RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000277657.12

CCDC7-201, Transcript of coiled-coil domain containing 7, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCDC7, Length 1,899 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7-201ENST00000277657 CCDC103Q8IW40 242 aa20.36■□□□□ 0.85
CCDC7-201ENST00000277657 ZNF614Q8N883 585 aa20.36■□□□□ 0.85
CCDC7-201ENST00000277657 OR4C3Q8NH37 302 aa20.36■□□□□ 0.85
CCDC7-201ENST00000277657 LMF1Q96S06 567 aa20.36■□□□□ 0.85
CCDC7-201ENST00000277657 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa20.36■□□□□ 0.85
CCDC7-201ENST00000277657 R4GN57 208 aa20.36■□□□□ 0.85
CCDC7-201ENST00000277657 VSTM2BA6NLU5 285 aa20.35■□□□□ 0.85
CCDC7-201ENST00000277657 PTGES3LE9PB15 166 aa20.35■□□□□ 0.85
CCDC7-201ENST00000277657 IL33O95760 270 aa20.35■□□□□ 0.85
CCDC7-201ENST00000277657 C9orf40Q8IXQ3 194 aa20.35■□□□□ 0.85
CCDC7-201ENST00000277657 PIGXQ8TBF5 258 aa20.35■□□□□ 0.85
CCDC7-201ENST00000277657 RHBDD1Q8TEB9 315 aa20.35■□□□□ 0.85
CCDC7-201ENST00000277657 TMEM255BQ8WV15 326 aa20.35■□□□□ 0.85
CCDC7-201ENST00000277657 NODALQ96S42 347 aa20.35■□□□□ 0.85
CCDC7-201ENST00000277657 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa20.35■□□□□ 0.85
CCDC7-201ENST00000277657 IMPAD1Q9NX62 359 aa20.35■□□□□ 0.85
CCDC7-201ENST00000277657 CEPT1Q9Y6K0 416 aa20.35■□□□□ 0.85
CCDC7-201ENST00000277657 GPR179Q6PRD1 2367 aa20.35■□□□□ 0.85
CCDC7-201ENST00000277657 IDSB3KWA1 339 aa20.35■□□□□ 0.85
CCDC7-201ENST00000277657 H3BN98 237 aa20.35■□□□□ 0.85
CCDC7-201ENST00000277657 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
CCDC7-201ENST00000277657 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
CCDC7-201ENST00000277657 FOXL2P58012 376 aa20.35■□□□□ 0.85
CCDC7-201ENST00000277657 TSPAN31Q12999 210 aa20.35■□□□□ 0.85
CCDC7-201ENST00000277657 C12orf73Q69YU5 71 aa20.35■□□□□ 0.85
CCDC7-201ENST00000277657 XAF1Q6GPH4 301 aa20.35■□□□□ 0.85
CCDC7-201ENST00000277657 ZNF613Q6PF04 617 aa20.35■□□□□ 0.85
CCDC7-201ENST00000277657 RRM2BQ7LG56 351 aa20.35■□□□□ 0.85
CCDC7-201ENST00000277657 SLC26A1Q9H2B4 701 aa20.35■□□□□ 0.85
CCDC7-201ENST00000277657 COPS7AQ9UBW8 275 aa20.35■□□□□ 0.85
CCDC7-201ENST00000277657 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa20.34■□□□□ 0.85
CCDC7-201ENST00000277657 SERINC4A6NH21 518 aa20.34■□□□□ 0.85
CCDC7-201ENST00000277657 OR6C76A6NM76 312 aa20.34■□□□□ 0.85
CCDC7-201ENST00000277657 KLF4O43474 513 aa20.34■□□□□ 0.85
CCDC7-201ENST00000277657 ADAM11O75078 769 aa20.34■□□□□ 0.85
CCDC7-201ENST00000277657 GPR143P51810 404 aa20.34■□□□□ 0.85
CCDC7-201ENST00000277657 PIGFQ07326 219 aa20.34■□□□□ 0.85
CCDC7-201ENST00000277657 PMS2P3Q13401 168 aa20.34■□□□□ 0.85
CCDC7-201ENST00000277657 ZBED5Q49AG3 693 aa20.34■□□□□ 0.85
CCDC7-201ENST00000277657 KLHL26Q53HC5 615 aa20.34■□□□□ 0.85
CCDC7-201ENST00000277657 P3H2Q8IVL5 708 aa20.34■□□□□ 0.85
CCDC7-201ENST00000277657 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
CCDC7-201ENST00000277657 CTRCQ99895 268 aa20.34■□□□□ 0.85
CCDC7-201ENST00000277657 HOXD1Q9GZZ0 328 aa20.34■□□□□ 0.85
CCDC7-201ENST00000277657 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
CCDC7-201ENST00000277657 H3BSA7 217 aa20.33■□□□□ 0.85
CCDC7-201ENST00000277657 TO15178 435 aa20.33■□□□□ 0.85
CCDC7-201ENST00000277657 GDF9O60383 454 aa20.33■□□□□ 0.85
CCDC7-201ENST00000277657 MPZL2O60487 215 aa20.33■□□□□ 0.85
