RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471880.5

SSR4-208, Transcript of signal sequence receptor subunit 4, human

TSL 5

Gene SSR4, Length 785 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SSR4-208	ENST00000471880	SHISA8	B8ZZ34	492 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SSR4-208	ENST00000471880		E9PBE3	544 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SSR4-208	ENST00000471880	RNASET2	O00584	256 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
SSR4-208	ENST00000471880	DVL2	O14641	736 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SSR4-208	ENST00000471880	EPPIN	O95925	133 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SSR4-208	ENST00000471880	ALDOC	P09972	364 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
SSR4-208	ENST00000471880	MATN1	P21941	496 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SSR4-208	ENST00000471880	UQCRC1	P31930	480 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SSR4-208	ENST00000471880	UFM1	P61960	85 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SSR4-208	ENST00000471880	GANAB	Q14697	944 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
SSR4-208	ENST00000471880	FLYWCH1	Q4VC44	716 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SSR4-208	ENST00000471880	APOOL	Q6UXV4	268 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SSR4-208	ENST00000471880	C16orf62	Q7Z3J2	963 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SSR4-208	ENST00000471880	C6orf120	Q7Z4R8	191 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SSR4-208	ENST00000471880	SPATA19	Q7Z5L4	167 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SSR4-208	ENST00000471880	GRAMD2A	Q8IUY3	354 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SSR4-208	ENST00000471880	LIX1L	Q8IVB5	337 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SSR4-208	ENST00000471880	MEIOB	Q8N635	442 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SSR4-208	ENST00000471880	FADS6	Q8N9I5	356 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF527	Q8NB42	609 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SSR4-208	ENST00000471880	RFWD2	Q8NHY2	731 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SSR4-208	ENST00000471880	PHOSPHO1	Q8TCT1	267 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SSR4-208	ENST00000471880	OR7D2	Q96RA2	312 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SSR4-208	ENST00000471880	UBQLN4	Q9NRR5	601 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SSR4-208	ENST00000471880	DUSP22	Q9NRW4	184 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SSR4-208	ENST00000471880	AIG1	Q9NVV5	245 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SSR4-208	ENST00000471880	KCNE3	Q9Y6H6	103 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SSR4-208	ENST00000471880	MED12L	Q86YW9	2145 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SSR4-208	ENST00000471880	CLCA1	A8K7I4	914 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SSR4-208	ENST00000471880		B4DXG7	233 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SSR4-208	ENST00000471880	EEF1E1-BLOC1S5	C9J1V9	151 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SSR4-208	ENST00000471880	GTPBP1	O00178	669 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
SSR4-208	ENST00000471880	EEF1E1	O43324	174 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
SSR4-208	ENST00000471880	HCRTR2	O43614	444 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SSR4-208	ENST00000471880	ZIC3	O60481	467 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SSR4-208	ENST00000471880	TOX	O94900	526 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SSR4-208	ENST00000471880	TBXA2R	P21731	343 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SSR4-208	ENST00000471880	CHM	P24386	653 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SSR4-208	ENST00000471880	MAP3K8	P41279	467 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF41	P51814	821 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
SSR4-208	ENST00000471880	GFRA1	P56159	465 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SSR4-208	ENST00000471880	C21orf58	P58505	322 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SSR4-208	ENST00000471880	OCRL	Q01968	901 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SSR4-208	ENST00000471880	MYBPH	Q13203	477 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SSR4-208	ENST00000471880	CPEB4	Q17RY0	729 aa	Known RBP eCLIP	13.41	□□□□□ -0.26
