RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514845.5

CAST-241, Transcript of calpastatin, humanhuman

TSL 4

Gene CAST, Length 588 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAST-241ENST00000514845 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
CAST-241ENST00000514845 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
CAST-241ENST00000514845 CXorf36Q9H7Y0 433 aa7.4□□□□□ -1.22
CAST-241ENST00000514845 ESM1Q9NQ30 184 aa7.4□□□□□ -1.22
CAST-241ENST00000514845 OPTCQ9UBM4 332 aa7.4□□□□□ -1.22
CAST-241ENST00000514845 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
CAST-241ENST00000514845 PCDHB10Q9UN67 800 aa7.4□□□□□ -1.22
CAST-241ENST00000514845 RNF11Q9Y3C5 154 aa7.4□□□□□ -1.22
CAST-241ENST00000514845 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa7.4□□□□□ -1.22
CAST-241ENST00000514845 GOLGA6L10A6NI86 522 aa7.39□□□□□ -1.23
CAST-241ENST00000514845 H0YIV9 168 aa7.39□□□□□ -1.23
CAST-241ENST00000514845 RAD51DO75771 328 aa7.39□□□□□ -1.23
CAST-241ENST00000514845 PGM3O95394 542 aa7.39□□□□□ -1.23
CAST-241ENST00000514845 STAMBPO95630 424 aa7.39□□□□□ -1.23
CAST-241ENST00000514845 S100BP04271 92 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
CAST-241ENST00000514845 GGT1P19440 569 aa7.39□□□□□ -1.23
CAST-241ENST00000514845 ENPP1P22413 925 aa7.39□□□□□ -1.23
CAST-241ENST00000514845 SFTPDP35247 375 aa7.39□□□□□ -1.23
CAST-241ENST00000514845 ELK3P41970 407 aa7.39□□□□□ -1.23
CAST-241ENST00000514845 ALDH9A1P49189 494 aa7.39□□□□□ -1.23
CAST-241ENST00000514845 ARFIP2P53365 341 aa7.39□□□□□ -1.23
CAST-241ENST00000514845 CARD18P57730 90 aa7.39□□□□□ -1.23
CAST-241ENST00000514845 RAC1P63000 192 aa7.39□□□□□ -1.23
CAST-241ENST00000514845 PSG6Q00889 435 aa7.39□□□□□ -1.23
CAST-241ENST00000514845 CHRNB3Q05901 458 aa7.39□□□□□ -1.23
CAST-241ENST00000514845 ZNF155Q12901 538 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
CAST-241ENST00000514845 DLG1Q12959 904 aa7.39□□□□□ -1.23
CAST-241ENST00000514845 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
CAST-241ENST00000514845 CCNYL2Q5T2Q4 361 aa7.39□□□□□ -1.23
CAST-241ENST00000514845 TMEM108Q6UXF1 575 aa7.39□□□□□ -1.23
CAST-241ENST00000514845 Q6ZT83 130 aa7.39□□□□□ -1.23
CAST-241ENST00000514845 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa7.39□□□□□ -1.23
CAST-241ENST00000514845 TMEM139Q8IV31 216 aa7.39□□□□□ -1.23
CAST-241ENST00000514845 PPIL6Q8IXY8 311 aa7.39□□□□□ -1.23
CAST-241ENST00000514845 GTPBP8Q8N3Z3 284 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
CAST-241ENST00000514845 OR7G2Q8NG99 324 aa7.39□□□□□ -1.23
CAST-241ENST00000514845 UBTD2Q8WUN7 234 aa7.39□□□□□ -1.23
CAST-241ENST00000514845 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
CAST-241ENST00000514845 TM4SF18Q96CE8 201 aa7.39□□□□□ -1.23
CAST-241ENST00000514845 MTBPQ96DY7 904 aa7.39□□□□□ -1.23
CAST-241ENST00000514845 CDK15Q96Q40 435 aa7.39□□□□□ -1.23
CAST-241ENST00000514845 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
CAST-241ENST00000514845 MCMBPQ9BTE3 642 aa7.39□□□□□ -1.23
CAST-241ENST00000514845 TRMOQ9BU70 441 aa7.39□□□□□ -1.23
CAST-241ENST00000514845 C1QTNF5Q9BXJ0 243 aa7.39□□□□□ -1.23
CAST-241ENST00000514845 ALG9Q9H6U8 611 aa7.39□□□□□ -1.23
CAST-241ENST00000514845 PFDN4Q9NQP4 134 aa7.39□□□□□ -1.23
CAST-241ENST00000514845 SDHAF3Q9NRP4 125 aa7.39□□□□□ -1.23
CAST-241ENST00000514845 GUCA1BQ9UMX6 200 aa7.39□□□□□ -1.23
CAST-241ENST00000514845 MGAT4BQ9UQ53 548 aa7.39□□□□□ -1.23
