RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000596522.1

FCHO1-215, Transcript of FCH domain only 1, human

TSL 4

Gene FCHO1, Length 533 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FCHO1-215	ENST00000596522	SHOX2	O60902	331 aa	Predicted RBP	12.92	□□□□□ -0.34
FCHO1-215	ENST00000596522	FAM107A	O95990	144 aa		12.92	□□□□□ -0.34
FCHO1-215	ENST00000596522	MVD	P53602	400 aa		12.92	□□□□□ -0.34
FCHO1-215	ENST00000596522	SRSF1	Q07955	248 aa	Known RBP eCLIP	12.92	□□□□□ -0.34
FCHO1-215	ENST00000596522	SF3B4	Q15427	424 aa	Known RBP eCLIP	12.92	□□□□□ -0.34	1e-11	■■■■□ 22.5
FCHO1-215	ENST00000596522	ZNF141	Q15928	474 aa		12.92	□□□□□ -0.34
FCHO1-215	ENST00000596522	GLYR1	Q49A26	553 aa	Predicted RBP	12.92	□□□□□ -0.34
FCHO1-215	ENST00000596522	KLHL26	Q53HC5	615 aa		12.92	□□□□□ -0.34
FCHO1-215	ENST00000596522	DDX59	Q5T1V6	619 aa	Known RBP eCLIP	12.92	□□□□□ -0.34
FCHO1-215	ENST00000596522	GKAP1	Q5VSY0	366 aa	Predicted RBP	12.92	□□□□□ -0.34
FCHO1-215	ENST00000596522	TRIL	Q7L0X0	811 aa		12.92	□□□□□ -0.34
FCHO1-215	ENST00000596522	ARPIN	Q7Z6K5	226 aa		12.92	□□□□□ -0.34
FCHO1-215	ENST00000596522	CMIP	Q8IY22	773 aa		12.92	□□□□□ -0.34
FCHO1-215	ENST00000596522	FADS6	Q8N9I5	356 aa		12.92	□□□□□ -0.34
FCHO1-215	ENST00000596522	WDSUB1	Q8N9V3	476 aa		12.92	□□□□□ -0.34
FCHO1-215	ENST00000596522	OR4C3	Q8NH37	302 aa		12.92	□□□□□ -0.34
FCHO1-215	ENST00000596522	NEIL3	Q8TAT5	605 aa		12.92	□□□□□ -0.34
FCHO1-215	ENST00000596522	PRR7	Q8TB68	274 aa		12.92	□□□□□ -0.34
FCHO1-215	ENST00000596522	PNPT1	Q8TCS8	783 aa	Known RBP	12.92	□□□□□ -0.34
FCHO1-215	ENST00000596522	CMTM5	Q96DZ9	223 aa		12.92	□□□□□ -0.34
FCHO1-215	ENST00000596522	GNRHR2	Q96P88	292 aa		12.92	□□□□□ -0.34
FCHO1-215	ENST00000596522	CGREF1	Q99674	301 aa		12.92	□□□□□ -0.34
FCHO1-215	ENST00000596522	SPATA9	Q9BWV2	254 aa		12.92	□□□□□ -0.34
FCHO1-215	ENST00000596522	OR2B2	Q9GZK3	357 aa		12.92	□□□□□ -0.34
FCHO1-215	ENST00000596522	TSPAN10	Q9H1Z9	355 aa	Predicted RBP	12.92	□□□□□ -0.34
FCHO1-215	ENST00000596522	ARMC7	Q9H6L4	198 aa		12.92	□□□□□ -0.34
FCHO1-215	ENST00000596522	A4GALT	Q9NPC4	353 aa		12.92	□□□□□ -0.34
FCHO1-215	ENST00000596522	SLC35A3	Q9Y2D2	325 aa		12.92	□□□□□ -0.34
FCHO1-215	ENST00000596522	AP3M1	Q9Y2T2	418 aa		12.92	□□□□□ -0.34
FCHO1-215	ENST00000596522	DOPEY2	Q9Y3R5	2298 aa		12.92	□□□□□ -0.34
FCHO1-215	ENST00000596522	MYO7B	Q6PIF6	2116 aa		12.92	□□□□□ -0.34
