RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392539.3

HOXD13-201, Transcript of homeobox D13, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD13, Length 2,240 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13-201ENST00000392539 SMIM10Q96HG1 83 aa24.58■■□□□ 1.53
HOXD13-201ENST00000392539 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.53
HOXD13-201ENST00000392539 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa24.58■■□□□ 1.53
HOXD13-201ENST00000392539 DOCK8Q8NF50 2099 aa24.58■■□□□ 1.53
HOXD13-201ENST00000392539 TRAPPC13A5PLN9 417 aa24.58■■□□□ 1.52
HOXD13-201ENST00000392539 A8MV72 311 aaPredicted RBP24.58■■□□□ 1.52
HOXD13-201ENST00000392539 J3QRE1 110 aa24.58■■□□□ 1.52
HOXD13-201ENST00000392539 ADPRHP54922 357 aa24.58■■□□□ 1.52
HOXD13-201ENST00000392539 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.52
HOXD13-201ENST00000392539 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP24.58■■□□□ 1.52
HOXD13-201ENST00000392539 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa24.58■■□□□ 1.52
HOXD13-201ENST00000392539 FBXO42Q6P3S6 717 aa24.58■■□□□ 1.52
HOXD13-201ENST00000392539 KLBQ86Z14 1044 aa24.58■■□□□ 1.52
HOXD13-201ENST00000392539 Q8N402 240 aa24.58■■□□□ 1.52
HOXD13-201ENST00000392539 PRDM9Q9NQV7 894 aa24.58■■□□□ 1.52
HOXD13-201ENST00000392539 ADAM30Q9UKF2 790 aa24.58■■□□□ 1.52
HOXD13-201ENST00000392539 EML2O95834 649 aa24.57■■□□□ 1.52
HOXD13-201ENST00000392539 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
HOXD13-201ENST00000392539 USP53Q70EK8 1073 aa24.57■■□□□ 1.52
HOXD13-201ENST00000392539 SIRT6Q8N6T7 355 aa24.57■■□□□ 1.52
HOXD13-201ENST00000392539 ZCCHC10Q8TBK6 192 aa24.57■■□□□ 1.52
HOXD13-201ENST00000392539 PRSS27Q9BQR3 290 aa24.57■■□□□ 1.52
HOXD13-201ENST00000392539 FN3KQ9H479 309 aa24.57■■□□□ 1.52
HOXD13-201ENST00000392539 URADA6NGE7 173 aa24.57■■□□□ 1.52
HOXD13-201ENST00000392539 NARSO43776 548 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
HOXD13-201ENST00000392539 B3GALT2O43825 422 aa24.57■■□□□ 1.52
HOXD13-201ENST00000392539 CSF2P04141 144 aa24.57■■□□□ 1.52
HOXD13-201ENST00000392539 PAICSP22234 425 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
HOXD13-201ENST00000392539 TNFRSF4P43489 277 aa24.57■■□□□ 1.52
HOXD13-201ENST00000392539 MAP2K3P46734 347 aa24.57■■□□□ 1.52
HOXD13-201ENST00000392539 CLDN2P57739 230 aa24.57■■□□□ 1.52
HOXD13-201ENST00000392539 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
HOXD13-201ENST00000392539 RIN1Q13671 783 aa24.57■■□□□ 1.52
HOXD13-201ENST00000392539 RUNX2Q13950 521 aa24.57■■□□□ 1.52
HOXD13-201ENST00000392539 GPR68Q15743 365 aa24.57■■□□□ 1.52
HOXD13-201ENST00000392539 EOGTQ5NDL2 527 aa24.57■■□□□ 1.52
HOXD13-201ENST00000392539 VASNQ6EMK4 673 aa24.57■■□□□ 1.52
HOXD13-201ENST00000392539 MZT2BQ6NZ67 158 aa24.57■■□□□ 1.52
HOXD13-201ENST00000392539 OR4N5Q8IXE1 308 aa24.57■■□□□ 1.52
HOXD13-201ENST00000392539 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
HOXD13-201ENST00000392539 OR52L1Q8NGH7 329 aa24.57■■□□□ 1.52
HOXD13-201ENST00000392539 OR51G2Q8NGK0 314 aa24.57■■□□□ 1.52
HOXD13-201ENST00000392539 OTULINQ96BN8 352 aa24.57■■□□□ 1.52
HOXD13-201ENST00000392539 DMRTB1Q96MA1 342 aa24.57■■□□□ 1.52
HOXD13-201ENST00000392539 KXD1Q9BQD3 176 aa24.57■■□□□ 1.52
HOXD13-201ENST00000392539 OR52D1Q9H346 318 aa24.57■■□□□ 1.52
HOXD13-201ENST00000392539 PIGUQ9H490 435 aa24.57■■□□□ 1.52
HOXD13-201ENST00000392539 CD8B2A6NJW9 211 aa24.56■■□□□ 1.52
HOXD13-201ENST00000392539 NCR1O76036 304 aa24.56■■□□□ 1.52
HOXD13-201ENST00000392539 CD8BP10966 210 aa24.56■■□□□ 1.52
HOXD13-201ENST00000392539 CPMP14384 443 aa24.56■■□□□ 1.52
