RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577667.1

PPP4R1-205, Transcript of protein phosphatase 4 regulatory subunit 1, human

TSL 4

Gene PPP4R1, Length 560 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4R1-205	ENST00000577667	ELAVL3	Q14576	367 aa	Known RBP	2.54	□□□□□ -2
PPP4R1-205	ENST00000577667	OPCML	Q14982	345 aa		2.54	□□□□□ -2
PPP4R1-205	ENST00000577667	SNRNP35	Q16560	246 aa	Known RBP	2.54	□□□□□ -2
PPP4R1-205	ENST00000577667	C3AR1	Q16581	482 aa		2.54	□□□□□ -2
PPP4R1-205	ENST00000577667	ZNF699	Q32M78	642 aa		2.54	□□□□□ -2
PPP4R1-205	ENST00000577667	LACTB2	Q53H82	288 aa	Predicted RBP	2.54	□□□□□ -2
PPP4R1-205	ENST00000577667	FAM133B	Q5BKY9	247 aa	Known RBP	2.54	□□□□□ -2
PPP4R1-205	ENST00000577667	PIP5KL1	Q5T9C9	394 aa		2.54	□□□□□ -2
PPP4R1-205	ENST00000577667	C6orf163	Q5TEZ5	329 aa		2.54	□□□□□ -2
PPP4R1-205	ENST00000577667	OR6B2	Q6IFH4	312 aa		2.54	□□□□□ -2
PPP4R1-205	ENST00000577667	RFWD3	Q6PCD5	774 aa		2.54	□□□□□ -2
PPP4R1-205	ENST00000577667		Q6ZSR6	202 aa		2.54	□□□□□ -2
PPP4R1-205	ENST00000577667	ABI3BP	Q7Z7G0	1075 aa		2.54	□□□□□ -2
PPP4R1-205	ENST00000577667	SYCP3	Q8IZU3	236 aa		2.54	□□□□□ -2
PPP4R1-205	ENST00000577667	TCEANC	Q8N8B7	351 aa		2.54	□□□□□ -2
PPP4R1-205	ENST00000577667	RASGEF1A	Q8N9B8	481 aa		2.54	□□□□□ -2
PPP4R1-205	ENST00000577667	KLHL30-AS1	Q8NEE0	82 aa		2.54	□□□□□ -2
PPP4R1-205	ENST00000577667	RHOXF1	Q8NHV9	184 aa		2.54	□□□□□ -2
PPP4R1-205	ENST00000577667	FIBIN	Q8TAL6	211 aa		2.54	□□□□□ -2
PPP4R1-205	ENST00000577667	LMX1A	Q8TE12	382 aa		2.54	□□□□□ -2
PPP4R1-205	ENST00000577667	NDRG1	Q92597	394 aa	Known RBP	2.54	□□□□□ -2
PPP4R1-205	ENST00000577667	RFT1	Q96AA3	541 aa		2.54	□□□□□ -2
PPP4R1-205	ENST00000577667	CCDC127	Q96BQ5	260 aa		2.54	□□□□□ -2
PPP4R1-205	ENST00000577667	BMF	Q96LC9	184 aa		2.54	□□□□□ -2
PPP4R1-205	ENST00000577667	DUSP16	Q9BY84	665 aa		2.54	□□□□□ -2
PPP4R1-205	ENST00000577667	STRADB	Q9C0K7	418 aa		2.54	□□□□□ -2
PPP4R1-205	ENST00000577667	DNAI2	Q9GZS0	605 aa		2.54	□□□□□ -2
PPP4R1-205	ENST00000577667	TCEAL2	Q9H3H9	227 aa	Predicted RBP	2.54	□□□□□ -2
PPP4R1-205	ENST00000577667	EGLN3	Q9H6Z9	239 aa		2.54	□□□□□ -2
PPP4R1-205	ENST00000577667	SYNDIG1	Q9H7V2	258 aa		2.54	□□□□□ -2
PPP4R1-205	ENST00000577667	NOL11	Q9H8H0	719 aa	Known RBP	2.54	□□□□□ -2