FCHO1-215	ENST00000596522	NCKAP5	O14513	1909 aa		12.92	□□□□□ -0.34
FCHO1-215	ENST00000596522		A0A1B0GUH1	482 aa		12.91	□□□□□ -0.34
FCHO1-215	ENST00000596522	CLEC18A	A5D8T8	446 aa		12.91	□□□□□ -0.34
FCHO1-215	ENST00000596522	C5orf58	C9J3I9	102 aa		12.91	□□□□□ -0.34
FCHO1-215	ENST00000596522	MRAS	O14807	208 aa		12.91	□□□□□ -0.34
FCHO1-215	ENST00000596522	EIF4E2	O60573	245 aa	Known RBP	12.91	□□□□□ -0.34
FCHO1-215	ENST00000596522	TRAPPC6A	O75865	159 aa		12.91	□□□□□ -0.34
FCHO1-215	ENST00000596522	H6PD	O95479	791 aa		12.91	□□□□□ -0.34
FCHO1-215	ENST00000596522	STS	P08842	583 aa		12.91	□□□□□ -0.34
FCHO1-215	ENST00000596522	GPX2	P18283	190 aa		12.91	□□□□□ -0.34
FCHO1-215	ENST00000596522	PRDX6	P30041	224 aa		12.91	□□□□□ -0.34
FCHO1-215	ENST00000596522	PTGS2	P35354	604 aa		12.91	□□□□□ -0.34
FCHO1-215	ENST00000596522	PTGER4	P35408	488 aa		12.91	□□□□□ -0.34
FCHO1-215	ENST00000596522	ADH7	P40394	386 aa		12.91	□□□□□ -0.34
FCHO1-215	ENST00000596522	PER3	P56645	1201 aa		12.91	□□□□□ -0.34
FCHO1-215	ENST00000596522	SF3A3	Q12874	501 aa	Known RBP eCLIP	12.91	□□□□□ -0.34
FCHO1-215	ENST00000596522	TOMM20	Q15388	145 aa		12.91	□□□□□ -0.34
FCHO1-215	ENST00000596522	GPR68	Q15743	365 aa		12.91	□□□□□ -0.34
FCHO1-215	ENST00000596522	GTDC1	Q4AE62	458 aa		12.91	□□□□□ -0.34
FCHO1-215	ENST00000596522	NHSL2	Q5HYW2	709 aa		12.91	□□□□□ -0.34
FCHO1-215	ENST00000596522	GCNT6	Q5T4J0	391 aa		12.91	□□□□□ -0.34
FCHO1-215	ENST00000596522	DESI1	Q6ICB0	168 aa		12.91	□□□□□ -0.34
FCHO1-215	ENST00000596522	TYW3	Q6IPR3	259 aa	Known RBP	12.91	□□□□□ -0.34
FCHO1-215	ENST00000596522	AAGAB	Q6PD74	315 aa		12.91	□□□□□ -0.34
FCHO1-215	ENST00000596522	CLEC18B	Q6UXF7	455 aa		12.91	□□□□□ -0.34
FCHO1-215	ENST00000596522	DLEU7	Q6UYE1	221 aa		12.91	□□□□□ -0.34
FCHO1-215	ENST00000596522		Q6ZPB1	254 aa	Predicted RBP	12.91	□□□□□ -0.34
FCHO1-215	ENST00000596522	EIF3M	Q7L2H7	374 aa	Known RBP	12.91	□□□□□ -0.34
FCHO1-215	ENST00000596522	PIGW	Q7Z7B1	504 aa		12.91	□□□□□ -0.34
FCHO1-215	ENST00000596522	MARCH3	Q86UD3	253 aa		12.91	□□□□□ -0.34
FCHO1-215	ENST00000596522	MTDH	Q86UE4	582 aa	Known RBP	12.91	□□□□□ -0.34
FCHO1-215	ENST00000596522	SNX32	Q86XE0	403 aa		12.91	□□□□□ -0.34
FCHO1-215	ENST00000596522	SPPL2C	Q8IUH8	684 aa		12.91	□□□□□ -0.34
FCHO1-215	ENST00000596522	SLC30A8	Q8IWU4	369 aa		12.91	□□□□□ -0.34
FCHO1-215	ENST00000596522	ANKS4B	Q8N8V4	417 aa		12.91	□□□□□ -0.34
