RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000359315.6

TPGS1-201, Transcript of tubulin polyglutamylase complex subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TPGS1, Length 1,114 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPGS1-201ENST00000359315 RNF6Q9Y252 685 aa24.47■■□□□ 1.51
TPGS1-201ENST00000359315 GTF3C1Q12789 2109 aa24.47■■□□□ 1.51
TPGS1-201ENST00000359315 DNAJC13O75165 2243 aa24.46■■□□□ 1.51
TPGS1-201ENST00000359315 PRSS44E7EML9 344 aa24.46■■□□□ 1.51
TPGS1-201ENST00000359315 NPIPB9F8W1W9 429 aa24.46■■□□□ 1.51
TPGS1-201ENST00000359315 OIP5O43482 229 aa24.46■■□□□ 1.51
TPGS1-201ENST00000359315 NDUFB5O43674 189 aa24.46■■□□□ 1.51
TPGS1-201ENST00000359315 ATP6V1C1P21283 382 aa24.46■■□□□ 1.51
TPGS1-201ENST00000359315 LCN1P31025 176 aa24.46■■□□□ 1.51
TPGS1-201ENST00000359315 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
TPGS1-201ENST00000359315 DCTP40126 519 aa24.46■■□□□ 1.51
TPGS1-201ENST00000359315 ADH7P40394 386 aa24.46■■□□□ 1.51
TPGS1-201ENST00000359315 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP24.46■■□□□ 1.51
TPGS1-201ENST00000359315 C17orf67Q0P5P2 114 aa24.46■■□□□ 1.51
TPGS1-201ENST00000359315 ACSF3Q4G176 576 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
TPGS1-201ENST00000359315 TMEM211Q6ICI0 200 aa24.46■■□□□ 1.51
TPGS1-201ENST00000359315 ARSKQ6UWY0 536 aa24.46■■□□□ 1.51
TPGS1-201ENST00000359315 ZNF621Q6ZSS3 439 aa24.46■■□□□ 1.51
TPGS1-201ENST00000359315 CHDHQ8NE62 594 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
TPGS1-201ENST00000359315 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa24.46■■□□□ 1.51
TPGS1-201ENST00000359315 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
TPGS1-201ENST00000359315 NPHS2Q9NP85 383 aa24.46■■□□□ 1.51
TPGS1-201ENST00000359315 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa24.45■■□□□ 1.5
TPGS1-201ENST00000359315 SHISA8B8ZZ34 492 aa24.45■■□□□ 1.5
TPGS1-201ENST00000359315 SCDO00767 359 aa24.45■■□□□ 1.5
TPGS1-201ENST00000359315 FCMRO60667 390 aa24.45■■□□□ 1.5
TPGS1-201ENST00000359315 ACTL6AO96019 429 aa24.45■■□□□ 1.5
TPGS1-201ENST00000359315 IL6P05231 212 aa24.45■■□□□ 1.5
TPGS1-201ENST00000359315 GABRA1P14867 456 aa24.45■■□□□ 1.5
TPGS1-201ENST00000359315 HK1P19367 917 aa24.45■■□□□ 1.5
TPGS1-201ENST00000359315 AGAP20933 346 aa24.45■■□□□ 1.5
TPGS1-201ENST00000359315 MRPL19P49406 292 aaKnown RBP24.45■■□□□ 1.5
TPGS1-201ENST00000359315 ART3Q13508 389 aa24.45■■□□□ 1.5
TPGS1-201ENST00000359315 NDUFAF6Q330K2 333 aa24.45■■□□□ 1.5
TPGS1-201ENST00000359315 FLYWCH1Q4VC44 716 aa24.45■■□□□ 1.5
TPGS1-201ENST00000359315 ZNF787Q6DD87 383 aa24.45■■□□□ 1.5
TPGS1-201ENST00000359315 RNF130Q86XS8 419 aa24.45■■□□□ 1.5
TPGS1-201ENST00000359315 FUNDC1Q8IVP5 155 aa24.45■■□□□ 1.5
TPGS1-201ENST00000359315 PNPT1Q8TCS8 783 aaKnown RBP24.45■■□□□ 1.5
TPGS1-201ENST00000359315 RND1Q92730 232 aa24.45■■□□□ 1.5
TPGS1-201ENST00000359315 NPAS1Q99742 590 aa24.45■■□□□ 1.5
TPGS1-201ENST00000359315 KCNE5Q9UJ90 142 aa24.45■■□□□ 1.5
TPGS1-201ENST00000359315 DCTN4Q9UJW0 460 aa24.45■■□□□ 1.5
TPGS1-201ENST00000359315 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa24.45■■□□□ 1.5
TPGS1-201ENST00000359315 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP24.45■■□□□ 1.5
TPGS1-201ENST00000359315 A0A1W2PQD3 144 aa24.44■■□□□ 1.5
TPGS1-201ENST00000359315 FAM234BA2RU67 622 aa24.44■■□□□ 1.5
