ENST00000308394 CAPZA2P47755 286 aa9.97□□□□□ -0.81
CASP3-201ENST00000308394 PGDP52209 483 aa9.97□□□□□ -0.81
CASP3-201ENST00000308394 RAB15P59190 212 aa9.97□□□□□ -0.81
CASP3-201ENST00000308394 CSRP2Q16527 193 aa9.97□□□□□ -0.81
CASP3-201ENST00000308394 GPAT3Q53EU6 434 aa9.97□□□□□ -0.81
CASP3-201ENST00000308394 CYBRD1Q53TN4 286 aa9.97□□□□□ -0.81
CASP3-201ENST00000308394 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa9.97□□□□□ -0.81
CASP3-201ENST00000308394 MFSD12Q6NUT3 480 aa9.97□□□□□ -0.81
CASP3-201ENST00000308394 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
CASP3-201ENST00000308394 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
CASP3-201ENST00000308394 FJX1Q86VR8 437 aa9.97□□□□□ -0.81
CASP3-201ENST00000308394 SLC43A2Q8N370 569 aa9.97□□□□□ -0.81
CASP3-201ENST00000308394 POP5Q969H6 163 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
CASP3-201ENST00000308394 TRIM63Q969Q1 353 aa9.97□□□□□ -0.81
CASP3-201ENST00000308394 EME1Q96AY2 570 aa9.97□□□□□ -0.81
CASP3-201ENST00000308394 HSH2DQ96JZ2 352 aa9.97□□□□□ -0.81
CASP3-201ENST00000308394 GPR61Q9BZJ8 451 aa9.97□□□□□ -0.81
CASP3-201ENST00000308394 CXorf21Q9HAI6 301 aa9.97□□□□□ -0.81
CASP3-201ENST00000308394 LANCL2Q9NS86 450 aa9.97□□□□□ -0.81
CASP3-201ENST00000308394 KCNE3Q9Y6H6 103 aa9.97□□□□□ -0.81
CASP3-201ENST00000308394 A0A087WV62 115 aa9.96□□□□□ -0.81
CASP3-201ENST00000308394 A0A0A6YYJ9 748 aa9.96□□□□□ -0.81
CASP3-201ENST00000308394 A0A1W2PPH5 198 aa9.96□□□□□ -0.81
CASP3-201ENST00000308394 hCG_2039718K7EN88 272 aa9.96□□□□□ -0.81
CASP3-201ENST00000308394 PGM3O95394 542 aa9.96□□□□□ -0.81
CASP3-201ENST00000308394 CCL4P13236 92 aa9.96□□□□□ -0.81
CASP3-201ENST00000308394 SOX18P35713 384 aa9.96□□□□□ -0.81
CASP3-201ENST00000308394 PDX1P52945 283 aa9.96□□□□□ -0.81
CASP3-201ENST00000308394 CRYBA2P53672 197 aa9.96□□□□□ -0.81
CASP3-201ENST00000308394 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.81
CASP3-201ENST00000308394 IL11RAQ14626 422 aa9.96□□□□□ -0.81
CASP3-201ENST00000308394 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa9.96□□□□□ -0.81
CASP3-201ENST00000308394 PRR18Q8N4B5 295 aa9.96□□□□□ -0.81
CASP3-201ENST00000308394 SLC16A11Q8NCK7 471 aa9.96□□□□□ -0.81
CASP3-201ENST00000308394 ZNF675Q8TD23 568 aa9.96□□□□□ -0.81
CASP3-201ENST00000308394 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP9.96□□□□□ -0.81
CASP3-201ENST00000308394 HSPBAP1Q96EW2 488 aa9.96□□□□□ -0.81
CASP3-201ENST00000308394 TXN2Q99757 166 aa9.96□□□□□ -0.81
CASP3-201ENST00000308394 CNPPD1Q9BV87 410 aa9.96□□□□□ -0.81
CASP3-201ENST00000308394 PARD6AQ9NPB6 346 aa9.96□□□□□ -0.81
CASP3-201ENST00000308394 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.81
CASP3-201ENST00000308394 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa9.96□□□□□ -0.81
CASP3-201ENST00000308394 STMN3Q9NZ72 180 aa9.96□□□□□ -0.81
CASP3-201ENST00000308394 PTTG2Q9NZH5 202 aa9.96□□□□□ -0.81
CASP3-201ENST00000308394 NTMQ9P121 344 aa9.96□□□□□ -0.81
CASP3-201ENST00000308394 ASH2LQ9UBL3 628 aa9.96□□□□□ -0.81
CASP3-201ENST00000308394 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.81
