RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546654.1

RPL41-205, Transcript of ribosomal protein L41, human

TSL 2

Gene RPL41, Length 238 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPL41-205	ENST00000546654	GGT5	P36269	586 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPL41-205	ENST00000546654	SUCLG1	P53597	346 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RPL41-205	ENST00000546654	DSCR4	P56555	118 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RPL41-205	ENST00000546654	CLDN15	P56746	228 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPL41-205	ENST00000546654	SNRPD2	P62316	118 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RPL41-205	ENST00000546654	HERVK_113	P63132	956 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPL41-205	ENST00000546654	ERVK-8	P63133	956 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPL41-205	ENST00000546654	SLC18A2	Q05940	514 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPL41-205	ENST00000546654	TGM3	Q08188	693 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPL41-205	ENST00000546654	RASGEF1B	Q0VAM2	473 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPL41-205	ENST00000546654	HLX	Q14774	488 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RPL41-205	ENST00000546654	RBBP5	Q15291	538 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RPL41-205	ENST00000546654	TGFBI	Q15582	683 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPL41-205	ENST00000546654	OR4D1	Q15615	310 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPL41-205	ENST00000546654	TSN	Q15631	228 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RPL41-205	ENST00000546654	TAF9	Q16594	264 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPL41-205	ENST00000546654	PPP1R3A	Q16821	1122 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPL41-205	ENST00000546654	SWI5	Q1ZZU3	235 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPL41-205	ENST00000546654	SPRED3	Q2MJR0	410 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPL41-205	ENST00000546654	CCDC153	Q494R4	210 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPL41-205	ENST00000546654	TIMM23B	Q5SRD1	257 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPL41-205	ENST00000546654	SULT1C3	Q6IMI6	304 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPL41-205	ENST00000546654	TMEM64	Q6YI46	380 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPL41-205	ENST00000546654	RHOU	Q7L0Q8	258 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPL41-205	ENST00000546654	BHLHA15	Q7RTS1	189 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RPL41-205	ENST00000546654	SLC46A3	Q7Z3Q1	461 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPL41-205	ENST00000546654	TRABD2A	Q86V40	505 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPL41-205	ENST00000546654	SPNS2	Q8IVW8	549 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPL41-205	ENST00000546654	KLHDC8A	Q8IYD2	350 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPL41-205	ENST00000546654	CCDC116	Q8IYX3	515 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPL41-205	ENST00000546654	GOLGA6L1	Q8N7Z2	621 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPL41-205	ENST00000546654	ANKRD53	Q8N9V6	530 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPL41-205	ENST00000546654	C17orf47	Q8NEP4	570 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPL41-205	ENST00000546654	OR56A3	Q8NH54	315 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPL41-205	ENST00000546654	EXT2	Q93063	718 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPL41-205	ENST00000546654	MS4A6E	Q96DS6	147 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPL41-205	ENST00000546654	GPR78	Q96P69	363 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPL41-205	ENST00000546654	ATOH8	Q96SQ7	321 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPL41-205	ENST00000546654	CSF3R	Q99062	836 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPL41-205	ENST00000546654	VRK1	Q99986	396 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RPL41-205	ENST00000546654	ERVK-6	Q9BXR3	956 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPL41-205	ENST00000546654	ROGDI	Q9GZN7	287 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPL41-205	ENST00000546654	IQCG	Q9H095	443 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RPL41-205	ENST00000546654	RAB1B	Q9H0U4	201 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPL41-205	ENST00000546654	MRPL46	Q9H2W6	279 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RPL41-205	ENST00000546654	CNOT10	Q9H9A5	744 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RPL41-205	ENST00000546654	VIPAS39	Q9H9C1	493 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPL41-205	ENST00000546654	FKRP	Q9H9S5	495 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPL41-205	ENST00000546654	PELI2	Q9HAT8	420 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPL41-205	ENST00000546654	FOLH1B	Q9HBA9	442 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPL41-205	ENST00000546654	LYRM4	Q9HD34	91 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPL41-205	ENST00000546654	MYNN	Q9NPC7	610 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPL41-205	ENST00000546654	GPRC5B	Q9NZH0	403 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPL41-205	ENST00000546654	NUDT4	Q9NZJ9	180 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPL41-205	ENST00000546654	MCTS1	Q9ULC4	181 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RPL41-205	ENST00000546654	GRID1	Q9ULK0	1009 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPL41-205	ENST00000546654	MOK	Q9UQ07	419 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPL41-205	ENST00000546654	ERVK-19	Q9WJR5	959 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPL41-205	ENST00000546654	LOC105371242	A0A075B767	164 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPL41-205	ENST00000546654		A0A0G2JN53	185 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPL41-205	ENST00000546654	C2orf72	A6NCS6	295 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPL41-205	ENST00000546654	PRAMEF25	A6NGN4	478 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPL41-205	ENST00000546654	DNAJC9-AS1	A6NH13	148 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPL41-205	ENST00000546654	NCF1B	A6NI72	391 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RPL41-205	ENST00000546654	NCF1C	A8MVU1	366 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RPL41-205	ENST00000546654	CLDN34	H7C241	214 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPL41-205	ENST00000546654		J3QLI3	93 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPL41-205	ENST00000546654	UBXN8	O00124	270 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPL41-205	ENST00000546654	H2AFY	O75367	372 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RPL41-205	ENST00000546654	STK16	O75716	305 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPL41-205	ENST00000546654	PRSS23	O95084	383 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPL41-205	ENST00000546654	AIFM1	O95831	613 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPL41-205	ENST00000546654	ADA	P00813	363 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPL41-205	ENST00000546654	PABPC4L	P0CB38	370 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RPL41-205	ENST00000546654	MTHFD2	P13995	350 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPL41-205	ENST00000546654	GFAP	P14136	432 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPL41-205	ENST00000546654	NCF1	P14598	390 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RPL41-205	ENST00000546654	IFNGR1	P15260	489 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPL41-205	ENST00000546654	ADRA2C	P18825	462 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPL41-205	ENST00000546654	ABCD3	P28288	659 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPL41-205	ENST00000546654	GALNS	P34059	522 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPL41-205	ENST00000546654	PTGDS	P41222	190 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPL41-205	ENST00000546654	ALDH18A1	P54886	795 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RPL41-205	ENST00000546654	B3GALT5-AS1	P59052	145 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPL41-205	ENST00000546654	REEP5	Q00765	189 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPL41-205	ENST00000546654	MAP4K2	Q12851	820 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPL41-205	ENST00000546654	CCNI	Q14094	377 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPL41-205	ENST00000546654	ZNF267	Q14586	743 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RPL41-205	ENST00000546654	TSC22D1	Q15714	1073 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPL41-205	ENST00000546654	STK11	Q15831	433 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPL41-205	ENST00000546654	KLHL22	Q53GT1	634 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPL41-205	ENST00000546654	TECRL	Q5HYJ1	363 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPL41-205	ENST00000546654	TCHHL1	Q5QJ38	904 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RPL41-205	ENST00000546654	TMEM201	Q5SNT2	666 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPL41-205	ENST00000546654	ASPHD2	Q6ICH7	369 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPL41-205	ENST00000546654	PPP4R4	Q6NUP7	873 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPL41-205	ENST00000546654	METTL2B	Q6P1Q9	378 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RPL41-205	ENST00000546654	MBOAT1	Q6ZNC8	495 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPL41-205	ENST00000546654	DOK3	Q7L591	496 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPL41-205	ENST00000546654	THOC6	Q86W42	341 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62

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