RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635751.1

CLN8-208, Transcript of CLN8, transmembrane ER and ERGIC protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CLN8, Length 1,807 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8-208ENST00000635751 GIMAP4Q9NUV9 329 aa18.51■□□□□ 0.55
CLN8-208ENST00000635751 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa18.51■□□□□ 0.55
CLN8-208ENST00000635751 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
CLN8-208ENST00000635751 DSPPQ9NZW4 1301 aa18.51■□□□□ 0.55
CLN8-208ENST00000635751 BLACEA4D250 179 aa18.51■□□□□ 0.55
CLN8-208ENST00000635751 FAAHO00519 579 aa18.51■□□□□ 0.55
CLN8-208ENST00000635751 H1F0P07305 194 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
CLN8-208ENST00000635751 NR2F1P10589 423 aa18.51■□□□□ 0.55
CLN8-208ENST00000635751 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
CLN8-208ENST00000635751 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
CLN8-208ENST00000635751 OPRL1P41146 370 aa18.51■□□□□ 0.55
CLN8-208ENST00000635751 FOXL2P58012 376 aa18.51■□□□□ 0.55
CLN8-208ENST00000635751 SMIM11AP58511 58 aa18.51■□□□□ 0.55
CLN8-208ENST00000635751 GABREP78334 506 aa18.51■□□□□ 0.55
CLN8-208ENST00000635751 ZNF846Q147U1 533 aa18.51■□□□□ 0.55
CLN8-208ENST00000635751 SYPL1Q16563 259 aa18.51■□□□□ 0.55
CLN8-208ENST00000635751 MINDY4Q4G0A6 757 aa18.51■□□□□ 0.55
CLN8-208ENST00000635751 TCTN3Q6NUS6 607 aa18.51■□□□□ 0.55
CLN8-208ENST00000635751 BHLHB9Q6PI77 547 aa18.51■□□□□ 0.55
CLN8-208ENST00000635751 LAPTM4BQ86VI4 370 aa18.51■□□□□ 0.55
CLN8-208ENST00000635751 STT3BQ8TCJ2 826 aa18.51■□□□□ 0.55
CLN8-208ENST00000635751 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa18.51■□□□□ 0.55
CLN8-208ENST00000635751 XAGE5Q8WWM1 108 aa18.51■□□□□ 0.55
CLN8-208ENST00000635751 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
CLN8-208ENST00000635751 SPRY4Q9C004 299 aa18.51■□□□□ 0.55
CLN8-208ENST00000635751 HMG20AQ9NP66 347 aa18.51■□□□□ 0.55
CLN8-208ENST00000635751 AMBNQ9NP70 447 aa18.51■□□□□ 0.55
CLN8-208ENST00000635751 MGAT4BQ9UQ53 548 aa18.51■□□□□ 0.55
CLN8-208ENST00000635751 CORINQ9Y5Q5 1042 aa18.51■□□□□ 0.55
CLN8-208ENST00000635751 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa18.5■□□□□ 0.55
CLN8-208ENST00000635751 SH3D21A4FU49 640 aa18.5■□□□□ 0.55
CLN8-208ENST00000635751 CLDN25C9JDP6 229 aa18.5■□□□□ 0.55
CLN8-208ENST00000635751 TGFBR3LH3BV60 316 aa18.5■□□□□ 0.55
CLN8-208ENST00000635751 J3QRK9 145 aa18.5■□□□□ 0.55
CLN8-208ENST00000635751 MAOAP21397 527 aa18.5■□□□□ 0.55
CLN8-208ENST00000635751 CHMP24386 653 aa18.5■□□□□ 0.55
CLN8-208ENST00000635751 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
CLN8-208ENST00000635751 PTGER1P34995 402 aa18.5■□□□□ 0.55
CLN8-208ENST00000635751 NUDT6P53370 316 aa18.5■□□□□ 0.55
CLN8-208ENST00000635751 HSD17B7P56937 341 aa18.5■□□□□ 0.55
CLN8-208ENST00000635751 CEBPEQ15744 281 aa18.5■□□□□ 0.55
CLN8-208ENST00000635751 DCST1Q5T197 706 aa18.5■□□□□ 0.55
CLN8-208ENST00000635751 DEF8Q6ZN54 512 aa18.5■□□□□ 0.55
CLN8-208ENST00000635751 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa18.5■□□□□ 0.55
CLN8-208ENST00000635751 MED25Q71SY5 747 aa18.5■□□□□ 0.55
CLN8-208ENST00000635751 TIPARPQ7Z3E1 657 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
CLN8-208ENST00000635751 STX19Q8N4C7 294 aa18.5■□□□□ 0.55
CLN8-208ENST00000635751 OR5D16Q8NGK9 328 aa18.5■□□□□ 0.55
CLN8-208ENST00000635751 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
