RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520276.5

TRPS1-211, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRPS1, Length 4,083 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-211ENST00000520276 CPEP16870 476 aa9.46□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 CD38P28907 300 aa9.46□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 C1DQ13901 141 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 GSG1Q2KHT4 349 aa9.46□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF528Q3MIS6 628 aa9.46□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 SPIN4Q56A73 249 aa9.46□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 ALG1LQ6GMV1 187 aa9.46□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 LYPD4Q6UWN0 246 aa9.46□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 SCAMP4Q969E2 229 aa9.46□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 OR2M2Q96R28 347 aa9.46□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 TSSK6Q9BXA6 273 aa9.46□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 EMC3Q9P0I2 261 aa9.46□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa9.45□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 TUBAL3A6NHL2 446 aa9.45□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 YY2O15391 372 aa9.45□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 DRD5P21918 477 aa9.45□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 CD9P21926 228 aa9.45□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 SOX18P35713 384 aa9.45□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP9.45□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 SGCAQ16586 387 aa9.45□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 FAM198BQ6UWH4 519 aa9.45□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 DPPA4Q7L190 304 aa9.45□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 UXS1Q8NBZ7 420 aa9.45□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 DPEP2Q9H4A9 486 aa9.45□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 ENAMQ9NRM1 1142 aa9.45□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 TMEM5Q9Y2B1 443 aa9.45□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 RNF215Q9Y6U7 377 aa9.45□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 SCAMP1O15126 338 aa9.45□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 TO15178 435 aa9.45□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 OTCP00480 354 aa9.45□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 RLN2P04090 185 aa9.45□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 HIST1H2ADP20671 130 aa9.45□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 CD27P26842 260 aa9.45□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 RABIFP47224 123 aa9.45□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 PREPP48147 710 aa9.45□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 CRISP1P54107 249 aa9.45□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 ADPRHP54922 357 aa9.45□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 CACNG1Q06432 222 aa9.45□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 TRIM61Q5EBN2 209 aa9.45□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 FAM74A1Q5RGS3 127 aa9.45□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa9.45□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 CERS6Q6ZMG9 384 aa9.45□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 ZER1Q7Z7L7 766 aa9.45□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 NR2C2APQ86WQ0 139 aa9.45□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 PIANPQ8IYJ0 282 aa9.45□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 TMEM105Q8N8V8 129 aa9.45□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 FAM46DQ8NEK8 389 aa9.45□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 OR52N1Q8NH53 320 aa9.45□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 CD200R1Q8TD46 325 aa9.45□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 RFT1Q96AA3 541 aa9.45□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa9.45□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 HIST1H2AJQ99878 128 aa9.45□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 DOHHQ9BU89 302 aa9.45□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 MED18Q9BUE0 208 aa9.45□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 ACPTQ9BZG2 426 aa9.45□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 RNF32Q9H0A6 362 aa9.45□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 ABCG4Q9H172 646 aa9.45□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 MRTO4Q9UKD2 239 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 DTX4Q9Y2E6 619 aa9.45□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 DENND4AQ7Z401 1863 aa9.45□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 ANKRD36A6QL64 1941 aa9.45□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 CCDC88CQ9P219 2028 aa9.45□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 A0A1B0GVI7 797 aa9.45□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 PQLC2LA1A4F0 135 aa9.45□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 GSAPA4D1B5 854 aa9.45□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 ECDO95905 644 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 DRD2P14416 443 aa9.45□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 GPX2P18283 190 aa9.45□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 ARL4DP49703 201 aa9.45□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 IL2P60568 153 aa9.45□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 SWI5Q1ZZU3 235 aa9.45□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 PLK5Q496M5 336 aa9.45□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 CRTC1Q6UUV9 634 aa9.45□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 TSPAN33Q86UF1 283 aa9.45□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 LAPTM4BQ86VI4 370 aa9.45□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 GPR135Q8IZ08 494 aa9.45□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 POP5Q969H6 163 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 WDR92Q96MX6 357 aa9.45□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 MED9Q9NWA0 146 aa9.45□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 CHST2Q9Y4C5 530 aa9.45□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 NOTCH4Q99466 2003 aa9.44□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa9.44□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 TLR4O00206 839 aa9.44□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 CASC3O15234 703 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 EIF1BO60739 113 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 S100A6P06703 90 aa9.44□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 HSD3B1P14060 373 aa9.44□□□□□ -0.9
TRPS1-211ENST00000520276 ACADLP28330 430 aa9.44□□□□□ -0.9
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