RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461327.5

RRM2-204, Transcript of ribonucleotide reductase regulatory subunit M2, human

TSL 2

Gene RRM2, Length 580 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RRM2-204	ENST00000461327	BCAP29	Q9UHQ4	241 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RRM2-204	ENST00000461327	GRID1	Q9ULK0	1009 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RRM2-204	ENST00000461327	SNX6	Q9UNH7	406 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RRM2-204	ENST00000461327	SHISA9	B4DS77	424 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RRM2-204	ENST00000461327	SHISA8	B8ZZ34	492 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RRM2-204	ENST00000461327	TGFA	P01135	160 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RRM2-204	ENST00000461327	SLC35E2	P0CK97	266 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RRM2-204	ENST00000461327	MYL2	P10916	166 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RRM2-204	ENST00000461327	CHN1	P15882	459 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RRM2-204	ENST00000461327	KRT4	P19013	534 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RRM2-204	ENST00000461327	HK1	P19367	917 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RRM2-204	ENST00000461327	NT5E	P21589	574 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RRM2-204	ENST00000461327	GRK2	P25098	689 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RRM2-204	ENST00000461327	SRP14	P37108	136 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
RRM2-204	ENST00000461327	HTR6	P50406	440 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RRM2-204	ENST00000461327	DNAJB13	P59910	316 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RRM2-204	ENST00000461327	LCP2	Q13094	533 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RRM2-204	ENST00000461327	ERCC6L	Q2NKX8	1250 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RRM2-204	ENST00000461327	CCDC153	Q494R4	210 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RRM2-204	ENST00000461327	EMB	Q6PCB8	327 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RRM2-204	ENST00000461327	FIGNL1	Q6PIW4	674 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RRM2-204	ENST00000461327	BEND4	Q6ZU67	534 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RRM2-204	ENST00000461327	COMMD6	Q7Z4G1	85 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RRM2-204	ENST00000461327	TRABD2A	Q86V40	505 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RRM2-204	ENST00000461327	C4orf33	Q8N1A6	199 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RRM2-204	ENST00000461327	HBEGF	Q99075	208 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RRM2-204	ENST00000461327	SOX7	Q9BT81	388 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RRM2-204	ENST00000461327	STMN4	Q9H169	189 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
RRM2-204	ENST00000461327	OCEL1	Q9H607	264 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RRM2-204	ENST00000461327	RYDEN	Q9NUL5	291 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
RRM2-204	ENST00000461327	FAIM	Q9NVQ4	179 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RRM2-204	ENST00000461327	OXSM	Q9NWU1	459 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RRM2-204	ENST00000461327	AHSP	Q9NZD4	102 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RRM2-204	ENST00000461327	LGALS13	Q9UHV8	139 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RRM2-204	ENST00000461327	CES1P1	Q9UKY3	287 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RRM2-204	ENST00000461327	SLC12A4	Q9UP95	1085 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RRM2-204	ENST00000461327	GPR52	Q9Y2T5	361 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RRM2-204	ENST00000461327	TLDC2	A0PJX2	215 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RRM2-204	ENST00000461327	SERTM1	A2A2V5	107 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RRM2-204	ENST00000461327	SERINC4	A6NH21	518 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RRM2-204	ENST00000461327	NME6	O75414	186 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
RRM2-204	ENST00000461327	ESRRB	O95718	433 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RRM2-204	ENST00000461327	APEH	P13798	732 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
RRM2-204	ENST00000461327	HSD3B1	P14060	373 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RRM2-204	ENST00000461327	PSMB1	P20618	241 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
