RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384545.1

RNU6-441P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 441, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-441P, Length 106 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-441P-201ENST00000384545 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP3.41□□□□□ -1.86
RNU6-441P-201ENST00000384545 ADAM28Q9UKQ2 775 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-441P-201ENST00000384545 ALG6Q9Y672 507 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-441P-201ENST00000384545 FRMPD4Q14CM0 1322 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-441P-201ENST00000384545 METP08581 1390 aa3.4□□□□□ -1.86
RNU6-441P-201ENST00000384545 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-441P-201ENST00000384545 LRRIQ4A6NIV6 560 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-441P-201ENST00000384545 SNTNA6NMZ2 147 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-441P-201ENST00000384545 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
RNU6-441P-201ENST00000384545 MSH4O15457 936 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-441P-201ENST00000384545 EFNA2O43921 213 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-441P-201ENST00000384545 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
RNU6-441P-201ENST00000384545 AGTP01019 485 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-441P-201ENST00000384545 IGLV1-44P01699 117 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-441P-201ENST00000384545 SP1P08047 785 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-441P-201ENST00000384545 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
RNU6-441P-201ENST00000384545 POU2F1P14859 743 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-441P-201ENST00000384545 NCK1P16333 377 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-441P-201ENST00000384545 SDC1P18827 310 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-441P-201ENST00000384545 GALP22466 123 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-441P-201ENST00000384545 SPRP35270 261 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
RNU6-441P-201ENST00000384545 RPL4P36578 427 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
RNU6-441P-201ENST00000384545 SSR1P43307 286 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
RNU6-441P-201ENST00000384545 P2RY1P47900 373 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-441P-201ENST00000384545 GSCP56915 257 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
RNU6-441P-201ENST00000384545 ZNF33BQ06732 778 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-441P-201ENST00000384545 COX10Q12887 443 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-441P-201ENST00000384545 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
RNU6-441P-201ENST00000384545 PCK2Q16822 640 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-441P-201ENST00000384545 ZFP69Q49AA0 526 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-441P-201ENST00000384545 TMEM52BQ4KMG9 183 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-441P-201ENST00000384545 SFT2D3Q587I9 215 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-441P-201ENST00000384545 SEL1L2Q5TEA6 688 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-441P-201ENST00000384545 REP15Q6BDI9 236 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-441P-201ENST00000384545 OR8G2PQ6IF36 304 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-441P-201ENST00000384545 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-441P-201ENST00000384545 VITQ6UXI7 678 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-441P-201ENST00000384545 IFNEQ86WN2 208 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-441P-201ENST00000384545 CLEC4FQ8N1N0 589 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-441P-201ENST00000384545 BPIFB2Q8N4F0 458 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-441P-201ENST00000384545 SSC4DQ8WTU2 575 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-441P-201ENST00000384545 SCFD1Q8WVM8 642 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-441P-201ENST00000384545 NTNG2Q96CW9 530 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-441P-201ENST00000384545 NSMCE3Q96MG7 304 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-441P-201ENST00000384545 CHRDL1Q9BU40 450 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-441P-201ENST00000384545 TSSK1BQ9BXA7 367 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-441P-201ENST00000384545 LRRN3Q9H3W5 708 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-441P-201ENST00000384545 SLC17A5Q9NRA2 495 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-441P-201ENST00000384545 ABCC13Q9NSE7 274 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-441P-201ENST00000384545 THEGQ9P2T0 379 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-441P-201ENST00000384545 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
RNU6-441P-201ENST00000384545 CACNG5Q9UF02 275 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-441P-201ENST00000384545 ZNF221Q9UK13 617 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-441P-201ENST00000384545 MEMO1Q9Y316 297 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-441P-201ENST00000384545 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-441P-201ENST00000384545 SMCHD1A6NHR9 2005 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-441P-201ENST00000384545 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-441P-201ENST00000384545 A0A087X002 238 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-441P-201ENST00000384545 A0A1B0GVL5 298 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-441P-201ENST00000384545 LRP5LA4QPB2 252 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-441P-201ENST00000384545 TRABD2BA6NFA1 517 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-441P-201ENST00000384545 NR5A2O00482 541 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-441P-201ENST00000384545 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
RNU6-441P-201ENST00000384545 NBR2O15453 112 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-441P-201ENST00000384545 SNAP91O60641 907 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-441P-201ENST00000384545 ZFAND5O76080 213 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-441P-201ENST00000384545 TSPAN12O95859 305 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-441P-201ENST00000384545 PGK1P00558 417 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-441P-201ENST00000384545 CA1P00915 261 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
RNU6-441P-201ENST00000384545 WNT2P09544 360 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-441P-201ENST00000384545 ALOX5P09917 674 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-441P-201ENST00000384545 ALPIP09923 528 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-441P-201ENST00000384545 CCR1P32246 355 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-441P-201ENST00000384545 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
RNU6-441P-201ENST00000384545 ARHGDIAP52565 204 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-441P-201ENST00000384545 PRMT2P55345 433 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-441P-201ENST00000384545 RIPPLY1Q0D2K3 151 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-441P-201ENST00000384545 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
RNU6-441P-201ENST00000384545 DPYSL2Q16555 572 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-441P-201ENST00000384545 MS4A13Q5J8X5 152 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-441P-201ENST00000384545 PDZK1Q5T2W1 519 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-441P-201ENST00000384545 ATL3Q6DD88 541 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-441P-201ENST00000384545 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-441P-201ENST00000384545 PRSS48Q7RTY5 328 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-441P-201ENST00000384545 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-441P-201ENST00000384545 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
RNU6-441P-201ENST00000384545 ERICH1Q86X53 443 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-441P-201ENST00000384545 RNF130Q86XS8 419 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-441P-201ENST00000384545 ARL14Q8N4G2 192 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-441P-201ENST00000384545 ZNF614Q8N883 585 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-441P-201ENST00000384545 ZNF491Q8N8L2 437 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-441P-201ENST00000384545 SUMF1Q8NBK3 374 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-441P-201ENST00000384545 AQP11Q8NBQ7 271 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-441P-201ENST00000384545 RFESDQ8TAC1 157 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-441P-201ENST00000384545 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-441P-201ENST00000384545 FNDC8Q8TC99 324 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-441P-201ENST00000384545 HCAR2Q8TDS4 363 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-441P-201ENST00000384545 MAIP1Q8WWC4 291 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-441P-201ENST00000384545 IL1F10Q8WWZ1 152 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-441P-201ENST00000384545 PARD6BQ9BYG5 372 aa3.39□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.9 ms