RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550358.5

PTPRB-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRB, Length 6,583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-208ENST00000550358 NRMQ8IXM6 262 aa8□□□□□ -1.13
PTPRB-208ENST00000550358 OR8H3Q8N146 312 aa8□□□□□ -1.13
PTPRB-208ENST00000550358 TMEM178AQ8NBL3 297 aa8□□□□□ -1.13
PTPRB-208ENST00000550358 TMEM163Q8TC26 289 aa8□□□□□ -1.13
PTPRB-208ENST00000550358 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
PTPRB-208ENST00000550358 ATOH8Q96SQ7 321 aa8□□□□□ -1.13
PTPRB-208ENST00000550358 BOCQ9BWV1 1114 aa8□□□□□ -1.13
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PTPRB-208ENST00000550358 GPR45Q9Y5Y3 372 aa8□□□□□ -1.13
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PTPRB-208ENST00000550358 H7C1Q1 480 aa8□□□□□ -1.13
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PTPRB-208ENST00000550358 BDH1Q02338 343 aa8□□□□□ -1.13
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PTPRB-208ENST00000550358 LETMD1Q6P1Q0 360 aa8□□□□□ -1.13
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PTPRB-208ENST00000550358 ZPBPQ9BS86 351 aa8□□□□□ -1.13
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PTPRB-208ENST00000550358 ETFAP13804 333 aa8□□□□□ -1.13
PTPRB-208ENST00000550358 CCNOP22674 350 aa8□□□□□ -1.13
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PTPRB-208ENST00000550358 MMP12P39900 470 aa8□□□□□ -1.13
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PTPRB-208ENST00000550358 TAP2Q03519 686 aa8□□□□□ -1.13
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PTPRB-208ENST00000550358 SYT4Q9H2B2 425 aa8□□□□□ -1.13
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PTPRB-208ENST00000550358 NEIL2Q969S2 332 aa8□□□□□ -1.13
PTPRB-208ENST00000550358 TMEM203Q969S6 136 aa8□□□□□ -1.13
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PTPRB-208ENST00000550358 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
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PTPRB-208ENST00000550358 PRRT1Q99946 306 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRB-208ENST00000550358 LINC00597Q9H2U6 94 aa7.99□□□□□ -1.13
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