RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531908.5

RPS13-208, Transcript of ribosomal protein S13, human

TSL 2

Gene RPS13, Length 746 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPS13-208	ENST00000531908	MCRIP2	Q9BUT9	160 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
RPS13-208	ENST00000531908	KIFC1	Q9BW19	673 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RPS13-208	ENST00000531908	IL22	Q9GZX6	179 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RPS13-208	ENST00000531908	SLC25A51	Q9H1U9	297 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RPS13-208	ENST00000531908	LRRC40	Q9H9A6	602 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RPS13-208	ENST00000531908	UGT1A7	Q9HAW7	530 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RPS13-208	ENST00000531908	UGT1A10	Q9HAW8	530 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RPS13-208	ENST00000531908	UGT1A8	Q9HAW9	530 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RPS13-208	ENST00000531908	CHRAC1	Q9NRG0	131 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RPS13-208	ENST00000531908	RBM22	Q9NW64	420 aa	Known RBP eCLIP	4.36	□□□□□ -1.71
RPS13-208	ENST00000531908	STOML2	Q9UJZ1	356 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RPS13-208	ENST00000531908	VANGL2	Q9ULK5	521 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RPS13-208	ENST00000531908	PLLP	Q9Y342	182 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RPS13-208	ENST00000531908	IKBKG	Q9Y6K9	419 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RPS13-208	ENST00000531908	VWA8	A3KMH1	1905 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RPS13-208	ENST00000531908	IGKV3D-15	A0A087WSY6	115 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RPS13-208	ENST00000531908	LOC285095	A0A1B0GVY8	99 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RPS13-208	ENST00000531908	CCT8L1P	A6NM43	557 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RPS13-208	ENST00000531908	C15orf61	A6NNL5	157 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RPS13-208	ENST00000531908	C2CD4D	B7Z1M9	353 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RPS13-208	ENST00000531908	TRIM49D1	C9J1S8	452 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RPS13-208	ENST00000531908	GOLGA8R	I6L899	631 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RPS13-208	ENST00000531908	KDELR3	O43731	214 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RPS13-208	ENST00000531908	MAGEC1	O60732	1142 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RPS13-208	ENST00000531908	GAS8-AS1	O95177	125 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RPS13-208	ENST00000531908	CXCL14	O95715	111 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RPS13-208	ENST00000531908	OAS1	P00973	400 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
RPS13-208	ENST00000531908	EPO	P01588	193 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RPS13-208	ENST00000531908	GBA	P04062	536 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RPS13-208	ENST00000531908	ATP1B1	P05026	303 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RPS13-208	ENST00000531908	OR1E1	P30953	314 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RPS13-208	ENST00000531908	LEPR	P48357	1165 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
RPS13-208	ENST00000531908	LUM	P51884	338 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
RPS13-208	ENST00000531908	GEM	P55040	296 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RPS13-208	ENST00000531908	CYCS	P99999	105 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
RPS13-208	ENST00000531908	SCN1B	Q07699	218 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RPS13-208	ENST00000531908	SLC10A7	Q0GE19	358 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RPS13-208	ENST00000531908	CDH17	Q12864	832 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RPS13-208	ENST00000531908	ITIH4	Q14624	930 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RPS13-208	ENST00000531908	E2F5	Q15329	346 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RPS13-208	ENST00000531908	PDK4	Q16654	411 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RPS13-208	ENST00000531908	PARP15	Q460N3	678 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RPS13-208	ENST00000531908	HHAT	Q5VTY9	493 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RPS13-208	ENST00000531908	FAM91A1	Q658Y4	838 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RPS13-208	ENST00000531908	CASC4	Q6P4E1	433 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RPS13-208	ENST00000531908	