RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560424.1

SMAD3-215, Transcript of SMAD family member 3, humanhuman

TSL 3

Gene SMAD3, Length 775 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3-215ENST00000560424 OR9I1Q8NGQ6 314 aa8.43□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
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SMAD3-215ENST00000560424 MTERF3Q96E29 417 aa8.43□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 ART5Q96L15 291 aa8.43□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 TEX37Q96LM6 180 aa8.43□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 QRFPRQ96P65 431 aa8.43□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 ZBTB18Q99592 522 aa8.43□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 SLC39A3Q9BRY0 314 aa8.43□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 CENPKQ9BS16 269 aa8.43□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 C1orf50Q9BV19 199 aa8.43□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 ZNF717Q9BY31 904 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 RASSF4Q9H2L5 321 aa8.43□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 SH2D2AQ9NP31 389 aa8.43□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 LPAR3Q9UBY5 353 aa8.43□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 MCM8Q9UJA3 840 aa8.43□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa8.43□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 SPACA6W5XKT8 324 aa8.43□□□□□ -1.06
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SMAD3-215ENST00000560424 FREM3P0C091 2139 aa8.42□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 ABCA1O95477 2261 aa8.42□□□□□ -1.06
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SMAD3-215ENST00000560424 ANKRD65E5RJM6 399 aa8.42□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 MSTNO14793 375 aa8.42□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 MRASO14807 208 aa8.42□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 ANGPT2O15123 496 aa8.42□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 CFLARO15519 480 aa8.42□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 LDB3O75112 727 aa8.42□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 SOX30O94993 753 aa8.42□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 SCELO95171 688 aa8.42□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 SNX4O95219 450 aa8.42□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 ACTL6AO96019 429 aa8.42□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 SMIM10L1P0DMW3 83 aa8.42□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 CHMP24386 653 aa8.42□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 PGM1P36871 562 aa8.42□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 NUDT2P50583 147 aa8.42□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 PLA2G16P53816 162 aa8.42□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 MTTPP55157 894 aa8.42□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
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SMAD3-215ENST00000560424 MXRA7P84157 204 aa8.42□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 SLC25A3Q00325 362 aa8.42□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 ZNF763Q0D2J5 394 aa8.42□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 RIPK1Q13546 671 aa8.42□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 PTGR1Q14914 329 aa8.42□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 MMEL1Q495T6 779 aa8.42□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 EIPR1Q53HC9 387 aa8.42□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 ADNP2Q6IQ32 1131 aa8.42□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 ZNF704Q6ZNC4 412 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 CHMP1BQ7LBR1 199 aa8.42□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 PAGE2Q7Z2X7 111 aa8.42□□□□□ -1.06
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SMAD3-215ENST00000560424 COMMD6Q7Z4G1 85 aa8.42□□□□□ -1.06
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SMAD3-215ENST00000560424 ZNF721Q8TF20 911 aa8.42□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 WNT2BQ93097 391 aa8.42□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 MCUR1Q96AQ8 359 aa8.42□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 SMIM10Q96HG1 83 aa8.42□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 GNRHR2Q96P88 292 aa8.42□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 DGAT2Q96PD7 388 aa8.42□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 HS3ST6Q96QI5 342 aa8.42□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 SERINC2Q96SA4 455 aa8.42□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 KCNK17Q96T54 332 aa8.42□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 TUBA1CQ9BQE3 449 aa8.42□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 PIGQQ9BRB3 760 aa8.42□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 DPY30Q9C005 99 aa8.42□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 SHARPINQ9H0F6 387 aa8.42□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 MYNNQ9NPC7 610 aa8.42□□□□□ -1.06
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SMAD3-215ENST00000560424 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
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SMAD3-215ENST00000560424 LAMP3Q9UQV4 416 aa8.42□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 C15orf41Q9Y2V0 281 aa8.42□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 GMEB1Q9Y692 573 aa8.42□□□□□ -1.06
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SMAD3-215ENST00000560424 FXYD1O00168 92 aa8.41□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 NR5A2O00482 541 aa8.41□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 PLPP1O14494 284 aa8.41□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 AIM2O14862 343 aa8.41□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 PCDH7O60245 1069 aa8.41□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 MGRN1O60291 552 aa8.41□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 TGFB1P01137 390 aa8.41□□□□□ -1.06
SMAD3-215ENST00000560424 PGRP06401 933 aa8.41□□□□□ -1.06
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