PPP4R1-205	ENST00000577667	HACD3	Q9P035	362 aa		2.54	□□□□□ -2
PPP4R1-205	ENST00000577667	SEPT10	Q9P0V9	454 aa		2.54	□□□□□ -2
PPP4R1-205	ENST00000577667	PISD	Q9UG56	409 aa		2.54	□□□□□ -2
PPP4R1-205	ENST00000577667	EXOC7	Q9UPT5	735 aa		2.54	□□□□□ -2
PPP4R1-205	ENST00000577667	ERVW-1	Q9UQF0	538 aa		2.54	□□□□□ -2
PPP4R1-205	ENST00000577667	VSIG4	Q9Y279	399 aa		2.54	□□□□□ -2
PPP4R1-205	ENST00000577667	TMEM5	Q9Y2B1	443 aa		2.54	□□□□□ -2
PPP4R1-205	ENST00000577667	HIVEP2	P31629	2446 aa		2.54	□□□□□ -2
PPP4R1-205	ENST00000577667	MEGF8	Q7Z7M0	2845 aa		2.54	□□□□□ -2
PPP4R1-205	ENST00000577667	MGAM2	Q2M2H8	2515 aa		2.53	□□□□□ -2
PPP4R1-205	ENST00000577667	HCFC1	P51610	2035 aa		2.53	□□□□□ -2
PPP4R1-205	ENST00000577667	LMO7DN	F2Z398	122 aa		2.53	□□□□□ -2
PPP4R1-205	ENST00000577667	RNF103	O00237	685 aa		2.53	□□□□□ -2
PPP4R1-205	ENST00000577667	RAD51B	O15315	384 aa		2.53	□□□□□ -2
PPP4R1-205	ENST00000577667	SNX3	O60493	162 aa		2.53	□□□□□ -2
PPP4R1-205	ENST00000577667	SLCO2B1	O94956	709 aa		2.53	□□□□□ -2
PPP4R1-205	ENST00000577667	ACSL3	O95573	720 aa		2.53	□□□□□ -2
PPP4R1-205	ENST00000577667	RPLP0	P05388	317 aa	Known RBP	2.53	□□□□□ -2
PPP4R1-205	ENST00000577667	CTSL	P07711	333 aa		2.53	□□□□□ -2
PPP4R1-205	ENST00000577667	SAG	P10523	405 aa	Predicted RBP	2.53	□□□□□ -2
PPP4R1-205	ENST00000577667	POR	P16435	677 aa	Predicted RBP	2.53	□□□□□ -2
PPP4R1-205	ENST00000577667	GAP43	P17677	238 aa		2.53	□□□□□ -2
PPP4R1-205	ENST00000577667	KLK2	P20151	261 aa		2.53	□□□□□ -2
PPP4R1-205	ENST00000577667	HNRNPA2B1	P22626	353 aa	Known RBP	2.53	□□□□□ -2
PPP4R1-205	ENST00000577667	CD82	P27701	267 aa		2.53	□□□□□ -2
PPP4R1-205	ENST00000577667	OAS2	P29728	719 aa	Known RBP	2.53	□□□□□ -2
PPP4R1-205	ENST00000577667	AKT2	P31751	481 aa		2.53	□□□□□ -2
PPP4R1-205	ENST00000577667	CASP4	P49662	377 aa		2.53	□□□□□ -2
PPP4R1-205	ENST00000577667	ASCL1	P50553	236 aa		2.53	□□□□□ -2
PPP4R1-205	ENST00000577667	NDST2	P52849	883 aa		2.53	□□□□□ -2
PPP4R1-205	ENST00000577667	YWHAG	P61981	247 aa	Known RBP eCLIP	2.53	□□□□□ -2
PPP4R1-205	ENST00000577667	INCA1	Q0VD86	236 aa		2.53	□□□□□ -2
PPP4R1-205	ENST00000577667	STK4	Q13043	487 aa		2.53	□□□□□ -2
PPP4R1-205	ENST00000577667	PRKG2	Q13237	762 aa		2.53	□□□□□ -2
PPP4R1-205	ENST00000577667	C1orf61	Q13536	156 aa		2.53	□□□□□ -2
