RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560272.1

LINS1-208, Transcript of lines homolog 1, human

TSL 2

Gene LINS1, Length 558 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LINS1-208	ENST00000560272	SERPINB4	P48594	390 aa		5.36	□□□□□ -1.55
LINS1-208	ENST00000560272	ZNF41	P51814	821 aa	Predicted RBP	5.36	□□□□□ -1.55
LINS1-208	ENST00000560272	SUCLG1	P53597	346 aa	Known RBP	5.36	□□□□□ -1.55
LINS1-208	ENST00000560272	PRKAG1	P54619	331 aa		5.36	□□□□□ -1.55
LINS1-208	ENST00000560272	NR1H2	P55055	460 aa		5.36	□□□□□ -1.55
LINS1-208	ENST00000560272	FOXA1	P55317	472 aa		5.36	□□□□□ -1.55
LINS1-208	ENST00000560272	TPD52	P55327	224 aa	Predicted RBP	5.36	□□□□□ -1.55
LINS1-208	ENST00000560272	DNAJB13	P59910	316 aa		5.36	□□□□□ -1.55
LINS1-208	ENST00000560272	HSPB3	Q12988	150 aa		5.36	□□□□□ -1.55
LINS1-208	ENST00000560272	SLC29A2	Q14542	456 aa		5.36	□□□□□ -1.55
LINS1-208	ENST00000560272	EXOC3L2	Q2M3D2	409 aa		5.36	□□□□□ -1.55
LINS1-208	ENST00000560272	CCDC153	Q494R4	210 aa		5.36	□□□□□ -1.55
LINS1-208	ENST00000560272	BEX5	Q5H9J7	111 aa		5.36	□□□□□ -1.55
LINS1-208	ENST00000560272	PDSS1	Q5T2R2	415 aa		5.36	□□□□□ -1.55
LINS1-208	ENST00000560272	GTF2IRD2B	Q6EKJ0	949 aa		5.36	□□□□□ -1.55
LINS1-208	ENST00000560272	NOXRED1	Q6NXP6	359 aa		5.36	□□□□□ -1.55
LINS1-208	ENST00000560272	FRMD7	Q6ZUT3	714 aa		5.36	□□□□□ -1.55
LINS1-208	ENST00000560272	PLEKHM3	Q6ZWE6	761 aa		5.36	□□□□□ -1.55
LINS1-208	ENST00000560272	ZNF550	Q7Z398	422 aa		5.36	□□□□□ -1.55
LINS1-208	ENST00000560272	SZRD1	Q7Z422	152 aa		5.36	□□□□□ -1.55
LINS1-208	ENST00000560272	GTF2IRD2	Q86UP8	949 aa		5.36	□□□□□ -1.55
LINS1-208	ENST00000560272	MISP	Q8IVT2	679 aa		5.36	□□□□□ -1.55
LINS1-208	ENST00000560272	CEP112	Q8N8E3	955 aa		5.36	□□□□□ -1.55
LINS1-208	ENST00000560272	CDRT4	Q8N9R6	151 aa		5.36	□□□□□ -1.55
LINS1-208	ENST00000560272	ZNF610	Q8N9Z0	462 aa		5.36	□□□□□ -1.55
LINS1-208	ENST00000560272	OR6Y1	Q8NGX8	325 aa		5.36	□□□□□ -1.55
LINS1-208	ENST00000560272	OR6K3	Q8NGY3	331 aa		5.36	□□□□□ -1.55
LINS1-208	ENST00000560272	PUM2	Q8TB72	1066 aa	Known RBP eCLIP	5.36	□□□□□ -1.55
LINS1-208	ENST00000560272	ZBTB8A	Q96BR9	441 aa		5.36	□□□□□ -1.55
LINS1-208	ENST00000560272	PPCDC	Q96CD2	204 aa		5.36	□□□□□ -1.55
LINS1-208	ENST00000560272	ZBED6CL	Q96FA7	236 aa	Predicted RBP	5.36	□□□□□ -1.55
LINS1-208	ENST00000560272	PERP	Q96FX8	193 aa		5.36	□□□□□ -1.55