FCHO1-215	ENST00000596522	CLEC18C	Q8NCF0	446 aa		12.91	□□□□□ -0.34
FCHO1-215	ENST00000596522	OR8J3	Q8NGG0	315 aa		12.91	□□□□□ -0.34
FCHO1-215	ENST00000596522	OR14L1P	Q8NHC6	308 aa		12.91	□□□□□ -0.34
FCHO1-215	ENST00000596522	BBS10	Q8TAM1	723 aa		12.91	□□□□□ -0.34
FCHO1-215	ENST00000596522	RAB8B	Q92930	207 aa		12.91	□□□□□ -0.34
FCHO1-215	ENST00000596522	AURKB	Q96GD4	344 aa	Predicted RBP	12.91	□□□□□ -0.34
FCHO1-215	ENST00000596522	ANKRD27	Q96NW4	1050 aa		12.91	□□□□□ -0.34
FCHO1-215	ENST00000596522	DEFB127	Q9H1M4	99 aa		12.91	□□□□□ -0.34
FCHO1-215	ENST00000596522	MTHFD2L	Q9H903	347 aa	Predicted RBP	12.91	□□□□□ -0.34
FCHO1-215	ENST00000596522	SLC6A13	Q9NSD5	602 aa		12.91	□□□□□ -0.34
FCHO1-215	ENST00000596522	SLC25A37	Q9NYZ2	338 aa		12.91	□□□□□ -0.34
FCHO1-215	ENST00000596522	VAPA	Q9P0L0	249 aa		12.91	□□□□□ -0.34
FCHO1-215	ENST00000596522	STOML1	Q9UBI4	398 aa		12.91	□□□□□ -0.34
FCHO1-215	ENST00000596522	ZNF835	Q9Y2P0	537 aa		12.91	□□□□□ -0.34
FCHO1-215	ENST00000596522	KCNE3	Q9Y6H6	103 aa		12.91	□□□□□ -0.34
FCHO1-215	ENST00000596522	NUP214	P35658	2090 aa	Predicted RBP	12.91	□□□□□ -0.34
FCHO1-215	ENST00000596522	DNAJC13	O75165	2243 aa		12.9	□□□□□ -0.34
FCHO1-215	ENST00000596522	POLE	Q07864	2286 aa		12.9	□□□□□ -0.34
FCHO1-215	ENST00000596522		A0A0G2JPF8	293 aa		12.9	□□□□□ -0.34
FCHO1-215	ENST00000596522	SERINC4	A6NH21	518 aa		12.9	□□□□□ -0.34
FCHO1-215	ENST00000596522	FIGNL2	A6NMB9	653 aa		12.9	□□□□□ -0.34
FCHO1-215	ENST00000596522	HNRNPCL2	B2RXH8	293 aa		12.9	□□□□□ -0.34
FCHO1-215	ENST00000596522	HNRNPCL3	B7ZW38	293 aa		12.9	□□□□□ -0.34
FCHO1-215	ENST00000596522	GTPBP1	O00178	669 aa	Known RBP	12.9	□□□□□ -0.34
FCHO1-215	ENST00000596522	NDUFAB1	O14561	156 aa		12.9	□□□□□ -0.34
FCHO1-215	ENST00000596522	HNRNPCL1	O60812	293 aa	Known RBP	12.9	□□□□□ -0.34
FCHO1-215	ENST00000596522	WISP2	O76076	250 aa		12.9	□□□□□ -0.34
FCHO1-215	ENST00000596522	ACTL6A	O96019	429 aa		12.9	□□□□□ -0.34
FCHO1-215	ENST00000596522	DBI	P07108	87 aa	Known RBP	12.9	□□□□□ -0.34
FCHO1-215	ENST00000596522	HOXD4	P09016	255 aa	Predicted RBP	12.9	□□□□□ -0.34
FCHO1-215	ENST00000596522	RFPL3S	P0C7P2	107 aa		12.9	□□□□□ -0.34
FCHO1-215	ENST00000596522	HNRNPCL4	P0DMR1	293 aa		12.9	□□□□□ -0.34
FCHO1-215	ENST00000596522	UBL4A	P11441	157 aa		12.9	□□□□□ -0.34
FCHO1-215	ENST00000596522	ETFA	P13804	333 aa		12.9	□□□□□ -0.34

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