RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511978.5

MATR3-218, Transcript of matrin 3, human

TSL 3

Gene MATR3, Length 573 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MATR3-218	ENST00000511978	FAM92B	Q6ZTR7	304 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	KCTD8	Q6ZWB6	473 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	CENPU	Q71F23	418 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	PRSS42	Q7Z5A4	293 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	CUZD1	Q86UP6	607 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	KCNMB4	Q86W47	210 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	OOSP2	Q86WS3	158 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	SLC22A15	Q8IZD6	547 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	PDIK1L	Q8N165	341 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	POC5	Q8NA72	575 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	BBOF1	Q8ND07	529 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	RBM15B	Q8NDT2	890 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	OR52E1	Q8NGJ3	308 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	CFAP36	Q96G28	342 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	RSRC1	Q96IZ7	334 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	TGM7	Q96PF1	710 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	PANX3	Q96QZ0	392 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	NAT9	Q9BTE0	207 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	CARD6	Q9BX69	1037 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	CCDC68	Q9H2F9	335 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	DPH5	Q9H2P9	285 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	C20orf96	Q9NUD7	363 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	INTS10	Q9NVR2	710 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	AKAP7	Q9P0M2	348 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	PLAGL1	Q9UM63	463 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	CHMP2B	Q9UQN3	213 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	ASF1A	Q9Y294	204 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	SNX24	Q9Y343	169 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	HEBP2	Q9Y5Z4	205 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	COLEC10	Q9Y6Z7	277 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	ASXL3	Q9C0F0	2248 aa		4.84	□□□□□ -1.64
MATR3-218	ENST00000511978	FREM2	Q5SZK8	3169 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MATR3-218	ENST00000511978	CEP295	Q9C0D2	2601 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MATR3-218	ENST00000511978	TNFSF12-TNFSF13	A0A0A6YY99	330 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MATR3-218	ENST00000511978	OR2M5	A3KFT3	312 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MATR3-218	ENST00000511978	GSAP	A4D1B5	854 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MATR3-218	ENST00000511978	OR6C74	A6NCV1	312 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MATR3-218	ENST00000511978	TLCD2	A6NGC4	264 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MATR3-218	ENST00000511978	EFCAB7	A8K855	629 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MATR3-218	ENST00000511978		E5RI56	91 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MATR3-218	ENST00000511978		H3BMM5	538 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MATR3-218	ENST00000511978	KIF2A	O00139	706 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
MATR3-218	ENST00000511978	TOX3	O15405	576 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
MATR3-218	ENST00000511978	RRP8	O43159	456 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
MATR3-218	ENST00000511978	AHCYL1	O43865	530 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MATR3-218	ENST00000511978	NIPSNAP2	O75323	286 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MATR3-218	ENST00000511978	RSL1D1	O76021	490 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
MATR3-218	ENST00000511978	ZNF432	O94892	652 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MATR3-218	ENST00000511978	TTC4	O95801	387 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MATR3-218	ENST00000511978	IGLV2-11	P01706	119 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MATR3-218	ENST00000511978	IGHV4-39	P01824	125 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MATR3-218	ENST00000511978	ERVK-10	P10266	1014 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MATR3-218	ENST00000511978	CCL4	P13236	92 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MATR3-218	ENST00000511978	ADAR	P55265	1226 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
MATR3-218	ENST00000511978	GAGE2B	Q13066	116 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MATR3-218	ENST00000511978	GAGE5	Q13069	117 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MATR3-218	ENST00000511978	GAGE6	Q13070	117 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MATR3-218	ENST00000511978	PDIA2	Q13087	525 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
MATR3-218	ENST00000511978	PRKAA1	Q13131	559 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MATR3-218	ENST00000511978	FASTKD3	Q14CZ7	662 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
MATR3-218	ENST00000511978	GAGE2E	Q4V326	116 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MATR3-218	ENST00000511978	ZNF789	Q5FWF6	425 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MATR3-218	ENST00000511978	SPANXN3	Q5MJ09	141 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MATR3-218	ENST00000511978	STEAP4	Q687X5	459 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MATR3-218	ENST00000511978	GAGE2A	Q6NT46	116 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MATR3-218	ENST00000511978	C8orf74	Q6P047	294 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MATR3-218	ENST00000511978	PLXDC2	Q6UX71	529 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MATR3-218	ENST00000511978	UNC5D	Q6UXZ4	953 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MATR3-218	ENST00000511978	OTOA	Q7RTW8	1153 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MATR3-218	ENST00000511978	ARHGAP22	Q7Z5H3	698 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MATR3-218	ENST00000511978	NFE4	Q86UQ8	179 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MATR3-218	ENST00000511978	AMIGO1	Q86WK6	493 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MATR3-218	ENST00000511978	DCUN1D3	Q8IWE4	304 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MATR3-218	ENST00000511978	CNTN4	Q8IWV2	1026 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MATR3-218	ENST00000511978	LMNTD2	Q8IXW0	634 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MATR3-218	ENST00000511978	TBC1D21	Q8IYX1	336 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MATR3-218	ENST00000511978	ZBED8	Q8IZ13	594 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MATR3-218	ENST00000511978	GBGT1	Q8N5D6	347 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MATR3-218	ENST00000511978	BMPER	Q8N8U9	685 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MATR3-218	ENST00000511978	ZNF248	Q8NDW4	579 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MATR3-218	ENST00000511978	FBXO36	Q8NEA4	188 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MATR3-218	ENST00000511978	OR4E2	Q8NGC2	313 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MATR3-218	ENST00000511978	OR5AR1	Q8NGP9	310 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MATR3-218	ENST00000511978	OR5K2	Q8NHB8	316 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MATR3-218	ENST00000511978	PPP4R1	Q8TF05	950 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MATR3-218	ENST00000511978	SKA2	Q8WVK7	121 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
MATR3-218	ENST00000511978	KCNE4	Q8WWG9	221 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MATR3-218	ENST00000511978	ASZ1	Q8WWH4	475 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MATR3-218	ENST00000511978	LCN9	Q8WX39	176 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MATR3-218	ENST00000511978	TFG	Q92734	400 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
MATR3-218	ENST00000511978	FGF11	Q92914	225 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MATR3-218	ENST00000511978	CERS2	Q96G23	380 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MATR3-218	ENST00000511978	C9orf72	Q96LT7	481 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MATR3-218	ENST00000511978	BIRC8	Q96P09	236 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MATR3-218	ENST00000511978	NDN	Q99608	321 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MATR3-218	ENST00000511978	NRTN	Q99748	197 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MATR3-218	ENST00000511978	EBNA1BP2	Q99848	306 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
MATR3-218	ENST00000511978	CTRC	Q99895	268 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MATR3-218	ENST00000511978	ERP44	Q9BS26	406 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MATR3-218	ENST00000511978	DDA1	Q9BW61	102 aa		4.83	□□□□□ -1.64

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