RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531967.5

ECHDC1-222, Transcript of ethylmalonyl-CoA decarboxylase 1, human

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene ECHDC1, Length 2,585 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ECHDC1-222	ENST00000531967	NAAA	Q02083	359 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	PNRC1	Q12796	327 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	ORC2	Q13416	577 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	PDK2	Q15119	407 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	CYTH1	Q15438	398 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	CDKN3	Q16667	212 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	TCHHL1	Q5QJ38	904 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	RHBDF2	Q6PJF5	856 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	ERICH1	Q86X53	443 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	CACUL1	Q86Y37	369 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	TMC8	Q8IU68	726 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	KIRREL3	Q8IZU9	778 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	FAM89B	Q8N5H3	189 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	C8orf31	Q8N9H6	132 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	POC1A	Q8NBT0	407 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	NECAP1	Q8NC96	275 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	PPFIBP2	Q8ND30	876 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	CPEB3	Q8NE35	698 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	SPATA22	Q8NHS9	363 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	DTD1	Q8TEA8	209 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	C8orf44	Q96CB5	159 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	NSMCE3	Q96MG7	304 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	TAAR1	Q96RJ0	339 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	GPR174	Q9BXC1	333 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	CALN1	Q9BXU9	219 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	RHOJ	Q9H4E5	214 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	NOX4	Q9NPH5	578 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	SLC52A3	Q9NQ40	469 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	NPAP1	Q9NZP6	1156 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	IKZF3	Q9UKT9	509 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	PRPF19	Q9UMS4	504 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	POLDIP2	Q9Y2S7	368 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	TSSC4	Q9Y5U2	329 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	CACNG2	Q9Y698	323 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	VWDE	Q8N2E2	1590 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ECHDC1-222	ENST00000531967	AFF2	P51816	1311 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	KIF1B	O60333	1816 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	KCNE1B	A0A087WTH5	132 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	KBTBD11-OT1	A0A1B0GTJ5	212 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967		A0A1W2PPC1	479 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	C17orf105	B2RV13	164 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	AIRE	O43918	545 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	ENTPD5	O75356	428 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	ADAP1	O75689	374 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	OXSR1	O95747	527 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	TXNDC12	O95881	172 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	ASS1	P00966	412 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	TGFB1	P01137	390 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	VTN	P04004	478 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	SNRPA	P09012	282 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	SLC35E2B	P0CK96	405 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	SLC35E2	P0CK97	266 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	IRF2	P14316	349 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	PPP3CB	P16298	524 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	ZNF7	P17097	686 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	MAOA	P21397	527 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	HSD11B1	P28845	292 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	EIF2S3	P41091	472 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	TPTE	P56180	551 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	OGDH	Q02218	1023 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	MYBPH	Q13203	477 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	TRAM2	Q15035	370 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	SPHAR	Q15513	63 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	SEL1L2	Q5TEA6	688 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	FUT10	Q6P4F1	479 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	TRMT1L	Q7Z2T5	733 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	ACOT1	Q86TX2	421 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	RANBP3L	Q86VV4	465 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	ZNF444	Q8N0Y2	327 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	ZNF473	Q8WTR7	871 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	LENG1	Q96BZ8	264 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	ANKRD36BP1	Q96IX9	119 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	MAP1LC3C	Q9BXW4	147 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	C1orf198	Q9H425	327 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	C10orf88	Q9H8K7	445 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	WDR54	Q9H977	334 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	RNF181	Q9P0P0	153 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	RCC2	Q9P258	522 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	CLN8	Q9UBY8	286 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	PLEKHB1	Q9UF11	243 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	YIPF1	Q9Y548	306 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	TMEM213	A2RRL7	107 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	ANTXRL	A6NF34	631 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967		E5RI56	91 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	ZBTB5	O15062	677 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	XRCC2	O43543	280 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	MGRN1	O60291	552 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	VAMP5	O95183	116 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	HMGN1	P05114	100 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	OR4E1	P0C645	316 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	SMIM10L1	P0DMW3	83 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	UQCRB	P14927	111 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	CHAT	P28329	748 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	CRABP2	P29373	138 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	APOBEC1	P41238	236 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	GYG1	P46976	350 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	GLIPR1	P48060	266 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	PGGT1B	P53609	377 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	MAZ	P56270	477 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	ATP6V0D1	P61421	351 aa		4.77	□□□□□ -1.65

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