RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420768.1

TOP3BP1-201, Transcript of DNA topoisomerase III beta pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene TOP3BP1, Length 1,380 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3BP1-201ENST00000420768 FBXW4P57775 412 aa15.56■□□□□ 0.08
TOP3BP1-201ENST00000420768 KCNC4Q03721 635 aa15.56■□□□□ 0.08
TOP3BP1-201ENST00000420768 B3GNTL1Q67FW5 361 aaPredicted RBP15.56■□□□□ 0.08
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZNF836Q6ZNA1 936 aa15.56■□□□□ 0.08
TOP3BP1-201ENST00000420768 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa15.56■□□□□ 0.08
TOP3BP1-201ENST00000420768 ERMP1Q7Z2K6 904 aa15.56■□□□□ 0.08
TOP3BP1-201ENST00000420768 HMGN2P46Q86SG4 172 aa15.56■□□□□ 0.08
TOP3BP1-201ENST00000420768 GRAMD2AQ8IUY3 354 aa15.56■□□□□ 0.08
TOP3BP1-201ENST00000420768 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP15.56■□□□□ 0.08
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZNF614Q8N883 585 aa15.56■□□□□ 0.08
TOP3BP1-201ENST00000420768 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa15.56■□□□□ 0.08
TOP3BP1-201ENST00000420768 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP15.56■□□□□ 0.08
TOP3BP1-201ENST00000420768 SLC35B4Q969S0 331 aa15.56■□□□□ 0.08
TOP3BP1-201ENST00000420768 SLCO4A1Q96BD0 722 aa15.56■□□□□ 0.08
TOP3BP1-201ENST00000420768 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP15.56■□□□□ 0.08
TOP3BP1-201ENST00000420768 DCLRE1BQ9H816 532 aa15.56■□□□□ 0.08
TOP3BP1-201ENST00000420768 IL1RAPQ9NPH3 570 aa15.56■□□□□ 0.08
TOP3BP1-201ENST00000420768 HPF1Q9NWY4 346 aa15.56■□□□□ 0.08
TOP3BP1-201ENST00000420768 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa15.56■□□□□ 0.08
TOP3BP1-201ENST00000420768 SH3GLB1Q9Y371 365 aa15.56■□□□□ 0.08
TOP3BP1-201ENST00000420768 DCHS1Q96JQ0 3298 aa15.55■□□□□ 0.08
TOP3BP1-201ENST00000420768 CDHR4A6H8M9 788 aa15.55■□□□□ 0.08
TOP3BP1-201ENST00000420768 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP15.55■□□□□ 0.08
TOP3BP1-201ENST00000420768 FADS1O60427 444 aa15.55■□□□□ 0.08
TOP3BP1-201ENST00000420768 KRT36O76013 467 aa15.55■□□□□ 0.08
TOP3BP1-201ENST00000420768 IFNW1P05000 195 aa15.55■□□□□ 0.08
TOP3BP1-201ENST00000420768 ITGA2P17301 1181 aa15.55■□□□□ 0.08
TOP3BP1-201ENST00000420768 EVI2BP34910 448 aa15.55■□□□□ 0.08
TOP3BP1-201ENST00000420768 MAGEA2P43356 314 aa15.55■□□□□ 0.08
TOP3BP1-201ENST00000420768 UCNP55089 124 aa15.55■□□□□ 0.08
TOP3BP1-201ENST00000420768 DEFB109BQ30KR1 87 aa15.55■□□□□ 0.08
TOP3BP1-201ENST00000420768 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa15.55■□□□□ 0.08
TOP3BP1-201ENST00000420768 MRPL2Q5T653 305 aaKnown RBP15.55■□□□□ 0.08
TOP3BP1-201ENST00000420768 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa15.55■□□□□ 0.08
TOP3BP1-201ENST00000420768 TMEM81Q6P7N7 255 aa15.55■□□□□ 0.08
TOP3BP1-201ENST00000420768 MISPQ8IVT2 679 aa15.55■□□□□ 0.08
TOP3BP1-201ENST00000420768 POGLUT1Q8NBL1 392 aa15.55■□□□□ 0.08
TOP3BP1-201ENST00000420768 RNF138Q8WVD3 245 aa15.55■□□□□ 0.08
TOP3BP1-201ENST00000420768 SGCZQ96LD1 299 aa15.55■□□□□ 0.08
TOP3BP1-201ENST00000420768 AGAP4Q96P64 663 aa15.55■□□□□ 0.08
TOP3BP1-201ENST00000420768 CHID1Q9BWS9 393 aa15.55■□□□□ 0.08
TOP3BP1-201ENST00000420768 TBL1XR1Q9BZK7 514 aa15.55■□□□□ 0.08
TOP3BP1-201ENST00000420768 HHATLQ9HCP6 504 aa15.55■□□□□ 0.08
TOP3BP1-201ENST00000420768 SCN2AQ99250 2005 aa15.54■□□□□ 0.08
TOP3BP1-201ENST00000420768 H3BNX3 289 aa15.54■□□□□ 0.08
TOP3BP1-201ENST00000420768 DNAJB5O75953 348 aa15.54■□□□□ 0.08
