RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563065.5

CCNDBP1-204, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene CCNDBP1, Length 1,450 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-204ENST00000563065 DPP10Q8N608 796 aa15.89■□□□□ 0.13
CCNDBP1-204ENST00000563065 FAM83FQ8NEG4 500 aaPredicted RBP15.89■□□□□ 0.13
CCNDBP1-204ENST00000563065 TSPEARQ8WU66 669 aa15.89■□□□□ 0.13
CCNDBP1-204ENST00000563065 CCDC106Q9BWC9 280 aa15.89■□□□□ 0.13
CCNDBP1-204ENST00000563065 QRSL1Q9H0R6 528 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
CCNDBP1-204ENST00000563065 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP15.89■□□□□ 0.13
CCNDBP1-204ENST00000563065 SLC6A5Q9Y345 797 aa15.89■□□□□ 0.13
CCNDBP1-204ENST00000563065 CAPN7Q9Y6W3 813 aa15.89■□□□□ 0.13
CCNDBP1-204ENST00000563065 SCDO00767 359 aa15.88■□□□□ 0.13
CCNDBP1-204ENST00000563065 OIP5O43482 229 aa15.88■□□□□ 0.13
CCNDBP1-204ENST00000563065 NDUFB5O43674 189 aa15.88■□□□□ 0.13
CCNDBP1-204ENST00000563065 AK1P00568 194 aa15.88■□□□□ 0.13
CCNDBP1-204ENST00000563065 LCN1P31025 176 aa15.88■□□□□ 0.13
CCNDBP1-204ENST00000563065 DSTNP60981 165 aa15.88■□□□□ 0.13
CCNDBP1-204ENST00000563065 NFYCQ13952 458 aa15.88■□□□□ 0.13
CCNDBP1-204ENST00000563065 NDUFAF6Q330K2 333 aa15.88■□□□□ 0.13
CCNDBP1-204ENST00000563065 RUNDC3AQ59EK9 446 aa15.88■□□□□ 0.13
CCNDBP1-204ENST00000563065 PDZK1Q5T2W1 519 aa15.88■□□□□ 0.13
CCNDBP1-204ENST00000563065 TREML1Q86YW5 311 aa15.88■□□□□ 0.13
CCNDBP1-204ENST00000563065 ZNF614Q8N883 585 aa15.88■□□□□ 0.13
CCNDBP1-204ENST00000563065 FADS6Q8N9I5 356 aa15.88■□□□□ 0.13
CCNDBP1-204ENST00000563065 OR2M3Q8NG83 312 aa15.88■□□□□ 0.13
CCNDBP1-204ENST00000563065 OR4K17Q8NGC6 315 aa15.88■□□□□ 0.13
CCNDBP1-204ENST00000563065 MAL2Q969L2 176 aa15.88■□□□□ 0.13
CCNDBP1-204ENST00000563065 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
CCNDBP1-204ENST00000563065 CCT8L2Q96SF2 557 aa15.88■□□□□ 0.13
CCNDBP1-204ENST00000563065 RUBCNLQ9H714 662 aa15.88■□□□□ 0.13
CCNDBP1-204ENST00000563065 EXO5Q9H790 373 aa15.88■□□□□ 0.13
CCNDBP1-204ENST00000563065 SDHAF3Q9NRP4 125 aa15.88■□□□□ 0.13
CCNDBP1-204ENST00000563065 SPRR3Q9UBC9 169 aa15.88■□□□□ 0.13
CCNDBP1-204ENST00000563065 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa15.88■□□□□ 0.13
CCNDBP1-204ENST00000563065 ADAM21Q9UKJ8 722 aa15.88■□□□□ 0.13
CCNDBP1-204ENST00000563065 WDR45Q9Y484 360 aa15.88■□□□□ 0.13
CCNDBP1-204ENST00000563065 FLNCQ14315 2725 aa15.88■□□□□ 0.13
CCNDBP1-204ENST00000563065 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa15.87■□□□□ 0.13
CCNDBP1-204ENST00000563065 NPIPA2E9PIF3 369 aa15.87■□□□□ 0.13
CCNDBP1-204ENST00000563065 NPIPA3F8WFD2 350 aa15.87■□□□□ 0.13
CCNDBP1-204ENST00000563065 SLC19A2O60779 497 aa15.87■□□□□ 0.13
CCNDBP1-204ENST00000563065 CCDC22O60826 627 aa15.87■□□□□ 0.13
CCNDBP1-204ENST00000563065 TNFRSF21O75509 655 aa15.87■□□□□ 0.13
CCNDBP1-204ENST00000563065 UGT2B17O75795 530 aa15.87■□□□□ 0.13
CCNDBP1-204ENST00000563065 HPNP05981 417 aa15.87■□□□□ 0.13
CCNDBP1-204ENST00000563065 NR2F1P10589 423 aa15.87■□□□□ 0.13
CCNDBP1-204ENST00000563065 KCNC4Q03721 635 aa15.87■□□□□ 0.13
CCNDBP1-204ENST00000563065 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP15.87■□□□□ 0.13
CCNDBP1-204ENST00000563065 C17orf67Q0P5P2 114 aa15.87■□□□□ 0.13
CCNDBP1-204ENST00000563065 C1QL3Q5VWW1 255 aa15.87■□□□□ 0.13
CCNDBP1-204ENST00000563065 REP15Q6BDI9 236 aa15.87■□□□□ 0.13
CCNDBP1-204ENST00000563065 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa15.87■□□□□ 0.13