CLN8-208ENST00000635751 SUN3Q8TAQ9 357 aa18.5■□□□□ 0.55
CLN8-208ENST00000635751 S100ZQ8WXG8 99 aa18.5■□□□□ 0.55
CLN8-208ENST00000635751 LGALS12Q96DT0 336 aa18.5■□□□□ 0.55
CLN8-208ENST00000635751 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
CLN8-208ENST00000635751 UCK2Q9BZX2 261 aa18.5■□□□□ 0.55
CLN8-208ENST00000635751 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
CLN8-208ENST00000635751 TGIF2Q9GZN2 237 aa18.5■□□□□ 0.55
CLN8-208ENST00000635751 TBCCD1Q9NVR7 557 aa18.5■□□□□ 0.55
CLN8-208ENST00000635751 GPR83Q9NYM4 423 aa18.5■□□□□ 0.55
CLN8-208ENST00000635751 SELENONQ9NZV5 590 aa18.5■□□□□ 0.55
CLN8-208ENST00000635751 ACAD8Q9UKU7 415 aa18.5■□□□□ 0.55
CLN8-208ENST00000635751 SPTBN2O15020 2390 aa18.5■□□□□ 0.55
CLN8-208ENST00000635751 NINQ8N4C6 2090 aa18.49■□□□□ 0.55
CLN8-208ENST00000635751 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa18.49■□□□□ 0.55
CLN8-208ENST00000635751 NADKO95544 446 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
CLN8-208ENST00000635751 DLGAP3O95886 979 aa18.49■□□□□ 0.55
CLN8-208ENST00000635751 ZGLP1P0C6A0 271 aa18.49■□□□□ 0.55
CLN8-208ENST00000635751 CPMP14384 443 aa18.49■□□□□ 0.55
CLN8-208ENST00000635751 MPIP34949 423 aa18.49■□□□□ 0.55
CLN8-208ENST00000635751 NCS1P62166 190 aa18.49■□□□□ 0.55
CLN8-208ENST00000635751 STX4Q12846 297 aa18.49■□□□□ 0.55
CLN8-208ENST00000635751 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
CLN8-208ENST00000635751 GNA13Q14344 377 aa18.49■□□□□ 0.55
CLN8-208ENST00000635751 TIGD6Q17RP2 521 aa18.49■□□□□ 0.55
CLN8-208ENST00000635751 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
CLN8-208ENST00000635751 ADCK1Q86TW2 530 aa18.49■□□□□ 0.55
CLN8-208ENST00000635751 TMEM151BQ8IW70 566 aa18.49■□□□□ 0.55
CLN8-208ENST00000635751 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa18.49■□□□□ 0.55
CLN8-208ENST00000635751 BBS10Q8TAM1 723 aa18.49■□□□□ 0.55
CLN8-208ENST00000635751 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
CLN8-208ENST00000635751 MOAP1Q96BY2 351 aa18.49■□□□□ 0.55
CLN8-208ENST00000635751 PTCHD1Q96NR3 888 aa18.49■□□□□ 0.55
CLN8-208ENST00000635751 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa18.49■□□□□ 0.55
CLN8-208ENST00000635751 FAIMQ9NVQ4 179 aa18.49■□□□□ 0.55
CLN8-208ENST00000635751 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP18.49■□□□□ 0.55
CLN8-208ENST00000635751 CLDN16Q9Y5I7 305 aa18.49■□□□□ 0.55
CLN8-208ENST00000635751 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa18.49■□□□□ 0.55
CLN8-208ENST00000635751 PIEZO1Q92508 2521 aa18.49■□□□□ 0.55
CLN8-208ENST00000635751 MAGEB3O15480 346 aa18.49■□□□□ 0.55
CLN8-208ENST00000635751 OSMP13725 252 aa18.49■□□□□ 0.55
CLN8-208ENST00000635751 PORP16435 677 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
CLN8-208ENST00000635751 EFNA3P52797 238 aa18.49■□□□□ 0.55
CLN8-208ENST00000635751 CRISP3P54108 245 aa18.49■□□□□ 0.55
CLN8-208ENST00000635751 UGT2B15P54855 530 aa18.49■□□□□ 0.55
CLN8-208ENST00000635751 TMEM236Q5W0B7 351 aa18.49■□□□□ 0.55
CLN8-208ENST00000635751 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
CLN8-208ENST00000635751 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
CLN8-208ENST00000635751 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
CLN8-208ENST00000635751 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
CLN8-208ENST00000635751 SLC46A1Q96NT5 459 aa18.49■□□□□ 0.55
CLN8-208ENST00000635751 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.6 ms