HOXD13-201ENST00000392539 GDI1P31150 447 aa24.56■■□□□ 1.52
HOXD13-201ENST00000392539 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP24.56■■□□□ 1.52
HOXD13-201ENST00000392539 KIAA1024LP59773 190 aa24.56■■□□□ 1.52
HOXD13-201ENST00000392539 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP24.56■■□□□ 1.52
HOXD13-201ENST00000392539 MADCAM1Q13477 382 aa24.56■■□□□ 1.52
HOXD13-201ENST00000392539 KIR2DS3Q14952 304 aa24.56■■□□□ 1.52
HOXD13-201ENST00000392539 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP24.56■■□□□ 1.52
HOXD13-201ENST00000392539 ZNF619Q8N2I2 560 aa24.56■■□□□ 1.52
HOXD13-201ENST00000392539 SIMC1Q8NDZ2 872 aa24.56■■□□□ 1.52
HOXD13-201ENST00000392539 FANK1Q8TC84 345 aa24.56■■□□□ 1.52
HOXD13-201ENST00000392539 ZC3HAV1LQ96H79 300 aaKnown RBP24.56■■□□□ 1.52
HOXD13-201ENST00000392539 ZNF350Q9GZX5 532 aa24.56■■□□□ 1.52
HOXD13-201ENST00000392539 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP24.56■■□□□ 1.52
HOXD13-201ENST00000392539 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP24.56■■□□□ 1.52
HOXD13-201ENST00000392539 DAPP1Q9UN19 280 aa24.56■■□□□ 1.52
HOXD13-201ENST00000392539 SHISA3A0PJX4 238 aa24.55■■□□□ 1.52
HOXD13-201ENST00000392539 DBIP07108 87 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
HOXD13-201ENST00000392539 CA3P07451 260 aa24.55■■□□□ 1.52
HOXD13-201ENST00000392539 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP24.55■■□□□ 1.52
HOXD13-201ENST00000392539 ZGLP1P0C6A0 271 aa24.55■■□□□ 1.52
HOXD13-201ENST00000392539 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP24.55■■□□□ 1.52
HOXD13-201ENST00000392539 IL18Q14116 193 aa24.55■■□□□ 1.52
HOXD13-201ENST00000392539 DEFB134Q4QY38 66 aa24.55■■□□□ 1.52
HOXD13-201ENST00000392539 MEPCEQ7L2J0 689 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
HOXD13-201ENST00000392539 ACBD7Q8N6N7 88 aa24.55■■□□□ 1.52
HOXD13-201ENST00000392539 CD180Q99467 661 aa24.55■■□□□ 1.52
HOXD13-201ENST00000392539 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP24.55■■□□□ 1.52
HOXD13-201ENST00000392539 C19orf53Q9UNZ5 99 aaPredicted RBP24.55■■□□□ 1.52
HOXD13-201ENST00000392539 FAM183AA6NL82 134 aa24.55■■□□□ 1.52
HOXD13-201ENST00000392539 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP24.55■■□□□ 1.52
HOXD13-201ENST00000392539 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
HOXD13-201ENST00000392539 AK4P27144 223 aaPredicted RBP24.55■■□□□ 1.52
HOXD13-201ENST00000392539 HLA-DMAP28067 261 aa24.55■■□□□ 1.52
HOXD13-201ENST00000392539 CCNJQ5T5M9 372 aa24.55■■□□□ 1.52
HOXD13-201ENST00000392539 NIPAL3Q6P499 406 aa24.55■■□□□ 1.52
HOXD13-201ENST00000392539 PLBD1Q6P4A8 553 aa24.55■■□□□ 1.52
HOXD13-201ENST00000392539 PLET1Q6UQ28 207 aa24.55■■□□□ 1.52
HOXD13-201ENST00000392539 TMEM91Q6ZNR0 172 aa24.55■■□□□ 1.52
HOXD13-201ENST00000392539 OR1E3Q8WZA6 343 aa24.55■■□□□ 1.52
HOXD13-201ENST00000392539 OR2A5Q96R48 311 aa24.55■■□□□ 1.52
HOXD13-201ENST00000392539 DPH1Q9BZG8 443 aa24.55■■□□□ 1.52
HOXD13-201ENST00000392539 RNF32Q9H0A6 362 aa24.55■■□□□ 1.52
HOXD13-201ENST00000392539 NUFIP1Q9UHK0 495 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
HOXD13-201ENST00000392539 SCN2AQ99250 2005 aa24.55■■□□□ 1.52
HOXD13-201ENST00000392539 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa24.54■■□□□ 1.52
HOXD13-201ENST00000392539 K7EQS6 105 aa24.54■■□□□ 1.52
HOXD13-201ENST00000392539 RNF13O43567 381 aa24.54■■□□□ 1.52
HOXD13-201ENST00000392539 SLC19A2O60779 497 aa24.54■■□□□ 1.52
HOXD13-201ENST00000392539 PRKAR1AP10644 381 aa24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.6 ms