CAST-241ENST00000514845 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa7.39□□□□□ -1.23
CAST-241ENST00000514845 OR10H1Q9Y4A9 318 aa7.39□□□□□ -1.23
CAST-241ENST00000514845 TRAF6Q9Y4K3 522 aa7.39□□□□□ -1.23
CAST-241ENST00000514845 SLC25A15Q9Y619 301 aa7.39□□□□□ -1.23
CAST-241ENST00000514845 FKBP7Q9Y680 259 aa7.39□□□□□ -1.23
CAST-241ENST00000514845 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa7.38□□□□□ -1.23
CAST-241ENST00000514845 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa7.38□□□□□ -1.23
CAST-241ENST00000514845 A0A1W2PRB8 838 aa7.38□□□□□ -1.23
CAST-241ENST00000514845 C1orf226A1L170 272 aa7.38□□□□□ -1.23
CAST-241ENST00000514845 OR5H1A6NKK0 313 aa7.38□□□□□ -1.23
CAST-241ENST00000514845 SUPT3HB4E1H0 165 aa7.38□□□□□ -1.23
CAST-241ENST00000514845 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa7.38□□□□□ -1.23
CAST-241ENST00000514845 EFNA2O43921 213 aa7.38□□□□□ -1.23
CAST-241ENST00000514845 SUPT3HO75486 399 aa7.38□□□□□ -1.23
CAST-241ENST00000514845 ANGPTL1O95841 491 aa7.38□□□□□ -1.23
CAST-241ENST00000514845 IGHV3-9P01782 118 aa7.38□□□□□ -1.23
CAST-241ENST00000514845 YES1P07947 543 aa7.38□□□□□ -1.23
CAST-241ENST00000514845 TACSTD2P09758 323 aa7.38□□□□□ -1.23
CAST-241ENST00000514845 ZNF17P17021 662 aa7.38□□□□□ -1.23
CAST-241ENST00000514845 COX5AP20674 150 aa7.38□□□□□ -1.23
CAST-241ENST00000514845 PTAFRP25105 342 aa7.38□□□□□ -1.23
CAST-241ENST00000514845 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
CAST-241ENST00000514845 OR3A2P47893 321 aa7.38□□□□□ -1.23
CAST-241ENST00000514845 MAPK12P53778 367 aa7.38□□□□□ -1.23
CAST-241ENST00000514845 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
CAST-241ENST00000514845 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
CAST-241ENST00000514845 PHEXP78562 749 aa7.38□□□□□ -1.23
CAST-241ENST00000514845 POU4F1Q01851 419 aa7.38□□□□□ -1.23
CAST-241ENST00000514845 MLC1Q15049 377 aa7.38□□□□□ -1.23
CAST-241ENST00000514845 LIPJQ5W064 366 aa7.38□□□□□ -1.23
CAST-241ENST00000514845 STEAP4Q687X5 459 aa7.38□□□□□ -1.23
CAST-241ENST00000514845 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa7.38□□□□□ -1.23
CAST-241ENST00000514845 FCRLAQ7L513 359 aa7.38□□□□□ -1.23
CAST-241ENST00000514845 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa7.38□□□□□ -1.23
CAST-241ENST00000514845 ANKMY2Q8IV38 441 aa7.38□□□□□ -1.23
CAST-241ENST00000514845 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
CAST-241ENST00000514845 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
CAST-241ENST00000514845 ZDHHC22Q8N966 263 aa7.38□□□□□ -1.23
CAST-241ENST00000514845 GATSQ8NAP1 163 aa7.38□□□□□ -1.23
CAST-241ENST00000514845 ZNF675Q8TD23 568 aa7.38□□□□□ -1.23
CAST-241ENST00000514845 FBF1Q8TES7 1133 aa7.38□□□□□ -1.23
CAST-241ENST00000514845 MAIP1Q8WWC4 291 aa7.38□□□□□ -1.23
CAST-241ENST00000514845 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP7.38□□□□□ -1.23
CAST-241ENST00000514845 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
CAST-241ENST00000514845 KLHL15Q96M94 604 aa7.38□□□□□ -1.23
CAST-241ENST00000514845 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
CAST-241ENST00000514845 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
CAST-241ENST00000514845 LPAR2Q9HBW0 351 aa7.38□□□□□ -1.23
CAST-241ENST00000514845 MYNNQ9NPC7 610 aa7.38□□□□□ -1.23
CAST-241ENST00000514845 MED17Q9NVC6 651 aa7.38□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.2 ms