CCNDBP1-204ENST00000563065 SLC38A5Q8WUX1 472 aa15.87■□□□□ 0.13
CCNDBP1-204ENST00000563065 ARSGQ96EG1 525 aa15.87■□□□□ 0.13
CCNDBP1-204ENST00000563065 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
CCNDBP1-204ENST00000563065 CGREF1Q99674 301 aa15.87■□□□□ 0.13
CCNDBP1-204ENST00000563065 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
CCNDBP1-204ENST00000563065 SLC39A3Q9BRY0 314 aa15.87■□□□□ 0.13
CCNDBP1-204ENST00000563065 HOXD1Q9GZZ0 328 aa15.87■□□□□ 0.13
CCNDBP1-204ENST00000563065 SAP130Q9H0E3 1048 aa15.87■□□□□ 0.13
CCNDBP1-204ENST00000563065 MYLK2Q9H1R3 596 aa15.87■□□□□ 0.13
CCNDBP1-204ENST00000563065 SLC38A1Q9H2H9 487 aa15.87■□□□□ 0.13
CCNDBP1-204ENST00000563065 ACKR4Q9NPB9 350 aa15.87■□□□□ 0.13
CCNDBP1-204ENST00000563065 QPCTLQ9NXS2 382 aa15.87■□□□□ 0.13
CCNDBP1-204ENST00000563065 TINAGQ9UJW2 476 aa15.87■□□□□ 0.13
CCNDBP1-204ENST00000563065 ZNF835Q9Y2P0 537 aa15.87■□□□□ 0.13
CCNDBP1-204ENST00000563065 DTNAQ9Y4J8 743 aa15.87■□□□□ 0.13
CCNDBP1-204ENST00000563065 A0A1B0GVC2 190 aa15.86■□□□□ 0.13
CCNDBP1-204ENST00000563065 KIAA0513O60268 411 aa15.86■□□□□ 0.13
CCNDBP1-204ENST00000563065 ZIC3O60481 467 aa15.86■□□□□ 0.13
CCNDBP1-204ENST00000563065 BCHEP06276 602 aa15.86■□□□□ 0.13
CCNDBP1-204ENST00000563065 TFPTP0C1Z6 253 aa15.86■□□□□ 0.13
CCNDBP1-204ENST00000563065 ABOP16442 354 aa15.86■□□□□ 0.13
CCNDBP1-204ENST00000563065 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
CCNDBP1-204ENST00000563065 PTGS2P35354 604 aa15.86■□□□□ 0.13
CCNDBP1-204ENST00000563065 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
CCNDBP1-204ENST00000563065 MTPNP58546 118 aa15.86■□□□□ 0.13
CCNDBP1-204ENST00000563065 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
CCNDBP1-204ENST00000563065 C3AR1Q16581 482 aa15.86■□□□□ 0.13
CCNDBP1-204ENST00000563065 MMEL1Q495T6 779 aa15.86■□□□□ 0.13
CCNDBP1-204ENST00000563065 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
CCNDBP1-204ENST00000563065 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa15.86■□□□□ 0.13
CCNDBP1-204ENST00000563065 C3P1Q6ZMU1 363 aa15.86■□□□□ 0.13
CCNDBP1-204ENST00000563065 NEIL3Q8TAT5 605 aa15.86■□□□□ 0.13
CCNDBP1-204ENST00000563065 ANKRD27Q96NW4 1050 aa15.86■□□□□ 0.13
CCNDBP1-204ENST00000563065 LIPT1Q9Y234 373 aa15.86■□□□□ 0.13
CCNDBP1-204ENST00000563065 RPH3AQ9Y2J0 694 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
CCNDBP1-204ENST00000563065 COL12A1Q99715 3063 aa15.86■□□□□ 0.13
CCNDBP1-204ENST00000563065 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa15.85■□□□□ 0.13
CCNDBP1-204ENST00000563065 A0A1W2PQD3 144 aa15.85■□□□□ 0.13
CCNDBP1-204ENST00000563065 CLDN24A6NM45 220 aa15.85■□□□□ 0.13
CCNDBP1-204ENST00000563065 MRASO14807 208 aa15.85■□□□□ 0.13
CCNDBP1-204ENST00000563065 SUSD5O60279 629 aa15.85■□□□□ 0.13
CCNDBP1-204ENST00000563065 HCN1O60741 890 aa15.85■□□□□ 0.13
CCNDBP1-204ENST00000563065 SEMA7AO75326 666 aa15.85■□□□□ 0.13
CCNDBP1-204ENST00000563065 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
CCNDBP1-204ENST00000563065 DPP4P27487 766 aa15.85■□□□□ 0.13
CCNDBP1-204ENST00000563065 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
CCNDBP1-204ENST00000563065 ZNF117Q03924 483 aa15.85■□□□□ 0.13
CCNDBP1-204ENST00000563065 RBPJQ06330 500 aa15.85■□□□□ 0.13
CCNDBP1-204ENST00000563065 ZNF141Q15928 474 aa15.85■□□□□ 0.13
CCNDBP1-204ENST00000563065 AP1ARQ63HQ0 302 aa15.85■□□□□ 0.13
CCNDBP1-204ENST00000563065 CBLN3Q6UW01 205 aa15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.3 ms