RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000026390.7

Rabgef1-201, Transcript of Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Rabgef1, Length 2,828 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Hint3Q9CPS6 165 aa9.55□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ppil3Q9D6L8 161 aa9.55□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 MeltfQ9R0R1 738 aa9.55□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 TapbpQ9R233 465 aa9.55□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Rgs6Q9Z2H2 472 aa9.55□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Kcnk7Q9Z2T1 307 aa9.55□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Xpnpep2B1AVD1 674 aa9.55□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 PtprhE9Q0N2 971 aa9.55□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Nmur1O55040 428 aa9.55□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 OsmrO70458 971 aa9.55□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Sp3O70494 783 aa9.55□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 mt-Co3P00416 261 aa9.55□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Mtnd3P03899 115 aa9.55□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Apoa2P09813 102 aa9.55□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ppp1caP62137 330 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Tmprss11cQ1JRP2 431 aa9.55□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Teddm2Q208S0 260 aa9.55□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Foxred1Q3TQB2 487 aa9.55□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 NanogQ80Z64 305 aa9.55□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 TiprlQ8BH58 271 aa9.55□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Rab39aQ8BHD0 217 aa9.55□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gm10330Q8BKS1 112 aa9.55□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Q8C3I9 435 aa9.55□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Padi6Q8K3V4 682 aa9.55□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Olfr109Q8VG96 314 aa9.55□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Mrgprb4Q91ZC0 321 aa9.55□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Cypt12Q9DAR6 119 aa9.55□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 A0A286YD17 136 aa9.55□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Tex13aA2AFS9 377 aa9.55□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Chd7A2AJK6 2986 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Rhox2fA2ANE0 191 aa9.55□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Olfr171G5E8J1 314 aa9.55□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 FkbplO35450 347 aa9.55□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Zfp28P10078 825 aa9.55□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 TpoP35419 914 aa9.55□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 FstP47931 344 aa9.55□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Hp1bp3Q3TEA8 554 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Snx33Q4VAA7 574 aa9.55□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Taar7dQ5QD10 358 aa9.55□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Thoc6Q5U4D9 341 aa9.55□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Olfr814Q7TRH4 310 aa9.55□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Olfr699Q7TRN3 316 aa9.55□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Mrps7Q80X85 242 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 MkxQ8BIA3 353 aa9.55□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gramd1cQ8CI52 457 aa9.55□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Cables2Q8K3M5 476 aa9.55□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Fahd1Q8R0F8 227 aa9.55□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Apbb3Q8R1C9 486 aa9.55□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 H2afjQ8R1M2 129 aa9.55□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Olfr649Q8VGW1 312 aa9.55□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Lactb2Q99KR3 288 aa9.55□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 NtmQ99PJ0 344 aa9.55□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 PinlypQ9CQD7 212 aa9.55□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Otud1Q9CUB6 454 aa9.55□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Zcchc12Q9CZA5 402 aa9.55□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gpr88Q9EPB7 384 aa9.55□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ndrg2Q9QYG0 371 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Trbv20A0A0B4J1H5 111 aa9.54□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Zfp300A2AE21 645 aa9.54□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Olfr1206A2ATJ9 307 aa9.54□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Rdh8D3Z6W3 317 aa9.54□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Fam170bE9PXT9 378 aa9.54□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Eef1a1P10126 462 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 LcatP16301 438 aa9.54□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ubl4aP21126 157 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Rab12P35283 243 aa9.54□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Fgf17P63075 216 aa9.54□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Tigd2Q0VBL1 525 aa9.54□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Lemd1Q14C37 129 aa9.54□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Nhlrc4Q3UP44 136 aa9.54□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Adam26bQ6IMH6 699 aa9.54□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Timd4Q6U7R4 343 aa9.54□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 GgnQ80WJ1 673 aa9.54□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Supv3l1Q80YD1 779 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Lypd4Q8BVP6 246 aa9.54□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 B4gat1Q8BWP8 415 aa9.54□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Endod1Q8C522 501 aa9.54□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Slc22a12Q8CFZ5 553 aa9.54□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Zfp119bQ8K0G9 543 aa9.54□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Mmp21Q8K3F2 568 aa9.54□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Fndc5Q8K4Z2 209 aa9.54□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Cdhr1Q8VHP6 859 aa9.54□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Q9CR55 154 aa9.54□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Trim13Q9CYB0 407 aa9.54□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 1700034I23RikQ9D9Q3 184 aa9.54□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Rsph9Q9D9V4 276 aa9.54□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Hcar2Q9EP66 360 aa9.54□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 PtgesQ9JM51 153 aa9.54□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Dbf4Q9QZ41 663 aa9.54□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 SrrQ9QZX7 339 aa9.54□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Aloxe3Q9WV07 711 aa9.54□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Itgb6Q9Z0T9 787 aa9.54□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Spin2-ps6A0A140T8V2 174 aa9.54□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 A0A1Y7VIU7 259 aa9.54□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Zfp981A2A8V7 445 aa9.54□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 ChadlE9Q7T7 748 aa9.54□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Pcdh1F7BJK1 1077 aa9.54□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Prl4a1O35256 227 aa9.54□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Hoxd4P10628 250 aa9.54□□□□□ -0.88
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 CfpP11680 464 aa9.54□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 52.2 ms