RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000053716.7

Clrn3-201, Transcript of Clarin-3, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Clrn3, Length 3,305 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cts3Q91ZD5 332 aa6.2□□□□□ -1.42
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gorasp2Q99JX3 451 aa6.2□□□□□ -1.42
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Slc10a6Q9CXB2 373 aa6.2□□□□□ -1.42
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Adck1Q9D0L4 525 aa6.2□□□□□ -1.42
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Spaca1Q9DA48 305 aa6.2□□□□□ -1.42
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Phf3B2RQG2 2025 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Trpm6Q8CIR4 2028 aa6.2□□□□□ -1.42
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Golga4Q91VW5 2238 aa6.2□□□□□ -1.42
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Heatr5bQ8C547 2070 aa6.2□□□□□ -1.42
Clrn3-201ENSMUST00000053716 IghdA0A0A6YW14 291 aa6.2□□□□□ -1.42
Clrn3-201ENSMUST00000053716 PvrigA0A1B0GS01 234 aa6.2□□□□□ -1.42
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Pgm2A2CEK3 580 aa6.2□□□□□ -1.42
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm1330D3Z460 184 aa6.2□□□□□ -1.42
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Chst13D3Z6E3 336 aa6.2□□□□□ -1.42
Clrn3-201ENSMUST00000053716 ChadlE9Q7T7 748 aa6.2□□□□□ -1.42
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Zfp141G3UY09 685 aa6.2□□□□□ -1.42
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Zfp809G3X9G7 402 aa6.2□□□□□ -1.42
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr1425K7N659 312 aa6.2□□□□□ -1.42
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Prdx4O08807 274 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Scarb2O35114 478 aa6.2□□□□□ -1.42
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rnf13O54965 381 aa6.2□□□□□ -1.42
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cdc6O89033 562 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Chrnb1P09690 501 aa6.2□□□□□ -1.42
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Hoxd10P28359 340 aa6.2□□□□□ -1.42
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Prdx1P35700 199 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
Clrn3-201ENSMUST00000053716 B3gnt6Q3USF0 391 aa6.2□□□□□ -1.42
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Opa3Q505D7 179 aa6.2□□□□□ -1.42
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Slc35g3Q5F297 340 aa6.2□□□□□ -1.42
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Arhgef39Q66JY6 344 aa6.2□□□□□ -1.42
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Znf182Q6P560 627 aa6.2□□□□□ -1.42
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Casd1Q7TN73 797 aa6.2□□□□□ -1.42
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Marveld1Q7TQJ1 173 aa6.2□□□□□ -1.42
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Sdr9c7Q8K3P0 313 aa6.2□□□□□ -1.42
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Vmn1r32Q8R2D9 302 aa6.2□□□□□ -1.42
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Hemk1Q921L7 340 aa6.2□□□□□ -1.42
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rassf1Q99MK9 340 aa6.2□□□□□ -1.42
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ncbp2Q9CQ49 156 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
Clrn3-201ENSMUST00000053716 5330417H12RikQ9D3P2 110 aa6.2□□□□□ -1.42
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cypt12Q9DAR6 119 aa6.2□□□□□ -1.42
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Dkk3Q9QUN9 349 aa6.2□□□□□ -1.42
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Srpk3Q9Z0G2 565 aa6.2□□□□□ -1.42
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Deaf1Q9Z1T5 566 aa6.2□□□□□ -1.42
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Kif26bQ7TNC6 2112 aa6.19□□□□□ -1.42
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr1315-ps1A0A140LI66 314 aa6.19□□□□□ -1.42
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr228A0A1L1SR98 313 aa6.19□□□□□ -1.42
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr1056A2AVY0 313 aa6.19□□□□□ -1.42
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Mgl2A9XX86 381 aa6.19□□□□□ -1.42
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tcp10cE9Q046 482 aa6.19□□□□□ -1.42
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gpr31F8VQN3 319 aa6.19□□□□□ -1.42
