RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345512.7

PTPRU-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRU, Length 4,470 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-201ENST00000345512 DNASE1L1P49184 302 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRU-201ENST00000345512 DEFA5Q01523 94 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRU-201ENST00000345512 HYAL2Q12891 473 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRU-201ENST00000345512 SSX1Q16384 188 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRU-201ENST00000345512 PRRT3Q5FWE3 981 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRU-201ENST00000345512 LAS2Q8IYD9 372 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRU-201ENST00000345512 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
PTPRU-201ENST00000345512 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
PTPRU-201ENST00000345512 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRU-201ENST00000345512 FZD3Q9NPG1 666 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRU-201ENST00000345512 UPB1Q9UBR1 384 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRU-201ENST00000345512 KLHL21Q9UJP4 597 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRU-201ENST00000345512 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRU-201ENST00000345512 MIA3Q5JRA6 1907 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRU-201ENST00000345512 A0A087WUU8 490 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRU-201ENST00000345512 OR7A10O76100 309 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRU-201ENST00000345512 FCN2Q15485 313 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRU-201ENST00000345512 AMZ1Q400G9 498 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRU-201ENST00000345512 COMMD7Q86VX2 200 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRU-201ENST00000345512 OR6F1Q8NGZ6 308 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRU-201ENST00000345512 C15orf40Q8WUR7 153 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRU-201ENST00000345512 SPACA7Q96KW9 195 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRU-201ENST00000345512 MS4A4EQ96PG1 132 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRU-201ENST00000345512 SPNS1Q9H2V7 528 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRU-201ENST00000345512 Q9N2J8 555 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRU-201ENST00000345512 A8MVJ9 347 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRU-201ENST00000345512 GNRH1P01148 92 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRU-201ENST00000345512 PSMA3P25788 255 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRU-201ENST00000345512 ETV6P41212 452 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRU-201ENST00000345512 MAP3K8P41279 467 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRU-201ENST00000345512 CDK3Q00526 305 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRU-201ENST00000345512 LAIR2Q6ISS4 152 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRU-201ENST00000345512 PAQR7Q86WK9 346 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRU-201ENST00000345512 SERPINA12Q8IW75 414 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRU-201ENST00000345512 OR5K2Q8NHB8 316 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRU-201ENST00000345512 NXPE2Q96DL1 559 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRU-201ENST00000345512 ALG14Q96F25 216 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRU-201ENST00000345512 C19orf43Q9BQ61 176 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRU-201ENST00000345512 KXD1Q9BQD3 176 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRU-201ENST00000345512 EXO5Q9H790 373 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRU-201ENST00000345512 NIPAL2Q9H841 368 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRU-201ENST00000345512 CD93Q9NPY3 652 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRU-201ENST00000345512 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
PTPRU-201ENST00000345512 TMEM129A0AVI4 362 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRU-201ENST00000345512 DPM1O60762 260 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRU-201ENST00000345512 SLC43A1O75387 559 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRU-201ENST00000345512 KRT33AO76009 404 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRU-201ENST00000345512 AIFM1O95831 613 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRU-201ENST00000345512 RENP00797 406 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRU-201ENST00000345512 ADH7P40394 386 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRU-201ENST00000345512 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
PTPRU-201ENST00000345512 ZNF234Q14588 700 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRU-201ENST00000345512 ALG10BQ5I7T1 473 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRU-201ENST00000345512 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRU-201ENST00000345512 Q6ZNB5 142 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRU-201ENST00000345512 MEPCEQ7L2J0 689 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
PTPRU-201ENST00000345512 TMPRSS12Q86WS5 348 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRU-201ENST00000345512 KIF18BQ86Y91 864 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRU-201ENST00000345512 SMPDL3BQ92485 455 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRU-201ENST00000345512 COQ10AQ96MF6 247 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRU-201ENST00000345512 CNN2Q99439 309 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
PTPRU-201ENST00000345512 A0A1W2PQU0 124 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRU-201ENST00000345512 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
PTPRU-201ENST00000345512 LRRTM2O43300 516 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRU-201ENST00000345512 RNF13O43567 381 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRU-201ENST00000345512 ECDO95905 644 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
PTPRU-201ENST00000345512 MT-ND4P03905 459 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRU-201ENST00000345512 EFR3AQ14156 821 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRU-201ENST00000345512 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
PTPRU-201ENST00000345512 WDR45BQ5MNZ6 344 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRU-201ENST00000345512 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
PTPRU-201ENST00000345512 CCDC36Q8IYA8 594 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRU-201ENST00000345512 OR8S1Q8NH09 359 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRU-201ENST00000345512 SLC25A36Q96CQ1 311 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRU-201ENST00000345512 PSMD9O00233 223 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRU-201ENST00000345512 PRAMEF4O60810 478 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRU-201ENST00000345512 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
PTPRU-201ENST00000345512 RBBP9O75884 186 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRU-201ENST00000345512 CPEP16870 476 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRU-201ENST00000345512 ACTA2P62736 377 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRU-201ENST00000345512 ACTG2P63267 376 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRU-201ENST00000345512 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRU-201ENST00000345512 C18orf63Q68DL7 685 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRU-201ENST00000345512 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
PTPRU-201ENST00000345512 GATSQ8NAP1 163 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRU-201ENST00000345512 NSMAFQ92636 917 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRU-201ENST00000345512 BPIFA2Q96DR5 249 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRU-201ENST00000345512 CCDC120Q96HB5 630 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRU-201ENST00000345512 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
PTPRU-201ENST00000345512 ARL6Q9H0F7 186 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRU-201ENST00000345512 FTSJ1Q9UET6 329 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRU-201ENST00000345512 TRAV27A0A087WT01 109 aa14.55□□□□□ -0.08
PTPRU-201ENST00000345512 A0A0G2JMP0 313 aa14.55□□□□□ -0.08
PTPRU-201ENST00000345512 A0A0X1KG70 313 aa14.55□□□□□ -0.08
PTPRU-201ENST00000345512 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
PTPRU-201ENST00000345512 CCL5P13501 91 aa14.55□□□□□ -0.08
PTPRU-201ENST00000345512 PRMT2P55345 433 aa14.55□□□□□ -0.08
PTPRU-201ENST00000345512 POU4F2Q12837 409 aa14.55□□□□□ -0.08
PTPRU-201ENST00000345512 OR4M2Q8NGB6 313 aa14.55□□□□□ -0.08
PTPRU-201ENST00000345512 TM7SF3Q9NS93 570 aa14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.8 ms