RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428064.5

LIMS1-208, Transcript of LIM zinc finger domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene LIMS1, Length 637 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-208ENST00000428064 NPHS1O60500 1241 aa18.86■□□□□ 0.61
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LIMS1-208ENST00000428064 POU2F1P14859 743 aa18.86■□□□□ 0.61
LIMS1-208ENST00000428064 MFSD12Q6NUT3 480 aa18.86■□□□□ 0.61
LIMS1-208ENST00000428064 LRIG3Q6UXM1 1119 aa18.86■□□□□ 0.61
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LIMS1-208ENST00000428064 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP18.86■□□□□ 0.61
LIMS1-208ENST00000428064 OR4C3Q8NH37 302 aa18.86■□□□□ 0.61
LIMS1-208ENST00000428064 ACTRT2Q8TDY3 377 aa18.86■□□□□ 0.61
LIMS1-208ENST00000428064 SLC9A6Q92581 669 aa18.86■□□□□ 0.61
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LIMS1-208ENST00000428064 PRKAG1P54619 331 aa18.85■□□□□ 0.61
LIMS1-208ENST00000428064 SIRPAP78324 504 aa18.85■□□□□ 0.61
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LIMS1-208ENST00000428064 VDAC3Q9Y277 283 aa18.85■□□□□ 0.61
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LIMS1-208ENST00000428064 TMEM114B3SHH9 223 aa18.84■□□□□ 0.61
LIMS1-208ENST00000428064 C16orf97H3BN30 126 aa18.84■□□□□ 0.61
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LIMS1-208ENST00000428064 UGT3A2Q3SY77 523 aa18.84■□□□□ 0.61
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LIMS1-208ENST00000428064 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP18.84■□□□□ 0.61
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LIMS1-208ENST00000428064 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP18.83■□□□□ 0.6
LIMS1-208ENST00000428064 AQP8O94778 261 aa18.83■□□□□ 0.6
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LIMS1-208ENST00000428064 ALOX5P09917 674 aa18.83■□□□□ 0.6
LIMS1-208ENST00000428064 IL11P20809 199 aa18.83■□□□□ 0.6
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LIMS1-208ENST00000428064 HPCAL1P37235 193 aa18.83■□□□□ 0.6
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LIMS1-208ENST00000428064 FAM120BQ96EK7 910 aaKnown RBP18.83■□□□□ 0.6
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LIMS1-208ENST00000428064 L2HGDHQ9H9P8 463 aa18.83■□□□□ 0.6
LIMS1-208ENST00000428064 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa18.83■□□□□ 0.6
LIMS1-208ENST00000428064 GLRX2Q9NS18 164 aa18.83■□□□□ 0.6
LIMS1-208ENST00000428064 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP18.83■□□□□ 0.6
LIMS1-208ENST00000428064 EMC9Q9Y3B6 208 aa18.83■□□□□ 0.6
LIMS1-208ENST00000428064 TRAF6Q9Y4K3 522 aa18.83■□□□□ 0.6
LIMS1-208ENST00000428064 A0A1W2PRB8 838 aa18.82■□□□□ 0.6
LIMS1-208ENST00000428064 SCDO00767 359 aa18.82■□□□□ 0.6
LIMS1-208ENST00000428064 PIP5K1BO14986 540 aa18.82■□□□□ 0.6
LIMS1-208ENST00000428064 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP18.82■□□□□ 0.6
LIMS1-208ENST00000428064 NUDT17P0C025 328 aa18.82■□□□□ 0.6
LIMS1-208ENST00000428064 HPGDP15428 266 aa18.82■□□□□ 0.6
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