RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493967.1

PATJ-211, Transcript of PATJ, crumbs cell polarity complex component, humanhuman

TSL 2

Gene PATJ, Length 574 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATJ-211ENST00000493967 DUSP22Q9NRW4 184 aa6.81□□□□□ -1.32
PATJ-211ENST00000493967 GIN1Q9NXP7 522 aa6.81□□□□□ -1.32
PATJ-211ENST00000493967 PCDHGB4Q9UN71 923 aa6.81□□□□□ -1.32
PATJ-211ENST00000493967 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
PATJ-211ENST00000493967 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa6.81□□□□□ -1.32
PATJ-211ENST00000493967 GPR45Q9Y5Y3 372 aa6.81□□□□□ -1.32
PATJ-211ENST00000493967 DCHS2Q6V1P9 2916 aa6.81□□□□□ -1.32
PATJ-211ENST00000493967 MED12LQ86YW9 2145 aa6.8□□□□□ -1.32
PATJ-211ENST00000493967 PRSS51A0A1B0GVH4 220 aa6.8□□□□□ -1.32
PATJ-211ENST00000493967 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
PATJ-211ENST00000493967 SHISA8B8ZZ34 492 aa6.8□□□□□ -1.32
PATJ-211ENST00000493967 E9PBE3 544 aa6.8□□□□□ -1.32
PATJ-211ENST00000493967 H0Y3Z8 333 aa6.8□□□□□ -1.32
PATJ-211ENST00000493967 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
PATJ-211ENST00000493967 NDUFB5O43674 189 aa6.8□□□□□ -1.32
PATJ-211ENST00000493967 DIAPH2O60879 1101 aa6.8□□□□□ -1.32
PATJ-211ENST00000493967 SASH3O75995 380 aa6.8□□□□□ -1.32
PATJ-211ENST00000493967 EPPINO95925 133 aa6.8□□□□□ -1.32
PATJ-211ENST00000493967 C1QCP02747 245 aa6.8□□□□□ -1.32
PATJ-211ENST00000493967 HOXD4P09016 255 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
PATJ-211ENST00000493967 PRF1P14222 555 aa6.8□□□□□ -1.32
PATJ-211ENST00000493967 CPN1P15169 458 aa6.8□□□□□ -1.32
PATJ-211ENST00000493967 TBXA2RP21731 343 aa6.8□□□□□ -1.32
PATJ-211ENST00000493967 MATN1P21941 496 aa6.8□□□□□ -1.32
PATJ-211ENST00000493967 S100A3P33764 101 aa6.8□□□□□ -1.32
PATJ-211ENST00000493967 ZFP36L2P47974 494 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
PATJ-211ENST00000493967 LHX2P50458 406 aa6.8□□□□□ -1.32
PATJ-211ENST00000493967 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
PATJ-211ENST00000493967 PPP2R2AP63151 447 aa6.8□□□□□ -1.32
PATJ-211ENST00000493967 C17orf67Q0P5P2 114 aa6.8□□□□□ -1.32
PATJ-211ENST00000493967 CD226Q15762 336 aa6.8□□□□□ -1.32
PATJ-211ENST00000493967 DCST2Q5T1A1 773 aa6.8□□□□□ -1.32
PATJ-211ENST00000493967 RIPPLY2Q5TAB7 128 aa6.8□□□□□ -1.32
PATJ-211ENST00000493967 ANXA8L1Q5VT79 327 aa6.8□□□□□ -1.32
PATJ-211ENST00000493967 RAET1LQ5VY80 246 aa6.8□□□□□ -1.32
PATJ-211ENST00000493967 BHLHB9Q6PI77 547 aa6.8□□□□□ -1.32
PATJ-211ENST00000493967 ENPP6Q6UWR7 440 aa6.8□□□□□ -1.32
PATJ-211ENST00000493967 OLIG3Q7RTU3 272 aa6.8□□□□□ -1.32
PATJ-211ENST00000493967 LACC1Q8IV20 430 aa6.8□□□□□ -1.32
PATJ-211ENST00000493967 VPS37AQ8NEZ2 397 aa6.8□□□□□ -1.32
PATJ-211ENST00000493967 TNIP2Q8NFZ5 429 aa6.8□□□□□ -1.32
PATJ-211ENST00000493967 DYDC1Q8WWB3 177 aa6.8□□□□□ -1.32
PATJ-211ENST00000493967 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa6.8□□□□□ -1.32
PATJ-211ENST00000493967 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
PATJ-211ENST00000493967 SLC35G5Q96KT7 338 aa6.8□□□□□ -1.32
PATJ-211ENST00000493967 C7orf26Q96N11 449 aa6.8□□□□□ -1.32
PATJ-211ENST00000493967 KLHDC3Q9BQ90 382 aa6.8□□□□□ -1.32
PATJ-211ENST00000493967 TUBA1CQ9BQE3 449 aa6.8□□□□□ -1.32
PATJ-211ENST00000493967 G6PC3Q9BUM1 346 aa6.8□□□□□ -1.32
