RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318988.10

CTDNEP1-201, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-201ENST00000318988 B3GNTL1Q67FW5 361 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
CTDNEP1-201ENST00000318988 CARM1Q86X55 608 aa25.21■■□□□ 1.63
CTDNEP1-201ENST00000318988 CMIPQ8IY22 773 aa25.21■■□□□ 1.63
CTDNEP1-201ENST00000318988 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
CTDNEP1-201ENST00000318988 IL1RAPQ9NPH3 570 aa25.21■■□□□ 1.63
CTDNEP1-201ENST00000318988 FLRT3Q9NZU0 649 aa25.21■■□□□ 1.63
CTDNEP1-201ENST00000318988 SERINC4A6NH21 518 aa25.2■■□□□ 1.62
CTDNEP1-201ENST00000318988 H3BNX3 289 aa25.2■■□□□ 1.62
CTDNEP1-201ENST00000318988 EFSO43281 561 aa25.2■■□□□ 1.62
CTDNEP1-201ENST00000318988 MAN1A2O60476 641 aa25.2■■□□□ 1.62
CTDNEP1-201ENST00000318988 TIPRLO75663 272 aa25.2■■□□□ 1.62
CTDNEP1-201ENST00000318988 ATP6V1G2O95670 118 aa25.2■■□□□ 1.62
CTDNEP1-201ENST00000318988 MT-ND1P03886 318 aa25.2■■□□□ 1.62
CTDNEP1-201ENST00000318988 ITGA2P17301 1181 aa25.2■■□□□ 1.62
CTDNEP1-201ENST00000318988 FGFBP1Q14512 234 aa25.2■■□□□ 1.62
CTDNEP1-201ENST00000318988 NTRK2Q16620 822 aa25.2■■□□□ 1.62
CTDNEP1-201ENST00000318988 KLHL26Q53HC5 615 aa25.2■■□□□ 1.62
CTDNEP1-201ENST00000318988 LYPD8Q6UX82 237 aa25.2■■□□□ 1.62
CTDNEP1-201ENST00000318988 IL20RBQ6UXL0 311 aa25.2■■□□□ 1.62
CTDNEP1-201ENST00000318988 PSMF1Q92530 271 aa25.2■■□□□ 1.62
CTDNEP1-201ENST00000318988 RLIMQ9NVW2 624 aa25.2■■□□□ 1.62
CTDNEP1-201ENST00000318988 HPF1Q9NWY4 346 aa25.2■■□□□ 1.62
CTDNEP1-201ENST00000318988 STMN3Q9NZ72 180 aa25.2■■□□□ 1.62
CTDNEP1-201ENST00000318988 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa25.2■■□□□ 1.62
CTDNEP1-201ENST00000318988 CLDN24A6NM45 220 aa25.19■■□□□ 1.62
CTDNEP1-201ENST00000318988 hCG_2039718K7EN88 272 aa25.19■■□□□ 1.62
CTDNEP1-201ENST00000318988 OR6B1O95007 311 aa25.19■■□□□ 1.62
CTDNEP1-201ENST00000318988 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
CTDNEP1-201ENST00000318988 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
CTDNEP1-201ENST00000318988 EVI2BP34910 448 aa25.19■■□□□ 1.62
CTDNEP1-201ENST00000318988 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
CTDNEP1-201ENST00000318988 DEFB109BQ30KR1 87 aa25.19■■□□□ 1.62
CTDNEP1-201ENST00000318988 BROXQ5VW32 411 aa25.19■■□□□ 1.62
CTDNEP1-201ENST00000318988 DESI1Q6ICB0 168 aa25.19■■□□□ 1.62
CTDNEP1-201ENST00000318988 CCDC81Q6ZN84 652 aa25.19■■□□□ 1.62
CTDNEP1-201ENST00000318988 CLIP4Q8N3C7 705 aa25.19■■□□□ 1.62
CTDNEP1-201ENST00000318988 EVA1AQ9H8M9 152 aa25.19■■□□□ 1.62
CTDNEP1-201ENST00000318988 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa25.19■■□□□ 1.62
CTDNEP1-201ENST00000318988 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
CTDNEP1-201ENST00000318988 A6NL46 340 aa25.18■■□□□ 1.62
CTDNEP1-201ENST00000318988 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
CTDNEP1-201ENST00000318988 CSTAP01040 98 aa25.18■■□□□ 1.62