TPGS1-201ENST00000359315 RFXANKO14593 260 aa24.44■■□□□ 1.5
TPGS1-201ENST00000359315 TOXO94900 526 aa24.44■■□□□ 1.5
TPGS1-201ENST00000359315 LHX2P50458 406 aa24.44■■□□□ 1.5
TPGS1-201ENST00000359315 COX20Q5RI15 118 aa24.44■■□□□ 1.5
TPGS1-201ENST00000359315 RAET1LQ5VY80 246 aa24.44■■□□□ 1.5
TPGS1-201ENST00000359315 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa24.44■■□□□ 1.5
TPGS1-201ENST00000359315 PLXDC2Q6UX71 529 aa24.44■■□□□ 1.5
TPGS1-201ENST00000359315 XAGE5Q8WWM1 108 aa24.44■■□□□ 1.5
TPGS1-201ENST00000359315 MRPS18CQ9Y3D5 142 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
TPGS1-201ENST00000359315 A0A0G2JNJ9 132 aa24.43■■□□□ 1.5
TPGS1-201ENST00000359315 DUXAA6NLW8 204 aa24.43■■□□□ 1.5
TPGS1-201ENST00000359315 C19orf84I3L1E1 186 aa24.43■■□□□ 1.5
TPGS1-201ENST00000359315 TNFRSF21O75509 655 aa24.43■■□□□ 1.5
TPGS1-201ENST00000359315 CLDN14O95500 239 aa24.43■■□□□ 1.5
TPGS1-201ENST00000359315 HPGDP15428 266 aa24.43■■□□□ 1.5
TPGS1-201ENST00000359315 KHKP50053 298 aa24.43■■□□□ 1.5
TPGS1-201ENST00000359315 STX1BP61266 288 aa24.43■■□□□ 1.5
TPGS1-201ENST00000359315 SRYQ05066 204 aa24.43■■□□□ 1.5
TPGS1-201ENST00000359315 KLHL26Q53HC5 615 aa24.43■■□□□ 1.5
TPGS1-201ENST00000359315 SLC2A7Q6PXP3 512 aa24.43■■□□□ 1.5
TPGS1-201ENST00000359315 ZNF350Q9GZX5 532 aa24.43■■□□□ 1.5
TPGS1-201ENST00000359315 Q9UFV3 132 aa24.43■■□□□ 1.5
TPGS1-201ENST00000359315 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
TPGS1-201ENST00000359315 AHRRA9YTQ3 701 aa24.42■■□□□ 1.5
TPGS1-201ENST00000359315 HMGN4O00479 90 aa24.42■■□□□ 1.5
TPGS1-201ENST00000359315 HTR1EP28566 365 aa24.42■■□□□ 1.5
TPGS1-201ENST00000359315 ATP12AP54707 1039 aa24.42■■□□□ 1.5
TPGS1-201ENST00000359315 CLDN18P56856 261 aa24.42■■□□□ 1.5
TPGS1-201ENST00000359315 ZNF117Q03924 483 aa24.42■■□□□ 1.5
TPGS1-201ENST00000359315 GANABQ14697 944 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
TPGS1-201ENST00000359315 GPR68Q15743 365 aa24.42■■□□□ 1.5
TPGS1-201ENST00000359315 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa24.42■■□□□ 1.5
TPGS1-201ENST00000359315 C16orf62Q7Z3J2 963 aa24.42■■□□□ 1.5
TPGS1-201ENST00000359315 HMGN2P46Q86SG4 172 aa24.42■■□□□ 1.5
TPGS1-201ENST00000359315 PM20D2Q8IYS1 436 aa24.42■■□□□ 1.5
TPGS1-201ENST00000359315 ZNF614Q8N883 585 aa24.42■■□□□ 1.5
TPGS1-201ENST00000359315 NAXEQ8NCW5 288 aa24.42■■□□□ 1.5
TPGS1-201ENST00000359315 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa24.42■■□□□ 1.5
TPGS1-201ENST00000359315 AURKBQ96GD4 344 aaPredicted RBP24.42■■□□□ 1.5
TPGS1-201ENST00000359315 TUBA1CQ9BQE3 449 aa24.42■■□□□ 1.5
TPGS1-201ENST00000359315 PTGES2Q9H7Z7 377 aa24.42■■□□□ 1.5
TPGS1-201ENST00000359315 COQ3Q9NZJ6 369 aa24.42■■□□□ 1.5
TPGS1-201ENST00000359315 MKLN1Q9UL63 735 aa24.42■■□□□ 1.5
TPGS1-201ENST00000359315 VDAC3Q9Y277 283 aa24.42■■□□□ 1.5
TPGS1-201ENST00000359315 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
TPGS1-201ENST00000359315 OR2M5A3KFT3 312 aa24.41■■□□□ 1.5
TPGS1-201ENST00000359315 FAM90A27PA6NNH2 459 aa24.41■■□□□ 1.5
TPGS1-201ENST00000359315 SOX30O94993 753 aa24.41■■□□□ 1.5
TPGS1-201ENST00000359315 CPN1P15169 458 aa24.41■■□□□ 1.5
TPGS1-201ENST00000359315 ZNF708P17019 499 aa24.41■■□□□ 1.5
TPGS1-201ENST00000359315 GCKP35557 465 aa24.41■■□□□ 1.5
TPGS1-201ENST00000359315 MVDP53602 400 aa24.41■■□□□ 1.5
TPGS1-201ENST00000359315 GUCY1A3Q02108 690 aa24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.8 ms