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Vmn1r14H3BJ46 303 aa6.19□□□□□ -1.42
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Vmn1r20K7N778 303 aa6.19□□□□□ -1.42
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Amd1P0DMN7 334 aa6.19□□□□□ -1.42
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Prph2P15499 346 aa6.19□□□□□ -1.42
Clrn3-201ENSMUST00000053716 P18533 117 aa6.19□□□□□ -1.42
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Mmp12P34960 473 aa6.19□□□□□ -1.42
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Nr2f6P43136 390 aa6.19□□□□□ -1.42
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ephb3P54754 993 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gal3st3P61315 431 aa6.19□□□□□ -1.42
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tbx5P70326 518 aa6.19□□□□□ -1.42
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Smad5P97454 465 aa6.19□□□□□ -1.42
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ankdd1bQ14DN9 521 aa6.19□□□□□ -1.42
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ccdc190Q3URK1 288 aa6.19□□□□□ -1.42
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Snx33Q4VAA7 574 aa6.19□□□□□ -1.42
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Bdkrb1Q61125 334 aa6.19□□□□□ -1.42
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Pik3ip1Q7TMJ8 264 aa6.19□□□□□ -1.42
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Pum2Q80U58 1066 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Med19Q8C1S0 244 aa6.19□□□□□ -1.42
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Zfpm2Q8CCH7 1151 aa6.19□□□□□ -1.42
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Abhd17cQ8VCV1 320 aa6.19□□□□□ -1.42
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ccdc71Q8VEG0 433 aa6.19□□□□□ -1.42
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr1232Q8VEX7 311 aa6.19□□□□□ -1.42
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr1316Q8VG12 314 aa6.19□□□□□ -1.42
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr658Q8VGV5 323 aa6.19□□□□□ -1.42
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Idh3bQ91VA7 384 aa6.19□□□□□ -1.42
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Mrgprb5Q91ZB9 322 aa6.19□□□□□ -1.42
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cd209dQ91ZW8 237 aa6.19□□□□□ -1.42
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Mrpl43Q99N89 183 aa6.19□□□□□ -1.42
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Lamtor1Q9CQ22 161 aa6.19□□□□□ -1.42
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Prl8a9Q9CQ58 241 aa6.19□□□□□ -1.42
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ndufs4Q9CXZ1 175 aa6.19□□□□□ -1.42
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Dimt1Q9D0D4 313 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Aif1lQ9EQX4 150 aa6.19□□□□□ -1.42
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Wdr61Q9ERF3 305 aa6.19□□□□□ -1.42
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Lgi1Q9JIA1 557 aa6.19□□□□□ -1.42
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cbll1Q9JIY2 491 aa6.19□□□□□ -1.42
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ppm1dQ9QZ67 598 aa6.19□□□□□ -1.42
Clrn3-201ENSMUST00000053716 1700025B11RikA0A087WNZ6 93 aa6.19□□□□□ -1.42
Clrn3-201ENSMUST00000053716 TrdcA0A0G2JEU3 153 aa6.19□□□□□ -1.42
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Dcst2A0A140LIJ0 701 aa6.19□□□□□ -1.42
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Slc37a4A0A1L1SUI3 450 aa6.19□□□□□ -1.42
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr1188A2AV10 312 aa6.19□□□□□ -1.42
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cd101A8E0Y8 1033 aa6.19□□□□□ -1.42
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr653E9PVA0 317 aa6.19□□□□□ -1.42
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr723E9PZU2 309 aa6.19□□□□□ -1.42
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Zfp949E9Q732 603 aa6.19□□□□□ -1.42
Clrn3-201ENSMUST00000053716 H2-T24F8VQG4 363 aa6.19□□□□□ -1.42
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr724K7N5X7 309 aa6.19□□□□□ -1.42
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr519K7N645 319 aa6.19□□□□□ -1.42
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Nckap1P28660 1128 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Bglap3P54615 95 aa6.19□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 72.8 ms