TOP3BP1-201ENST00000420768 CSTAP01040 98 aa15.54■□□□□ 0.08
TOP3BP1-201ENST00000420768 FABP3P05413 133 aa15.54■□□□□ 0.08
TOP3BP1-201ENST00000420768 FCGR1AP12314 374 aa15.54■□□□□ 0.08
TOP3BP1-201ENST00000420768 CASRP41180 1078 aa15.54■□□□□ 0.08
TOP3BP1-201ENST00000420768 HLCSP50747 726 aa15.54■□□□□ 0.08
TOP3BP1-201ENST00000420768 TLE3Q04726 772 aa15.54■□□□□ 0.08
TOP3BP1-201ENST00000420768 NRF1Q16656 503 aa15.54■□□□□ 0.08
TOP3BP1-201ENST00000420768 FNDC7Q5VTL7 733 aa15.54■□□□□ 0.08
TOP3BP1-201ENST00000420768 DESI1Q6ICB0 168 aa15.54■□□□□ 0.08
TOP3BP1-201ENST00000420768 IL20RBQ6UXL0 311 aa15.54■□□□□ 0.08
TOP3BP1-201ENST00000420768 BEST3Q8N1M1 668 aa15.54■□□□□ 0.08
TOP3BP1-201ENST00000420768 CLIP4Q8N3C7 705 aa15.54■□□□□ 0.08
TOP3BP1-201ENST00000420768 OR5M3Q8NGP4 307 aa15.54■□□□□ 0.08
TOP3BP1-201ENST00000420768 C7orf34Q96L11 122 aa15.54■□□□□ 0.08
TOP3BP1-201ENST00000420768 DCBLD2Q96PD2 775 aa15.54■□□□□ 0.08
TOP3BP1-201ENST00000420768 ARHGDIGQ99819 225 aa15.54■□□□□ 0.08
TOP3BP1-201ENST00000420768 GPR83Q9NYM4 423 aa15.54■□□□□ 0.08
TOP3BP1-201ENST00000420768 FLRT3Q9NZU0 649 aa15.54■□□□□ 0.08
TOP3BP1-201ENST00000420768 CHST2Q9Y4C5 530 aa15.54■□□□□ 0.08
TOP3BP1-201ENST00000420768 KCNMB2Q9Y691 235 aa15.54■□□□□ 0.08
TOP3BP1-201ENST00000420768 CLDN24A6NM45 220 aa15.53■□□□□ 0.08
TOP3BP1-201ENST00000420768 NDUFB5O43674 189 aa15.53■□□□□ 0.08
TOP3BP1-201ENST00000420768 EPPINO95925 133 aa15.53■□□□□ 0.08
TOP3BP1-201ENST00000420768 OR1E2P47887 323 aa15.53■□□□□ 0.08
TOP3BP1-201ENST00000420768 CYB561P49447 251 aa15.53■□□□□ 0.08
TOP3BP1-201ENST00000420768 SNTA1Q13424 505 aa15.53■□□□□ 0.08
TOP3BP1-201ENST00000420768 ISLR2Q6UXK2 745 aa15.53■□□□□ 0.08
TOP3BP1-201ENST00000420768 RTL4Q6ZR62 310 aa15.53■□□□□ 0.08
TOP3BP1-201ENST00000420768 PIWIL3Q7Z3Z3 882 aaKnown RBP15.53■□□□□ 0.08
TOP3BP1-201ENST00000420768 CARM1Q86X55 608 aa15.53■□□□□ 0.08
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa15.53■□□□□ 0.08
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZNF440Q8IYI8 595 aa15.53■□□□□ 0.08
TOP3BP1-201ENST00000420768 OR10G3Q8NGC4 313 aa15.53■□□□□ 0.08
TOP3BP1-201ENST00000420768 GRHL3Q8TE85 626 aa15.53■□□□□ 0.08
TOP3BP1-201ENST00000420768 PAQR8Q8TEZ7 354 aa15.53■□□□□ 0.08
TOP3BP1-201ENST00000420768 NODALQ96S42 347 aa15.53■□□□□ 0.08
TOP3BP1-201ENST00000420768 RLIMQ9NVW2 624 aa15.53■□□□□ 0.08
TOP3BP1-201ENST00000420768 CNIH4Q9P003 139 aa15.53■□□□□ 0.08
TOP3BP1-201ENST00000420768 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP15.53■□□□□ 0.08
TOP3BP1-201ENST00000420768 PRAMEF25A6NGN4 478 aa15.52■□□□□ 0.08
TOP3BP1-201ENST00000420768 A6NL46 340 aa15.52■□□□□ 0.08
TOP3BP1-201ENST00000420768 K7ENP7 123 aa15.52■□□□□ 0.08
TOP3BP1-201ENST00000420768 ANGPTL1O95841 491 aa15.52■□□□□ 0.08
TOP3BP1-201ENST00000420768 UBL4AP11441 157 aa15.52■□□□□ 0.08
TOP3BP1-201ENST00000420768 TNFRSF1BP20333 461 aa15.52■□□□□ 0.08
TOP3BP1-201ENST00000420768 CCL11P51671 97 aa15.52■□□□□ 0.08
TOP3BP1-201ENST00000420768 RGS8P57771 180 aaPredicted RBP15.52■□□□□ 0.08
TOP3BP1-201ENST00000420768 VLDLRP98155 873 aa15.52■□□□□ 0.08
TOP3BP1-201ENST00000420768 RCN1Q15293 331 aa15.52■□□□□ 0.08
TOP3BP1-201ENST00000420768 SLC22A10Q63ZE4 541 aa15.52■□□□□ 0.08
TOP3BP1-201ENST00000420768 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP15.52■□□□□ 0.08
TOP3BP1-201ENST00000420768 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa15.52■□□□□ 0.08
TOP3BP1-201ENST00000420768 APOOLQ6UXV4 268 aa15.52■□□□□ 0.08
TOP3BP1-201ENST00000420768 COMTD1Q86VU5 262 aa15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.6 ms