RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612229.4

PTPRT-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 11,285 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-209ENST00000612229 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 OR1M1Q8NGA1 313 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 SLC2A12Q8TD20 617 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 SFXN2Q96NB2 322 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 KATNB1Q9BVA0 655 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 SLC6A5Q9Y345 797 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 PLSCR1O15162 318 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 SOCS5O75159 536 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 SPDEFO95238 335 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 CCNOP22674 350 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 AK4P27144 223 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 GABRA2P47869 451 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 FAM214AQ32MH5 1076 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 EEF1DP3Q658K8 133 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 RABEPKQ7Z6M1 372 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 IGFN1Q86VF2 1251 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 OR14C36Q8NHC7 312 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 LRR1Q96L50 414 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 PIGQQ9BRB3 760 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 SCML2Q9UQR0 700 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 EPHX1P07099 455 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 PFKMP08237 780 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 CA5AP35218 305 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 RAP2BP61225 183 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 TEKQ02763 1124 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 CATR1Q13166 79 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 VGLL4Q14135 290 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 C6orf136Q5SQH8 315 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 VAPAQ9P0L0 249 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 TMEM88BA6NKF7 163 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 PNMTP11086 282 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 PRKACGP22612 351 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 IL1R2P27930 398 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 CRABP1P29762 137 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 CSN1S1P47710 185 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 PTH2RP49190 550 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 UBE2UQ5VVX9 321 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 MEIOCA2RUB1 952 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 EOMESO95936 686 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 PTGER4P35408 488 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 MMP12P39900 470 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 OC90Q02509 493 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 BTNL8Q6UX41 500 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF439Q8NDP4 499 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 OR5AK2Q8NH90 309 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 RNF141Q8WVD5 230 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 CLSTN3Q9BQT9 956 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 CUTCQ9NTM9 273 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 NLKQ9UBE8 527 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 TLL1O43897 1013 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 CXCR4P61073 352 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 SNRPD2P62316 118 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 SLAMF1Q13291 335 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 GRIK5Q16478 980 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 SUV39H2Q9H5I1 410 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 CTPS2Q9NRF8 586 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 KIF26BQ2KJY2 2108 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 LRRC37A3O60309 1634 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 LOC730098B7Z3J9 87 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 ADAP00813 363 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP6.62□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 SMAGPQ0VAQ4 97 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 PLAG1Q6DJT9 500 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 CXCL17Q6UXB2 119 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 GDPD4Q6W3E5 623 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 TEX26Q8N6G2 289 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 SLAIN1Q8ND83 568 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 SMPDL3BQ92485 455 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 C12orf10Q9HB07 376 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 KLHL42Q9P2K6 505 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 RICTORQ6R327 1708 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 USP2O75604 605 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 SLC22A5O76082 557 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 LCKP06239 509 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 CDK4P11802 303 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 PLA2G7Q13093 441 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 GPR19Q15760 415 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 OR4N5Q8IXE1 308 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 TMEM104Q8NE00 496 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRT-209ENST00000612229 OR9A1PQ8NGU1 263 aa6.62□□□□□ -1.35
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