KDELC1	Q6UW63	502 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RPS13-208	ENST00000531908	CES3	Q6UWW8	571 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RPS13-208	ENST00000531908	CDHR3	Q6ZTQ4	885 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RPS13-208	ENST00000531908	CTAGE3P	Q8IX95	158 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RPS13-208	ENST00000531908	C4orf33	Q8N1A6	199 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RPS13-208	ENST00000531908	ATPAF2	Q8N5M1	289 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RPS13-208	ENST00000531908	KLHDC1	Q8N7A1	406 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RPS13-208	ENST00000531908	DNAAF3	Q8N9W5	541 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RPS13-208	ENST00000531908		Q8NFD4	153 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RPS13-208	ENST00000531908	OR52K2	Q8NGK3	314 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RPS13-208	ENST00000531908	GDAP1	Q8TB36	358 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RPS13-208	ENST00000531908	MGARP	Q8TDB4	240 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RPS13-208	ENST00000531908	ACMSD	Q8TDX5	336 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RPS13-208	ENST00000531908	PIK3R3	Q92569	461 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RPS13-208	ENST00000531908	CDKL2	Q92772	493 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RPS13-208	ENST00000531908	PSMG2	Q969U7	264 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RPS13-208	ENST00000531908	CERS2	Q96G23	380 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RPS13-208	ENST00000531908	CABS1	Q96KC9	395 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RPS13-208	ENST00000531908	KLF6	Q99612	283 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
RPS13-208	ENST00000531908	RIMS4	Q9H426	269 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
RPS13-208	ENST00000531908	PDF	Q9HBH1	243 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RPS13-208	ENST00000531908	APOBEC3C	Q9NRW3	190 aa	Known RBP eCLIP	4.35	□□□□□ -1.71
RPS13-208	ENST00000531908	MRPL17	Q9NRX2	175 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
RPS13-208	ENST00000531908	FGFR1OP2	Q9NVK5	253 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RPS13-208	ENST00000531908	SLC17A7	Q9P2U7	560 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RPS13-208	ENST00000531908	DCDC2	Q9UHG0	476 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RPS13-208	ENST00000531908	ELF5	Q9UKW6	265 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
RPS13-208	ENST00000531908	ASB3	Q9Y575	518 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RPS13-208	ENST00000531908	COL4A6	Q14031	1691 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RPS13-208	ENST00000531908	PATJ	Q8NI35	1801 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RPS13-208	ENST00000531908		A0A087X002	238 aa		4.34	□□□□□ -1.71
RPS13-208	ENST00000531908	ZNF559-ZNF177	A0A0A6YYI6	481 aa	Predicted RBP	4.34	□□□□□ -1.71
RPS13-208	ENST00000531908		A0A0D9SEW6	157 aa		4.34	□□□□□ -1.71
RPS13-208	ENST00000531908	TRBV5-5	A0A0J9YX44	114 aa		4.34	□□□□□ -1.71
RPS13-208	ENST00000531908	ILVBL	A1L0T0	632 aa		4.34	□□□□□ -1.71
RPS13-208	ENST00000531908	NDUFAF8	A1L188	74 aa		4.34	□□□□□ -1.71
RPS13-208	ENST00000531908	SNURFL	B1AK76	121 aa		4.34	□□□□□ -1.71
RPS13-208	ENST00000531908	TMEM150C	B9EJG8	249 aa		4.34	□□□□□ -1.71
RPS13-208	ENST00000531908		F5H5T6	163 aa		4.34	□□□□□ -1.71
RPS13-208	ENST00000531908	PRRG1	O14668	218 aa		4.34	□□□□□ -1.71
RPS13-208	ENST00000531908	FPGT	O14772	594 aa		4.34	□□□□□ -1.71
RPS13-208	ENST00000531908	EDF1	O60869	148 aa	Known RBP	4.34	□□□□□ -1.71
RPS13-208	ENST00000531908	CLDN11	O75508	207 aa		4.34	□□□□□ -1.71
RPS13-208	ENST00000531908	OLFM2	O95897	454 aa		4.34	□□□□□ -1.71
RPS13-208	ENST00000531908	IL1B	P01584	269 aa		4.34	□□□□□ -1.71
RPS13-208	ENST00000531908	HLA-DQB2	P05538	268 aa		4.34	□□□□□ -1.71
RPS13-208	ENST00000531908	CD27	P26842	260 aa		4.34	□□□□□ -1.71
RPS13-208	ENST00000531908	SOAT1	P35610	550 aa		4.34	□□□□□ -1.71
RPS13-208	ENST00000531908	CSRP3	P50461	194 aa		4.34	□□□□□ -1.71
RPS13-208	ENST00000531908	CDH4	P55283	916 aa		4.34	□□□□□ -1.71
RPS13-208	ENST00000531908	RPS24	P62847	133 aa	Known RBP	4.34	□□□□□ -1.71
RPS13-208	ENST00000531908	GNA12	Q03113	381 aa		4.34	□□□□□ -1.71
RPS13-208	ENST00000531908	TWF1	Q12792	350 aa		4.34	□□□□□ -1.71
RPS13-208	ENST00000531908	IFT88	Q13099	833 aa		4.34	□□□□□ -1.71
RPS13-208	ENST00000531908	ZNF177	Q13360	481 aa	Predicted RBP	4.34	□□□□□ -1.71

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