RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555562.1

FOXN3-AS1-201, FOXN3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene FOXN3-AS1, Length 1,077 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PCYT1AP49585 367 aa17.56■□□□□ 0.4
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 EMX2Q04743 252 aa17.56■□□□□ 0.4
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CT45A2Q5DJT8 189 aa17.56■□□□□ 0.4
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP17.56■□□□□ 0.4
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MAVSQ7Z434 540 aa17.56■□□□□ 0.4
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 GRAMD2AQ8IUY3 354 aa17.56■□□□□ 0.4
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP17.56■□□□□ 0.4
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP17.56■□□□□ 0.4
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 GCNT2Q8N0V5 402 aa17.56■□□□□ 0.4
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 LRRC8CQ8TDW0 803 aa17.56■□□□□ 0.4
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ELP4Q96EB1 424 aa17.56■□□□□ 0.4
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 C18orf12Q96KH6 178 aa17.56■□□□□ 0.4
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MAGEB18Q96M61 343 aa17.56■□□□□ 0.4
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 VSTM2LQ96N03 204 aa17.56■□□□□ 0.4
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SFXN2Q96NB2 322 aa17.56■□□□□ 0.4
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 C1orf50Q9BV19 199 aa17.56■□□□□ 0.4
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa17.56■□□□□ 0.4
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FBXL2Q9UKC9 423 aa17.56■□□□□ 0.4
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SLCO1B7G3V0H7 640 aa17.55■□□□□ 0.4
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MSTNO14793 375 aa17.55■□□□□ 0.4
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP17.55■□□□□ 0.4
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ZIC3O60481 467 aa17.55■□□□□ 0.4
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CRHP06850 196 aa17.55■□□□□ 0.4
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ZNF708P17019 499 aa17.55■□□□□ 0.4
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PNLIPRP2P54317 469 aa17.55■□□□□ 0.4
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CLDN18P56856 261 aa17.55■□□□□ 0.4
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP17.55■□□□□ 0.4
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PDE7AQ13946 482 aa17.55■□□□□ 0.4
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 VPS26BQ4G0F5 336 aa17.55■□□□□ 0.4
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CPTPQ5TA50 214 aa17.55■□□□□ 0.4
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 IL23RQ5VWK5 629 aa17.55■□□□□ 0.4
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SHEQ5VZ18 495 aa17.55■□□□□ 0.4
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa17.55■□□□□ 0.4
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PLXDC2Q6UX71 529 aa17.55■□□□□ 0.4
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SZRD1Q7Z422 152 aa17.55■□□□□ 0.4
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 OR2L13Q8N349 312 aa17.55■□□□□ 0.4
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP17.55■□□□□ 0.4
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ANKRA2Q9H9E1 313 aa17.55■□□□□ 0.4
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 Q9N2J8 555 aa17.55■□□□□ 0.4
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP17.55■□□□□ 0.4
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ATP6V1HQ9UI12 483 aa17.55■□□□□ 0.4
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 DKKL1Q9UK85 242 aa17.55■□□□□ 0.4
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa17.54■□□□□ 0.4
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 A0A1W2PNV4 684 aa17.54■□□□□ 0.4
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 A0A1W2PPR1 153 aa17.54■□□□□ 0.4
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 DYNC1I1O14576 645 aa17.54■□□□□ 0.4
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 HCRTR2O43614 444 aa17.54■□□□□ 0.4
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TNFSF13O75888 250 aa17.54■□□□□ 0.4
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TGM6O95932 706 aa17.54■□□□□ 0.4
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 DPP4P27487 766 aa17.54■□□□□ 0.4
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP17.54■□□□□ 0.4
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CORO7P57737 925 aa17.54■□□□□ 0.4
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 C21orf58P58505 322 aa17.54■□□□□ 0.4
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PRR5P85299 388 aa17.54■□□□□ 0.4
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 LTBQ06643 244 aa17.54■□□□□ 0.4
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP17.54■□□□□ 0.4
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CYP27C1Q4G0S4 372 aa17.54■□□□□ 0.4
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 OR5M10Q6IEU7 315 aa17.54■□□□□ 0.4
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 OR2A2Q6IF42 318 aa17.54■□□□□ 0.4
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 OGFOD2Q6N063 350 aa17.54■□□□□ 0.4
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CHMP1BQ7LBR1 199 aa17.54■□□□□ 0.4
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ZNF551Q7Z340 670 aaPredicted RBP17.54■□□□□ 0.4
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RNF138Q8WVD3 245 aa17.54■□□□□ 0.4
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CIDECQ96AQ7 238 aaPredicted RBP17.54■□□□□ 0.4
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 DNHD1Q96M86 4753 aa17.53■□□□□ 0.4
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TRPC5OSA6NMA1 111 aa17.53■□□□□ 0.4
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 UPK1AO00322 258 aa17.53■□□□□ 0.4
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ARHGEF9O43307 516 aa17.53■□□□□ 0.4
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 INHBBP09529 407 aa17.53■□□□□ 0.4
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP17.53■□□□□ 0.4
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 GAS1P54826 345 aa17.53■□□□□ 0.4
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PTGR1Q14914 329 aa17.53■□□□□ 0.4
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 DECR1Q16698 335 aa17.53■□□□□ 0.4
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 HSP90B2PQ58FF3 399 aa17.53■□□□□ 0.4
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 P4HA3Q7Z4N8 544 aa17.53■□□□□ 0.4
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP17.53■□□□□ 0.4
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa17.53■□□□□ 0.4
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RIMKLAQ8IXN7 391 aa17.53■□□□□ 0.4
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 DYDC1Q8WWB3 177 aa17.53■□□□□ 0.4
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PPP1R36Q96LQ0 422 aa17.53■□□□□ 0.4
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TESMINQ9Y4I5 508 aa17.53■□□□□ 0.4
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 NME6O75414 186 aaPredicted RBP17.52■□□□□ 0.4
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 KITP10721 976 aa17.52■□□□□ 0.4
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PEPDP12955 493 aa17.52■□□□□ 0.4
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FRKP42685 505 aaPredicted RBP17.52■□□□□ 0.4
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CLK3P49761 638 aaKnown RBP17.52■□□□□ 0.4
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 DSCR4P56555 118 aaPredicted RBP17.52■□□□□ 0.4
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 B3GALT5-AS1P59052 145 aa17.52■□□□□ 0.4
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FAM27E3Q08E93 113 aa17.52■□□□□ 0.4
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MLC1Q15049 377 aa17.52■□□□□ 0.4
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ZNF385BQ569K4 471 aa17.52■□□□□ 0.4
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 NPSR1Q6W5P4 371 aa17.52■□□□□ 0.4
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa17.52■□□□□ 0.4
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 OR4K17Q8NGC6 315 aa17.52■□□□□ 0.4
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 STARD4Q96DR4 205 aa17.52■□□□□ 0.4
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MS4A4EQ96PG1 132 aa17.52■□□□□ 0.4
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PIP5K1AQ99755 562 aa17.52■□□□□ 0.4
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SMR3AQ99954 134 aa17.52■□□□□ 0.4
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MED12LQ86YW9 2145 aa17.51■□□□□ 0.39
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 A0A1W2PRB8 838 aa17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.8 ms