RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409024.3

POLR1A-202, Transcript of RNA polymerase I subunit A, humanhuman

TSL 3

Gene POLR1A, Length 560 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1A-202ENST00000409024 E9PQ18 207 aa9.06□□□□□ -0.96
POLR1A-202ENST00000409024 FFAR1O14842 300 aa9.06□□□□□ -0.96
POLR1A-202ENST00000409024 DIRAS1O95057 198 aa9.06□□□□□ -0.96
POLR1A-202ENST00000409024 TIAF1O95411 115 aa9.06□□□□□ -0.96
POLR1A-202ENST00000409024 SNAP29O95721 258 aa9.06□□□□□ -0.96
POLR1A-202ENST00000409024 IL33O95760 270 aa9.06□□□□□ -0.96
POLR1A-202ENST00000409024 EPPINO95925 133 aa9.06□□□□□ -0.96
POLR1A-202ENST00000409024 PRB1P04280 392 aa9.06□□□□□ -0.96
POLR1A-202ENST00000409024 LYNP07948 512 aa9.06□□□□□ -0.96
POLR1A-202ENST00000409024 NGFRP08138 427 aa9.06□□□□□ -0.96
POLR1A-202ENST00000409024 CCNYL3P0C7X3 344 aa9.06□□□□□ -0.96
POLR1A-202ENST00000409024 PLA2G2AP14555 144 aa9.06□□□□□ -0.96
POLR1A-202ENST00000409024 TNFRSF1BP20333 461 aa9.06□□□□□ -0.96
POLR1A-202ENST00000409024 RGS8P57771 180 aaPredicted RBP9.06□□□□□ -0.96
POLR1A-202ENST00000409024 ESRRGP62508 458 aa9.06□□□□□ -0.96
POLR1A-202ENST00000409024 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP9.06□□□□□ -0.96
POLR1A-202ENST00000409024 BLMHQ13867 455 aa9.06□□□□□ -0.96
POLR1A-202ENST00000409024 TRAM2Q15035 370 aa9.06□□□□□ -0.96
POLR1A-202ENST00000409024 GPR68Q15743 365 aa9.06□□□□□ -0.96
POLR1A-202ENST00000409024 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa9.06□□□□□ -0.96
POLR1A-202ENST00000409024 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa9.06□□□□□ -0.96
POLR1A-202ENST00000409024 ZNF550Q7Z398 422 aa9.06□□□□□ -0.96
POLR1A-202ENST00000409024 WDR53Q7Z5U6 358 aaPredicted RBP9.06□□□□□ -0.96
POLR1A-202ENST00000409024 THAP5Q7Z6K1 395 aa9.06□□□□□ -0.96
POLR1A-202ENST00000409024 ANKRD37Q7Z713 158 aa9.06□□□□□ -0.96
POLR1A-202ENST00000409024 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa9.06□□□□□ -0.96
POLR1A-202ENST00000409024 PIP4P1Q86T03 277 aa9.06□□□□□ -0.96
POLR1A-202ENST00000409024 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP9.06□□□□□ -0.96
POLR1A-202ENST00000409024 SHISA5Q8N114 240 aa9.06□□□□□ -0.96
POLR1A-202ENST00000409024 SLC38A9Q8NBW4 561 aa9.06□□□□□ -0.96
POLR1A-202ENST00000409024 OR5L2Q8NGL0 311 aa9.06□□□□□ -0.96
POLR1A-202ENST00000409024 OR6T1Q8NGN1 323 aa9.06□□□□□ -0.96
POLR1A-202ENST00000409024 CYGBQ8WWM9 190 aa9.06□□□□□ -0.96
POLR1A-202ENST00000409024 SLC38A4Q969I6 547 aa9.06□□□□□ -0.96
POLR1A-202ENST00000409024 ADIPOR1Q96A54 375 aa9.06□□□□□ -0.96
POLR1A-202ENST00000409024 NACC2Q96BF6 587 aa9.06□□□□□ -0.96
POLR1A-202ENST00000409024 ZG16BQ96DA0 208 aa9.06□□□□□ -0.96
POLR1A-202ENST00000409024 RMND5BQ96G75 393 aaPredicted RBP9.06□□□□□ -0.96
POLR1A-202ENST00000409024 CNBD2Q96M20 576 aa9.06□□□□□ -0.96
POLR1A-202ENST00000409024 DEPDC7Q96QD5 511 aa9.06□□□□□ -0.96
POLR1A-202ENST00000409024 TAAR9Q96RI9 348 aa9.06□□□□□ -0.96
POLR1A-202ENST00000409024 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP9.06□□□□□ -0.96
POLR1A-202ENST00000409024 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP9.06□□□□□ -0.96
POLR1A-202ENST00000409024 FUZQ9BT04 418 aa9.06□□□□□ -0.96
POLR1A-202ENST00000409024 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP9.06□□□□□ -0.96
POLR1A-202ENST00000409024 DGCR6LQ9BY27 220 aa9.06□□□□□ -0.96
POLR1A-202ENST00000409024 ITPAQ9BY32 194 aa9.06□□□□□ -0.96
POLR1A-202ENST00000409024 GRIP2Q9C0E4 1043 aa9.06□□□□□ -0.96
POLR1A-202ENST00000409024 HHATLQ9HCP6 504 aa9.06□□□□□ -0.96