SSR4-208	ENST00000471880	DPY19L1	Q2PZI1	675 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SSR4-208	ENST00000471880	SLC9B1	Q4ZJI4	515 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SSR4-208	ENST00000471880	TTMP	Q5BVD1	217 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SSR4-208	ENST00000471880	NSUN5P2	Q63ZY6	315 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SSR4-208	ENST00000471880	ARSK	Q6UWY0	536 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SSR4-208	ENST00000471880	SEM1	Q6ZVN7	128 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SSR4-208	ENST00000471880	CAMKMT	Q7Z624	323 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SSR4-208	ENST00000471880	TMCO5A	Q8N6Q1	288 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SSR4-208	ENST00000471880	NAXE	Q8NCW5	288 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SSR4-208	ENST00000471880	OR8J2	Q8NGG1	315 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SSR4-208	ENST00000471880	PIWIL2	Q8TC59	973 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
SSR4-208	ENST00000471880	RNF138	Q8WVD3	245 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SSR4-208	ENST00000471880	HOXB13	Q92826	284 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
SSR4-208	ENST00000471880	C1GALT1C1	Q96EU7	318 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SSR4-208	ENST00000471880	LRRC46	Q96FV0	321 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SSR4-208	ENST00000471880	PIGQ	Q9BRB3	760 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SSR4-208	ENST00000471880	GPATCH2	Q9NW75	528 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SSR4-208	ENST00000471880	MYO9A	B2RTY4	2548 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SSR4-208	ENST00000471880	UQCRHL	A0A096LP55	91 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SSR4-208	ENST00000471880	PRSS51	A0A1B0GVH4	220 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SSR4-208	ENST00000471880	OR2M5	A3KFT3	312 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SSR4-208	ENST00000471880	CD8B2	A6NJW9	211 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SSR4-208	ENST00000471880	ALG1L2	C9J202	215 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SSR4-208	ENST00000471880		H3BNH8	94 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SSR4-208	ENST00000471880	CYP7B1	O75881	506 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SSR4-208	ENST00000471880	TMIGD3	P0DMS9	266 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
SSR4-208	ENST00000471880	PEPD	P12955	493 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SSR4-208	ENST00000471880	CPN1	P15169	458 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SSR4-208	ENST00000471880	LHX2	P50458	406 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SSR4-208	ENST00000471880	CCR4	P51679	360 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SSR4-208	ENST00000471880	SNTB1	Q13884	538 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
SSR4-208	ENST00000471880	GPR68	Q15743	365 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SSR4-208	ENST00000471880	SGCB	Q16585	318 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SSR4-208	ENST00000471880	SLC25A35	Q3KQZ1	300 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SSR4-208	ENST00000471880	ATAD3B	Q5T9A4	648 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SSR4-208	ENST00000471880	OGFOD2	Q6N063	350 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SSR4-208	ENST00000471880	TNFAIP8L2	Q6P589	184 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
SSR4-208	ENST00000471880	DNAJC14	Q6Y2X3	702 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
SSR4-208	ENST00000471880	LRRC34	Q8IZ02	419 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SSR4-208	ENST00000471880	GCNT2	Q8N0V5	402 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SSR4-208	ENST00000471880	C9orf106	Q8NAJ2	232 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SSR4-208	ENST00000471880	PSMA8	Q8TAA3	256 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SSR4-208	ENST00000471880	FAM110B	Q8TC76	370 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SSR4-208	ENST00000471880	ZPLD1	Q8TCW7	415 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SSR4-208	ENST00000471880	XAGE5	Q8WWM1	108 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SSR4-208	ENST00000471880	TESC	Q96BS2	214 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SSR4-208	ENST00000471880	INTS12	Q96CB8	462 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
SSR4-208	ENST00000471880	TEX37	Q96LM6	180 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SSR4-208	ENST00000471880	OR52E6	Q96RD3	313 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SSR4-208	ENST00000471880	PANX1	Q96RD7	426 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SSR4-208	ENST00000471880	SLC35A5	Q9BS91	424 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SSR4-208	ENST00000471880	OR51I1	Q9H343	314 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SSR4-208	ENST00000471880	NPDC1	Q9NQX5	325 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
SSR4-208	ENST00000471880	EXD2	Q9NVH0	621 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SSR4-208	ENST00000471880	MRPS18C	Q9Y3D5	142 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26

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