PATJ-211ENST00000493967 PTGES2Q9H7Z7 377 aa6.8□□□□□ -1.32
PATJ-211ENST00000493967 UBQLN4Q9NRR5 601 aa6.8□□□□□ -1.32
PATJ-211ENST00000493967 MRPS18CQ9Y3D5 142 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
PATJ-211ENST00000493967 USH1CQ9Y6N9 552 aa6.8□□□□□ -1.32
PATJ-211ENST00000493967 TACC2O95359 2948 aa6.8□□□□□ -1.32
PATJ-211ENST00000493967 FBN2P35556 2912 aa6.79□□□□□ -1.32
PATJ-211ENST00000493967 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa6.79□□□□□ -1.32
PATJ-211ENST00000493967 OR2M5A3KFT3 312 aa6.79□□□□□ -1.32
PATJ-211ENST00000493967 ALG1L2C9J202 215 aa6.79□□□□□ -1.32
PATJ-211ENST00000493967 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa6.79□□□□□ -1.32
PATJ-211ENST00000493967 SCDO00767 359 aa6.79□□□□□ -1.32
PATJ-211ENST00000493967 OIP5O43482 229 aa6.79□□□□□ -1.32
PATJ-211ENST00000493967 SLC22A3O75751 556 aa6.79□□□□□ -1.32
PATJ-211ENST00000493967 GSNP06396 782 aa6.79□□□□□ -1.32
PATJ-211ENST00000493967 PGRP06401 933 aa6.79□□□□□ -1.32
PATJ-211ENST00000493967 NGFRP08138 427 aa6.79□□□□□ -1.32
PATJ-211ENST00000493967 KRT16P08779 473 aa6.79□□□□□ -1.32
PATJ-211ENST00000493967 COX6B1P14854 86 aa6.79□□□□□ -1.32
PATJ-211ENST00000493967 IDO1P14902 403 aa6.79□□□□□ -1.32
PATJ-211ENST00000493967 HPGDP15428 266 aa6.79□□□□□ -1.32
PATJ-211ENST00000493967 ZNF708P17019 499 aa6.79□□□□□ -1.32
PATJ-211ENST00000493967 ATP6V1C1P21283 382 aa6.79□□□□□ -1.32
PATJ-211ENST00000493967 UQCRC2P22695 453 aa6.79□□□□□ -1.32
PATJ-211ENST00000493967 CHMP24386 653 aa6.79□□□□□ -1.32
PATJ-211ENST00000493967 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
PATJ-211ENST00000493967 CDKN2CP42773 168 aa6.79□□□□□ -1.32
PATJ-211ENST00000493967 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
PATJ-211ENST00000493967 CLDN18P56856 261 aa6.79□□□□□ -1.32
PATJ-211ENST00000493967 TFF3Q07654 80 aa6.79□□□□□ -1.32
PATJ-211ENST00000493967 RCAN2Q14206 197 aa6.79□□□□□ -1.32
PATJ-211ENST00000493967 GANABQ14697 944 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
PATJ-211ENST00000493967 DPY19L1Q2PZI1 675 aa6.79□□□□□ -1.32
PATJ-211ENST00000493967 FLYWCH1Q4VC44 716 aa6.79□□□□□ -1.32
PATJ-211ENST00000493967 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
PATJ-211ENST00000493967 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP6.79□□□□□ -1.32
PATJ-211ENST00000493967 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa6.79□□□□□ -1.32
PATJ-211ENST00000493967 AAGABQ6PD74 315 aa6.79□□□□□ -1.32
PATJ-211ENST00000493967 EPGNQ6UW88 154 aa6.79□□□□□ -1.32
PATJ-211ENST00000493967 ARSKQ6UWY0 536 aa6.79□□□□□ -1.32
PATJ-211ENST00000493967 MCEMP1Q8IX19 187 aa6.79□□□□□ -1.32
PATJ-211ENST00000493967 UBQLNLQ8IYU4 475 aa6.79□□□□□ -1.32
PATJ-211ENST00000493967 C9orf106Q8NAJ2 232 aa6.79□□□□□ -1.32
PATJ-211ENST00000493967 ZPLD1Q8TCW7 415 aa6.79□□□□□ -1.32
PATJ-211ENST00000493967 ACTRT2Q8TDY3 377 aa6.79□□□□□ -1.32
PATJ-211ENST00000493967 SMPDL3BQ92485 455 aa6.79□□□□□ -1.32
PATJ-211ENST00000493967 RAB8BQ92930 207 aa6.79□□□□□ -1.32
PATJ-211ENST00000493967 DTNBP1Q96EV8 351 aa6.79□□□□□ -1.32
PATJ-211ENST00000493967 CCDC115Q96NT0 180 aa6.79□□□□□ -1.32
PATJ-211ENST00000493967 OR52E6Q96RD3 313 aa6.79□□□□□ -1.32
PATJ-211ENST00000493967 SDF2Q99470 211 aa6.79□□□□□ -1.32
PATJ-211ENST00000493967 ZBTB18Q99592 522 aa6.79□□□□□ -1.32
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