PPP4R1-205	ENST00000577667	CUL4A	Q13619	759 aa		2.53	□□□□□ -2
PPP4R1-205	ENST00000577667	KIAA0141	Q14154	515 aa	Predicted RBP	2.53	□□□□□ -2
PPP4R1-205	ENST00000577667	C16orf72	Q14CZ0	275 aa		2.53	□□□□□ -2
PPP4R1-205	ENST00000577667	PSMD6	Q15008	389 aa		2.53	□□□□□ -2
PPP4R1-205	ENST00000577667	MEA1	Q16626	185 aa		2.53	□□□□□ -2
PPP4R1-205	ENST00000577667	DEFB109B	Q30KR1	87 aa		2.53	□□□□□ -2
PPP4R1-205	ENST00000577667	MPP7	Q5T2T1	576 aa		2.53	□□□□□ -2
PPP4R1-205	ENST00000577667	ATP1A1-AS1	Q5TC04	95 aa		2.53	□□□□□ -2
PPP4R1-205	ENST00000577667	RNLS	Q5VYX0	342 aa		2.53	□□□□□ -2
PPP4R1-205	ENST00000577667	PM20D1	Q6GTS8	502 aa		2.53	□□□□□ -2
PPP4R1-205	ENST00000577667	OR4C11	Q6IEV9	310 aa		2.53	□□□□□ -2
PPP4R1-205	ENST00000577667	SPOPL	Q6IQ16	392 aa		2.53	□□□□□ -2
PPP4R1-205	ENST00000577667	BAIAP2L2	Q6UXY1	529 aa		2.53	□□□□□ -2
PPP4R1-205	ENST00000577667	PARG	Q86W56	976 aa		2.53	□□□□□ -2
PPP4R1-205	ENST00000577667	UNC93A	Q86WB7	457 aa		2.53	□□□□□ -2
PPP4R1-205	ENST00000577667	HORMAD1	Q86X24	394 aa		2.53	□□□□□ -2
PPP4R1-205	ENST00000577667	MFN1	Q8IWA4	741 aa		2.53	□□□□□ -2
PPP4R1-205	ENST00000577667	RCOR2	Q8IZ40	523 aa		2.53	□□□□□ -2
PPP4R1-205	ENST00000577667	APCDD1	Q8J025	514 aa		2.53	□□□□□ -2
PPP4R1-205	ENST00000577667	RYBP	Q8N488	228 aa	Predicted RBP	2.53	□□□□□ -2
PPP4R1-205	ENST00000577667	CARNMT1	Q8N4J0	409 aa		2.53	□□□□□ -2
PPP4R1-205	ENST00000577667	RTL3	Q8N8U3	475 aa	Known RBP	2.53	□□□□□ -2
PPP4R1-205	ENST00000577667	LRTM2	Q8N967	370 aa		2.53	□□□□□ -2
PPP4R1-205	ENST00000577667	SPPL2A	Q8TCT8	520 aa		2.53	□□□□□ -2
PPP4R1-205	ENST00000577667	ZDHHC19	Q8WVZ1	309 aa	Predicted RBP	2.53	□□□□□ -2
PPP4R1-205	ENST00000577667	TEKT4	Q8WW24	435 aa		2.53	□□□□□ -2
PPP4R1-205	ENST00000577667	NSMAF	Q92636	917 aa		2.53	□□□□□ -2
PPP4R1-205	ENST00000577667	NAT6	Q93015	286 aa		2.53	□□□□□ -2
PPP4R1-205	ENST00000577667	TSACC	Q96A04	125 aa	Predicted RBP	2.53	□□□□□ -2
PPP4R1-205	ENST00000577667	SYAP1	Q96A49	352 aa	Predicted RBP	2.53	□□□□□ -2
PPP4R1-205	ENST00000577667	AK8	Q96MA6	479 aa		2.53	□□□□□ -2
PPP4R1-205	ENST00000577667	CATSPER2	Q96P56	530 aa		2.53	□□□□□ -2
PPP4R1-205	ENST00000577667	DGAT2	Q96PD7	388 aa		2.53	□□□□□ -2
PPP4R1-205	ENST00000577667	BTBD9	Q96Q07	612 aa		2.53	□□□□□ -2

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