RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000585685.5

APOC4-APOC2-201, Transcript of APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

TSL 5

Gene APOC4-APOC2, Length 1,829 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP15.33■□□□□ 0.04
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 DOK4Q8TEW6 326 aa15.33■□□□□ 0.04
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP15.33■□□□□ 0.04
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CEP19Q96LK0 163 aa15.33■□□□□ 0.04
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 GDF15Q99988 308 aa15.33■□□□□ 0.04
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CCDC3Q9BQI4 270 aa15.33■□□□□ 0.04
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SLC30A2Q9BRI3 323 aa15.33■□□□□ 0.04
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SEMA6CQ9H3T2 930 aa15.33■□□□□ 0.04
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 EVA1AQ9H8M9 152 aa15.33■□□□□ 0.04
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 FBXO34Q9NWN3 711 aa15.33■□□□□ 0.04
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ZNF229Q9UJW7 825 aa15.33■□□□□ 0.04
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 POMT2Q9UKY4 750 aa15.33■□□□□ 0.04
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 EXOGQ9Y2C4 368 aaKnown RBP15.33■□□□□ 0.04
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP15.33■□□□□ 0.04
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 IQCMA0A1B0GVH7 501 aa15.32■□□□□ 0.04
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PEX12O00623 359 aa15.32■□□□□ 0.04
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SOX30O94993 753 aa15.32■□□□□ 0.04
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 LYPD3O95274 346 aa15.32■□□□□ 0.04
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CH25HO95992 272 aa15.32■□□□□ 0.04
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SLC35E2P0CK97 266 aa15.32■□□□□ 0.04
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP15.32■□□□□ 0.04
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP15.32■□□□□ 0.04
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP15.32■□□□□ 0.04
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 OR1Q1Q15612 314 aa15.32■□□□□ 0.04
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 FRMD1Q8N878 549 aa15.32■□□□□ 0.04
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 POC5Q8NA72 575 aa15.32■□□□□ 0.04
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 GPR151Q8TDV0 419 aa15.32■□□□□ 0.04
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 MSANTD3Q96H12 275 aa15.32■□□□□ 0.04
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 WDFY2Q96P53 400 aa15.32■□□□□ 0.04
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP15.32■□□□□ 0.04
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CCDC32Q9BV29 185 aa15.32■□□□□ 0.04
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CYP8B1Q9UNU6 501 aa15.32■□□□□ 0.04
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TRAPPC4Q9Y296 219 aa15.32■□□□□ 0.04
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SLC35F4A4IF30 521 aa15.31■□□□□ 0.04
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SGK494L7N484 410 aa15.31■□□□□ 0.04
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 HCRTR1O43613 425 aa15.31■□□□□ 0.04
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 NKX2-2O95096 273 aa15.31■□□□□ 0.04
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 APOL3O95236 402 aa15.31■□□□□ 0.04
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 GUSBP08236 651 aa15.31■□□□□ 0.04
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PRG2P13727 222 aa15.31■□□□□ 0.04
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CTSEP14091 401 aa15.31■□□□□ 0.04
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ST6GAL1P15907 406 aa15.31■□□□□ 0.04
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 HTR1FP30939 366 aa15.31■□□□□ 0.04
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TNFSF8P32971 234 aa15.31■□□□□ 0.04
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SLC1A3P43003 542 aa15.31■□□□□ 0.04
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 COPZ1P61923 177 aa15.31■□□□□ 0.04
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 WDR88Q6ZMY6 472 aa15.31■□□□□ 0.04
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 GATAD2BQ8WXI9 593 aa15.31■□□□□ 0.04
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 UFD1Q92890 307 aa15.31■□□□□ 0.04
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SLC25A46Q96AG3 418 aa15.31■□□□□ 0.04
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 JAM3Q9BX67 310 aa15.31■□□□□ 0.04
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 FAM60AQ9NP50 221 aa15.31■□□□□ 0.04
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SNTG1Q9NSN8 517 aa15.31■□□□□ 0.04
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 STARD5Q9NSY2 213 aa15.31■□□□□ 0.04
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 FBXL21Q9UKT6 434 aa15.31■□□□□ 0.04
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 UNC119BA6NIH7 251 aa15.31■□□□□ 0.04
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 COQ9O75208 318 aa15.31■□□□□ 0.04
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CBX7O95931 251 aa15.31■□□□□ 0.04
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 IGHA1P01876 353 aa15.31■□□□□ 0.04
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ZGLP1P0C6A0 271 aa15.31■□□□□ 0.04
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 GKN3PP0CG01 181 aa15.31■□□□□ 0.04
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 GABRA3P34903 492 aa15.31■□□□□ 0.04
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 NUDT1P36639 197 aa15.31■□□□□ 0.04
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 GCGRP47871 477 aa15.31■□□□□ 0.04
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SEPHS1P49903 392 aa15.31■□□□□ 0.04
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 BLKP51451 505 aa15.31■□□□□ 0.04
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ACSM1Q08AH1 577 aa15.31■□□□□ 0.04
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP15.31■□□□□ 0.04
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 DSG2Q14126 1118 aa15.31■□□□□ 0.04
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ARMC6Q6NXE6 501 aa15.31■□□□□ 0.04
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 FIGNL1Q6PIW4 674 aa15.31■□□□□ 0.04
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ZNF438Q7Z4V0 828 aa15.31■□□□□ 0.04
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP15.31■□□□□ 0.04
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa15.31■□□□□ 0.04
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TMEM239Q8WW34 195 aa15.31■□□□□ 0.04
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SAMD8Q96LT4 415 aa15.31■□□□□ 0.04
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ZNF649Q9BS31 505 aa15.31■□□□□ 0.04
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 MED18Q9BUE0 208 aa15.31■□□□□ 0.04
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 UBQLN3Q9H347 655 aa15.31■□□□□ 0.04
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 C14orf105Q9NVL8 296 aa15.31■□□□□ 0.04
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP15.31■□□□□ 0.04
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP15.31■□□□□ 0.04
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CBLCQ9ULV8 474 aa15.31■□□□□ 0.04
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CLCA2Q9UQC9 943 aa15.31■□□□□ 0.04
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 NPIPA5A0A0B4J1W7 369 aa15.3■□□□□ 0.04
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 A0A1W2PPC4 97 aa15.3■□□□□ 0.04
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 NPIPA7E9PJI5 369 aa15.3■□□□□ 0.04
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SLC30A4O14863 429 aa15.3■□□□□ 0.04
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PLD2O14939 933 aa15.3■□□□□ 0.04
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 RDH16O75452 317 aa15.3■□□□□ 0.04
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CDRT1O95170 752 aa15.3■□□□□ 0.04
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 MSL3P1P0C860 447 aa15.3■□□□□ 0.04
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 NPIPA8P0DM63 369 aa15.3■□□□□ 0.04
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 GABRA5P31644 462 aa15.3■□□□□ 0.04
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 RPS25P62851 125 aaKnown RBP15.3■□□□□ 0.04
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PSPHP78330 225 aa15.3■□□□□ 0.04
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PLAURQ03405 335 aa15.3■□□□□ 0.04
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 RUNX1T1Q06455 604 aa15.3■□□□□ 0.04
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa15.3■□□□□ 0.04
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 QSOX2Q6ZRP7 698 aa15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.6 ms