CCDC7-201ENST00000277657 FAM20BO75063 409 aa20.33■□□□□ 0.85
CCDC7-201ENST00000277657 HEXBP07686 556 aa20.33■□□□□ 0.85
CCDC7-201ENST00000277657 FPR3P25089 353 aa20.33■□□□□ 0.85
CCDC7-201ENST00000277657 MC2RQ01718 297 aa20.33■□□□□ 0.85
CCDC7-201ENST00000277657 CNPY1Q3B7I2 92 aa20.33■□□□□ 0.85
CCDC7-201ENST00000277657 GPR141Q7Z602 305 aa20.33■□□□□ 0.85
CCDC7-201ENST00000277657 ANKRD37Q7Z713 158 aa20.33■□□□□ 0.85
CCDC7-201ENST00000277657 NRMQ8IXM6 262 aa20.33■□□□□ 0.85
CCDC7-201ENST00000277657 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
CCDC7-201ENST00000277657 TUBA1CQ9BQE3 449 aa20.33■□□□□ 0.85
CCDC7-201ENST00000277657 WWTR1Q9GZV5 400 aa20.33■□□□□ 0.85
CCDC7-201ENST00000277657 VCX3AQ9NNX9 186 aa20.33■□□□□ 0.85
CCDC7-201ENST00000277657 UBQLN4Q9NRR5 601 aa20.33■□□□□ 0.85
CCDC7-201ENST00000277657 RXFP3Q9NSD7 469 aa20.33■□□□□ 0.85
CCDC7-201ENST00000277657 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa20.33■□□□□ 0.85
CCDC7-201ENST00000277657 MEN1O00255 615 aa20.33■□□□□ 0.84
CCDC7-201ENST00000277657 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.84
CCDC7-201ENST00000277657 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.84
CCDC7-201ENST00000277657 NEDD8Q15843 81 aa20.33■□□□□ 0.84
CCDC7-201ENST00000277657 FAAH2Q6GMR7 532 aa20.33■□□□□ 0.84
CCDC7-201ENST00000277657 WDR88Q6ZMY6 472 aa20.33■□□□□ 0.84
CCDC7-201ENST00000277657 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa20.33■□□□□ 0.84
CCDC7-201ENST00000277657 ZNF550Q7Z398 422 aa20.33■□□□□ 0.84
CCDC7-201ENST00000277657 KIF18BQ86Y91 864 aa20.33■□□□□ 0.84
CCDC7-201ENST00000277657 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.84
CCDC7-201ENST00000277657 LSMEM1Q8N8F7 131 aa20.33■□□□□ 0.84
CCDC7-201ENST00000277657 POGLUT1Q8NBL1 392 aa20.33■□□□□ 0.84
CCDC7-201ENST00000277657 ZNF540Q8NDQ6 660 aa20.33■□□□□ 0.84
CCDC7-201ENST00000277657 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.84
CCDC7-201ENST00000277657 SIGLEC11Q96RL6 698 aa20.33■□□□□ 0.84
CCDC7-201ENST00000277657 GAL3ST4Q96RP7 486 aa20.33■□□□□ 0.84
CCDC7-201ENST00000277657 RHNO1Q9BSD3 238 aa20.33■□□□□ 0.84
CCDC7-201ENST00000277657 TMEM27Q9HBJ8 222 aa20.33■□□□□ 0.84
CCDC7-201ENST00000277657 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa20.33■□□□□ 0.84
CCDC7-201ENST00000277657 C11orf16Q9NQ32 467 aa20.33■□□□□ 0.84
CCDC7-201ENST00000277657 FBXO8Q9NRD0 319 aa20.33■□□□□ 0.84
CCDC7-201ENST00000277657 CNIH4Q9P003 139 aa20.33■□□□□ 0.84
CCDC7-201ENST00000277657 MRTO4Q9UKD2 239 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.84
CCDC7-201ENST00000277657 A0A0B4J2E0 115 aa20.32■□□□□ 0.84
CCDC7-201ENST00000277657 A0A1B0GX12 115 aa20.32■□□□□ 0.84
CCDC7-201ENST00000277657 M0R129 80 aa20.32■□□□□ 0.84
CCDC7-201ENST00000277657 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
CCDC7-201ENST00000277657 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
CCDC7-201ENST00000277657 ALOX12BO75342 701 aa20.32■□□□□ 0.84
CCDC7-201ENST00000277657 LCN1P31025 176 aa20.32■□□□□ 0.84
CCDC7-201ENST00000277657 TTKP33981 857 aa20.32■□□□□ 0.84
CCDC7-201ENST00000277657 ADH7P40394 386 aa20.32■□□□□ 0.84
CCDC7-201ENST00000277657 RAB39AQ14964 217 aa20.32■□□□□ 0.84
CCDC7-201ENST00000277657 LCN10Q6JVE6 187 aa20.32■□□□□ 0.84
CCDC7-201ENST00000277657 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
CCDC7-201ENST00000277657 ZNF441Q8N8Z8 693 aa20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 66.9 ms