LINS1-208	ENST00000560272	GMPPA	Q96IJ6	420 aa	Predicted RBP	5.36	□□□□□ -1.55
LINS1-208	ENST00000560272	COX4I2	Q96KJ9	171 aa		5.36	□□□□□ -1.55
LINS1-208	ENST00000560272		Q96MF0	132 aa		5.36	□□□□□ -1.55
LINS1-208	ENST00000560272	MS4A4E	Q96PG1	132 aa		5.36	□□□□□ -1.55
LINS1-208	ENST00000560272	LRTM1	Q9HBL6	345 aa		5.36	□□□□□ -1.55
LINS1-208	ENST00000560272	GLRX2	Q9NS18	164 aa		5.36	□□□□□ -1.55
LINS1-208	ENST00000560272	TBK1	Q9UHD2	729 aa		5.36	□□□□□ -1.55
LINS1-208	ENST00000560272	MID2	Q9UJV3	735 aa		5.36	□□□□□ -1.55
LINS1-208	ENST00000560272	VDAC3	Q9Y277	283 aa		5.36	□□□□□ -1.55
LINS1-208	ENST00000560272	EML6	Q6ZMW3	1958 aa		5.36	□□□□□ -1.55
LINS1-208	ENST00000560272	ANKHD1	Q8IWZ3	2542 aa	Known RBP	5.35	□□□□□ -1.55
LINS1-208	ENST00000560272	DNAJC13	O75165	2243 aa		5.35	□□□□□ -1.55
LINS1-208	ENST00000560272	MED13L	Q71F56	2210 aa		5.35	□□□□□ -1.55
LINS1-208	ENST00000560272	MBD3L2B	A0A1B0GVZ6	204 aa	Predicted RBP	5.35	□□□□□ -1.55
LINS1-208	ENST00000560272	GXYLT2	A0PJZ3	443 aa		5.35	□□□□□ -1.55
LINS1-208	ENST00000560272	C7orf72	A4D263	438 aa		5.35	□□□□□ -1.55
LINS1-208	ENST00000560272	SHISA8	B8ZZ34	492 aa		5.35	□□□□□ -1.55
LINS1-208	ENST00000560272	ALG1L2	C9J202	215 aa		5.35	□□□□□ -1.55
LINS1-208	ENST00000560272		G3V2L1	256 aa		5.35	□□□□□ -1.55
LINS1-208	ENST00000560272		H7C1Q1	480 aa		5.35	□□□□□ -1.55
LINS1-208	ENST00000560272	SMAD7	O15105	426 aa	Known RBP	5.35	□□□□□ -1.55
LINS1-208	ENST00000560272	TMCC2	O75069	709 aa		5.35	□□□□□ -1.55
LINS1-208	ENST00000560272	SS18L1	O75177	396 aa	Predicted RBP	5.35	□□□□□ -1.55
LINS1-208	ENST00000560272	AQP8	O94778	261 aa		5.35	□□□□□ -1.55
LINS1-208	ENST00000560272	NKX2-2	O95096	273 aa		5.35	□□□□□ -1.55
LINS1-208	ENST00000560272	OXSR1	O95747	527 aa	Predicted RBP	5.35	□□□□□ -1.55
LINS1-208	ENST00000560272	LY6G6D	O95868	133 aa		5.35	□□□□□ -1.55
LINS1-208	ENST00000560272	NGFR	P08138	427 aa		5.35	□□□□□ -1.55
LINS1-208	ENST00000560272	ALOX5	P09917	674 aa		5.35	□□□□□ -1.55
LINS1-208	ENST00000560272	PABPC4L	P0CB38	370 aa	Known RBP	5.35	□□□□□ -1.55
LINS1-208	ENST00000560272	NEFH	P12036	1026 aa		5.35	□□□□□ -1.55
LINS1-208	ENST00000560272	CPA3	P15088	417 aa		5.35	□□□□□ -1.55
LINS1-208	ENST00000560272	PRPH2	P23942	346 aa		5.35	□□□□□ -1.55
LINS1-208	ENST00000560272	LCN1	P31025	176 aa		5.35	□□□□□ -1.55