RRM2-204	ENST00000461327	HSD3B2	P26439	372 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RRM2-204	ENST00000461327	GALNS	P34059	522 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RRM2-204	ENST00000461327	FOXA1	P55317	472 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RRM2-204	ENST00000461327	PKNOX1	P55347	436 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RRM2-204	ENST00000461327	RAB35	Q15286	201 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RRM2-204	ENST00000461327	MIDN	Q504T8	468 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RRM2-204	ENST00000461327	C6orf163	Q5TEZ5	329 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RRM2-204	ENST00000461327	FAM111B	Q6SJ93	734 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RRM2-204	ENST00000461327	SEZ6L2	Q6UXD5	910 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RRM2-204	ENST00000461327	MREG	Q8N565	214 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RRM2-204	ENST00000461327	METTL6	Q8TCB7	284 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RRM2-204	ENST00000461327	TMBIM1	Q969X1	311 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RRM2-204	ENST00000461327	TM4SF18	Q96CE8	201 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RRM2-204	ENST00000461327	CCDC126	Q96EE4	140 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RRM2-204	ENST00000461327	KCNA7	Q96RP8	456 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RRM2-204	ENST00000461327	PARD6B	Q9BYG5	372 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RRM2-204	ENST00000461327	ROPN1B	Q9BZX4	212 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
RRM2-204	ENST00000461327	DSN1	Q9H410	356 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RRM2-204	ENST00000461327	ROPN1	Q9HAT0	212 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
RRM2-204	ENST00000461327	TNFRSF12A	Q9NP84	129 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RRM2-204	ENST00000461327	MKS1	Q9NXB0	559 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RRM2-204	ENST00000461327	VPS29	Q9UBQ0	182 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RRM2-204	ENST00000461327	TIMM22	Q9Y584	194 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RRM2-204	ENST00000461327	OR2M5	A3KFT3	312 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RRM2-204	ENST00000461327	COPE	O14579	308 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RRM2-204	ENST00000461327	SCO2	O43819	266 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RRM2-204	ENST00000461327	REM1	O75628	298 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RRM2-204	ENST00000461327	KRT6A	P02538	564 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RRM2-204	ENST00000461327	KRT6B	P04259	564 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RRM2-204	ENST00000461327	ENO1	P06733	434 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
RRM2-204	ENST00000461327	CPA3	P15088	417 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RRM2-204	ENST00000461327	NAGA	P17050	411 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RRM2-204	ENST00000461327	IL32	P24001	234 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RRM2-204	ENST00000461327	PIK3R1	P27986	724 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RRM2-204	ENST00000461327	EIF1AX	P47813	144 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
RRM2-204	ENST00000461327	KRT6C	P48668	564 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RRM2-204	ENST00000461327	EEFSEC	P57772	596 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
RRM2-204	ENST00000461327	RAE1	P78406	368 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
RRM2-204	ENST00000461327	CSTF3	Q12996	717 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
RRM2-204	ENST00000461327	STX5	Q13190	355 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RRM2-204	ENST00000461327	CCNYL2	Q5T2Q4	361 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RRM2-204	ENST00000461327	AGAP6	Q5VW22	663 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RRM2-204	ENST00000461327	OR52E8	Q6IFG1	317 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RRM2-204	ENST00000461327	C11orf71	Q6IPW1	123 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RRM2-204	ENST00000461327	FRMD7	Q6ZUT3	714 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RRM2-204	ENST00000461327	PAGE2	Q7Z2X7	111 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RRM2-204	ENST00000461327	RIBC1	Q8N443	379 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
RRM2-204	ENST00000461327	C1orf52	Q8N6N3	182 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
RRM2-204	ENST00000461327	CCNYL1	Q8N7R7	359 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RRM2-204	ENST00000461327	C17orf47	Q8NEP4	570 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RRM2-204	ENST00000461327	STEAP2	Q8NFT2	490 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RRM2-204	ENST00000461327	ADO	Q96SZ5	270 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RRM2-204	ENST00000461327	TMEM109	Q9BVC6	243 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RRM2-204	ENST00000461327	ACPT	Q9BZG2	426 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RRM2-204	ENST00000461327	BRINP2	Q9C0B6	783 aa		13.74	□□□□□ -0.21

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.9 ms