POLR1A-202ENST00000409024 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP9.06□□□□□ -0.96
POLR1A-202ENST00000409024 CTSFQ9UBX1 484 aa9.06□□□□□ -0.96
POLR1A-202ENST00000409024 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
POLR1A-202ENST00000409024 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa9.06□□□□□ -0.96
POLR1A-202ENST00000409024 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP9.06□□□□□ -0.96
POLR1A-202ENST00000409024 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa9.05□□□□□ -0.96
POLR1A-202ENST00000409024 CCDC187A0A096LP49 1063 aa9.05□□□□□ -0.96
POLR1A-202ENST00000409024 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa9.05□□□□□ -0.96
POLR1A-202ENST00000409024 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa9.05□□□□□ -0.96
POLR1A-202ENST00000409024 SH3PXD2BA1X283 911 aa9.05□□□□□ -0.96
POLR1A-202ENST00000409024 J3KTA2 159 aa9.05□□□□□ -0.96
POLR1A-202ENST00000409024 HRKO00198 91 aa9.05□□□□□ -0.96
POLR1A-202ENST00000409024 CYP7B1O75881 506 aa9.05□□□□□ -0.96
POLR1A-202ENST00000409024 RAB40ALP0C0E4 278 aa9.05□□□□□ -0.96
POLR1A-202ENST00000409024 NAGAP17050 411 aa9.05□□□□□ -0.96
POLR1A-202ENST00000409024 GSTM3P21266 225 aa9.05□□□□□ -0.96
POLR1A-202ENST00000409024 PRKACGP22612 351 aa9.05□□□□□ -0.96
POLR1A-202ENST00000409024 CBLP22681 906 aa9.05□□□□□ -0.96
POLR1A-202ENST00000409024 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
POLR1A-202ENST00000409024 SLC5A2P31639 672 aa9.05□□□□□ -0.96
POLR1A-202ENST00000409024 KRT20P35900 424 aa9.05□□□□□ -0.96
POLR1A-202ENST00000409024 GPR143P51810 404 aa9.05□□□□□ -0.96
POLR1A-202ENST00000409024 PNLIPRP2P54317 469 aa9.05□□□□□ -0.96
POLR1A-202ENST00000409024 TAS2R41P59536 307 aa9.05□□□□□ -0.96
POLR1A-202ENST00000409024 CSNK2BP67870 215 aa9.05□□□□□ -0.96
POLR1A-202ENST00000409024 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
POLR1A-202ENST00000409024 TEKQ02763 1124 aa9.05□□□□□ -0.96
POLR1A-202ENST00000409024 NPRL3Q12980 569 aa9.05□□□□□ -0.96
POLR1A-202ENST00000409024 KCNAB2Q13303 367 aa9.05□□□□□ -0.96
POLR1A-202ENST00000409024 FGFBP1Q14512 234 aa9.05□□□□□ -0.96
POLR1A-202ENST00000409024 EBPQ15125 230 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
POLR1A-202ENST00000409024 NPTX1Q15818 432 aa9.05□□□□□ -0.96
POLR1A-202ENST00000409024 ISXQ2M1V0 245 aa9.05□□□□□ -0.96
POLR1A-202ENST00000409024 KCTD21Q4G0X4 260 aa9.05□□□□□ -0.96
POLR1A-202ENST00000409024 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
POLR1A-202ENST00000409024 CCNJQ5T5M9 372 aa9.05□□□□□ -0.96
POLR1A-202ENST00000409024 ZNF770Q6IQ21 691 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
POLR1A-202ENST00000409024 ZNF613Q6PF04 617 aa9.05□□□□□ -0.96
POLR1A-202ENST00000409024 NPSR1Q6W5P4 371 aa9.05□□□□□ -0.96
POLR1A-202ENST00000409024 DEF8Q6ZN54 512 aa9.05□□□□□ -0.96
POLR1A-202ENST00000409024 ZNF836Q6ZNA1 936 aa9.05□□□□□ -0.96
POLR1A-202ENST00000409024 LAPTM4BQ86VI4 370 aa9.05□□□□□ -0.96
POLR1A-202ENST00000409024 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
POLR1A-202ENST00000409024 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
POLR1A-202ENST00000409024 BCORP1Q8N888 145 aa9.05□□□□□ -0.96
POLR1A-202ENST00000409024 ZNF441Q8N8Z8 693 aa9.05□□□□□ -0.96
POLR1A-202ENST00000409024 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa9.05□□□□□ -0.96
POLR1A-202ENST00000409024 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
POLR1A-202ENST00000409024 B3GNT7Q8NFL0 401 aa9.05□□□□□ -0.96
POLR1A-202ENST00000409024 OR4D11Q8NGI4 311 aa9.05□□□□□ -0.96
POLR1A-202ENST00000409024 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.4 ms