LINS1-208	ENST00000560272	EIF1	P41567	113 aa	Known RBP	5.35	□□□□□ -1.55
LINS1-208	ENST00000560272	PRIM2	P49643	509 aa		5.35	□□□□□ -1.55
LINS1-208	ENST00000560272	MANF	P55145	182 aa	Known RBP	5.35	□□□□□ -1.55
LINS1-208	ENST00000560272	RAC1	P63000	192 aa		5.35	□□□□□ -1.55
LINS1-208	ENST00000560272	PPP2R2B	Q00005	443 aa		5.35	□□□□□ -1.55
LINS1-208	ENST00000560272	GUSBP1	Q15486	140 aa		5.35	□□□□□ -1.55
LINS1-208	ENST00000560272	CPEB4	Q17RY0	729 aa	Known RBP eCLIP	5.35	□□□□□ -1.55
LINS1-208	ENST00000560272	PRSS53	Q2L4Q9	553 aa		5.35	□□□□□ -1.55
LINS1-208	ENST00000560272	TMEM44	Q2T9K0	475 aa		5.35	□□□□□ -1.55
LINS1-208	ENST00000560272	GRAMD1B	Q3KR37	738 aa		5.35	□□□□□ -1.55
LINS1-208	ENST00000560272	LIPM	Q5VYY2	423 aa		5.35	□□□□□ -1.55
LINS1-208	ENST00000560272	ANKRD34A	Q69YU3	496 aa		5.35	□□□□□ -1.55
LINS1-208	ENST00000560272	ZCCHC12	Q6PEW1	402 aa		5.35	□□□□□ -1.55
LINS1-208	ENST00000560272	ZNF704	Q6ZNC4	412 aa	Predicted RBP	5.35	□□□□□ -1.55
LINS1-208	ENST00000560272	BEND4	Q6ZU67	534 aa		5.35	□□□□□ -1.55
LINS1-208	ENST00000560272	ZNF551	Q7Z340	670 aa	Predicted RBP	5.35	□□□□□ -1.55
LINS1-208	ENST00000560272	R3HCC1L	Q7Z5L2	792 aa	Known RBP	5.35	□□□□□ -1.55
LINS1-208	ENST00000560272	GGN	Q86UU5	652 aa		5.35	□□□□□ -1.55
LINS1-208	ENST00000560272	GTPBP8	Q8N3Z3	284 aa	Predicted RBP	5.35	□□□□□ -1.55
LINS1-208	ENST00000560272	COX18	Q8N8Q8	333 aa		5.35	□□□□□ -1.55
LINS1-208	ENST00000560272	ZNF527	Q8NB42	609 aa		5.35	□□□□□ -1.55
LINS1-208	ENST00000560272	NUP43	Q8NFH3	380 aa		5.35	□□□□□ -1.55
LINS1-208	ENST00000560272	OR10D3	Q8NH80	312 aa		5.35	□□□□□ -1.55
LINS1-208	ENST00000560272	OR2V1	Q8NHB1	315 aa		5.35	□□□□□ -1.55
LINS1-208	ENST00000560272	ACTRT2	Q8TDY3	377 aa		5.35	□□□□□ -1.55
LINS1-208	ENST00000560272	MZB1	Q8WU39	189 aa		5.35	□□□□□ -1.55
LINS1-208	ENST00000560272	TMEM171	Q8WVE6	324 aa		5.35	□□□□□ -1.55
LINS1-208	ENST00000560272	PIK3R3	Q92569	461 aa		5.35	□□□□□ -1.55
LINS1-208	ENST00000560272	SLC9A6	Q92581	669 aa		5.35	□□□□□ -1.55
LINS1-208	ENST00000560272	JADE3	Q92613	823 aa		5.35	□□□□□ -1.55
LINS1-208	ENST00000560272	ARSG	Q96EG1	525 aa		5.35	□□□□□ -1.55
LINS1-208	ENST00000560272	CHMP6	Q96FZ7	201 aa		5.35	□□□□□ -1.55
LINS1-208	ENST00000560272	ZNF764	Q96H86	408 aa	Predicted RBP	5.35	□□□□□ -1.55
LINS1-208	ENST00000560272	REXO5	Q96IC2	774 aa	Known RBP	5.35	□□□□□ -1.55

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