CASP3-201ENST00000308394 IFT52Q9Y366 437 aa9.96□□□□□ -0.81
CASP3-201ENST00000308394 ADAMTS20P59510 1910 aa9.96□□□□□ -0.81
CASP3-201ENST00000308394 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa9.96□□□□□ -0.82
CASP3-201ENST00000308394 DUXAA6NLW8 204 aa9.96□□□□□ -0.82
CASP3-201ENST00000308394 GNGT2O14610 69 aa9.96□□□□□ -0.82
CASP3-201ENST00000308394 LDLRAD4O15165 306 aa9.96□□□□□ -0.82
CASP3-201ENST00000308394 CST1P01037 141 aa9.96□□□□□ -0.82
CASP3-201ENST00000308394 LDLRP01130 860 aa9.96□□□□□ -0.82
CASP3-201ENST00000308394 STARP49675 285 aa9.96□□□□□ -0.82
CASP3-201ENST00000308394 CRISP3P54108 245 aa9.96□□□□□ -0.82
CASP3-201ENST00000308394 SELENOWP63302 87 aa9.96□□□□□ -0.82
CASP3-201ENST00000308394 MGAT2Q10469 447 aa9.96□□□□□ -0.82
CASP3-201ENST00000308394 SERTAD2Q14140 314 aa9.96□□□□□ -0.82
CASP3-201ENST00000308394 KCNJ8Q15842 424 aa9.96□□□□□ -0.82
CASP3-201ENST00000308394 CRB2Q5IJ48 1285 aa9.96□□□□□ -0.82
CASP3-201ENST00000308394 ATAD3BQ5T9A4 648 aa9.96□□□□□ -0.82
CASP3-201ENST00000308394 FHL5Q5TD97 284 aa9.96□□□□□ -0.82
CASP3-201ENST00000308394 OLIG3Q7RTU3 272 aa9.96□□□□□ -0.82
CASP3-201ENST00000308394 C16orf62Q7Z3J2 963 aa9.96□□□□□ -0.82
CASP3-201ENST00000308394 LGI4Q8N135 537 aa9.96□□□□□ -0.82
CASP3-201ENST00000308394 KLHL36Q8N4N3 616 aa9.96□□□□□ -0.82
CASP3-201ENST00000308394 OR52R1Q8NGF1 315 aa9.96□□□□□ -0.82
CASP3-201ENST00000308394 TAMM41Q96BW9 452 aa9.96□□□□□ -0.82
CASP3-201ENST00000308394 CTHRC1Q96CG8 243 aa9.96□□□□□ -0.82
CASP3-201ENST00000308394 CMKLR1Q99788 373 aa9.96□□□□□ -0.82
CASP3-201ENST00000308394 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
CASP3-201ENST00000308394 NEURL2Q9BR09 285 aa9.96□□□□□ -0.82
CASP3-201ENST00000308394 MAGIXQ9H6Y5 334 aa9.96□□□□□ -0.82
CASP3-201ENST00000308394 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
CASP3-201ENST00000308394 CTSFQ9UBX1 484 aa9.96□□□□□ -0.82
CASP3-201ENST00000308394 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
CASP3-201ENST00000308394 CLDN16Q9Y5I7 305 aa9.96□□□□□ -0.82
CASP3-201ENST00000308394 CACNA1HO95180 2353 aa9.95□□□□□ -0.82
CASP3-201ENST00000308394 A8MUA0 341 aa9.95□□□□□ -0.82
CASP3-201ENST00000308394 HBQ1P09105 142 aa9.95□□□□□ -0.82
CASP3-201ENST00000308394 PRKCAP17252 672 aa9.95□□□□□ -0.82
CASP3-201ENST00000308394 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
CASP3-201ENST00000308394 PCBP3P57721 371 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
CASP3-201ENST00000308394 GNG2P59768 71 aa9.95□□□□□ -0.82
CASP3-201ENST00000308394 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
CASP3-201ENST00000308394 DCDP81605 110 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
CASP3-201ENST00000308394 OCA2Q04671 838 aa9.95□□□□□ -0.82
CASP3-201ENST00000308394 MAP4K2Q12851 820 aa9.95□□□□□ -0.82
CASP3-201ENST00000308394 NSDHLQ15738 373 aa9.95□□□□□ -0.82
CASP3-201ENST00000308394 MAPK11Q15759 364 aa9.95□□□□□ -0.82
CASP3-201ENST00000308394 NKAIN1Q4KMZ8 207 aa9.95□□□□□ -0.82
CASP3-201ENST00000308394 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.3 ms