CTDNEP1-201ENST00000318988 SEMG1P04279 462 aa25.18■■□□□ 1.62
CTDNEP1-201ENST00000318988 FASP25445 335 aa25.18■■□□□ 1.62
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF791Q3KP31 576 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
CTDNEP1-201ENST00000318988 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa25.18■■□□□ 1.62
CTDNEP1-201ENST00000318988 GATA6Q92908 595 aa25.18■■□□□ 1.62
CTDNEP1-201ENST00000318988 HGDQ93099 445 aa25.18■■□□□ 1.62
CTDNEP1-201ENST00000318988 DCBLD2Q96PD2 775 aa25.18■■□□□ 1.62
CTDNEP1-201ENST00000318988 ABCG2Q9UNQ0 655 aa25.18■■□□□ 1.62
CTDNEP1-201ENST00000318988 CDHR4A6H8M9 788 aa25.17■■□□□ 1.62
CTDNEP1-201ENST00000318988 M0R3H8 397 aa25.17■■□□□ 1.62
CTDNEP1-201ENST00000318988 ANPEPP15144 967 aa25.17■■□□□ 1.62
CTDNEP1-201ENST00000318988 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
CTDNEP1-201ENST00000318988 RGS8P57771 180 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
CTDNEP1-201ENST00000318988 SPACA3Q8IXA5 215 aa25.17■■□□□ 1.62
CTDNEP1-201ENST00000318988 ARHGDIGQ99819 225 aa25.17■■□□□ 1.62
CTDNEP1-201ENST00000318988 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
CTDNEP1-201ENST00000318988 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
CTDNEP1-201ENST00000318988 A0A1W2PQD3 144 aa25.17■■□□□ 1.62
CTDNEP1-201ENST00000318988 ALG1L2C9J202 215 aa25.17■■□□□ 1.62
CTDNEP1-201ENST00000318988 GNGT2O14610 69 aa25.17■■□□□ 1.62
CTDNEP1-201ENST00000318988 NDUFB5O43674 189 aa25.17■■□□□ 1.62
CTDNEP1-201ENST00000318988 CASRP41180 1078 aa25.17■■□□□ 1.62
CTDNEP1-201ENST00000318988 MAGEA2P43356 314 aa25.17■■□□□ 1.62
CTDNEP1-201ENST00000318988 SOX8P57073 446 aa25.17■■□□□ 1.62
CTDNEP1-201ENST00000318988 VLDLRP98155 873 aa25.17■■□□□ 1.62
CTDNEP1-201ENST00000318988 NRF1Q16656 503 aa25.17■■□□□ 1.62
CTDNEP1-201ENST00000318988 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa25.17■■□□□ 1.62
CTDNEP1-201ENST00000318988 FBXW10Q5XX13 1052 aa25.17■■□□□ 1.62
CTDNEP1-201ENST00000318988 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa25.17■■□□□ 1.62
CTDNEP1-201ENST00000318988 CYP4Z1Q86W10 505 aa25.17■■□□□ 1.62
CTDNEP1-201ENST00000318988 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa25.17■■□□□ 1.62
CTDNEP1-201ENST00000318988 BEST3Q8N1M1 668 aa25.17■■□□□ 1.62
CTDNEP1-201ENST00000318988 GATSQ8NAP1 163 aa25.17■■□□□ 1.62
CTDNEP1-201ENST00000318988 POGLUT1Q8NBL1 392 aa25.17■■□□□ 1.62
CTDNEP1-201ENST00000318988 OR10G3Q8NGC4 313 aa25.17■■□□□ 1.62
CTDNEP1-201ENST00000318988 C7orf34Q96L11 122 aa25.17■■□□□ 1.62
CTDNEP1-201ENST00000318988 AGAP4Q96P64 663 aa25.17■■□□□ 1.62
CTDNEP1-201ENST00000318988 NODALQ96S42 347 aa25.17■■□□□ 1.62
CTDNEP1-201ENST00000318988 METTL7AQ9H8H3 244 aa25.17■■□□□ 1.62
CTDNEP1-201ENST00000318988 GPR83Q9NYM4 423 aa25.17■■□□□ 1.62
CTDNEP1-201ENST00000318988 SCO2O43819 266 aa25.16■■□□□ 1.62
CTDNEP1-201ENST00000318988 FADS1O60427 444 aa25.16■■□□□ 1.62
CTDNEP1-201ENST00000318988 CYP7B1O75881 506 aa25.16■■□□□ 1.62
CTDNEP1-201ENST00000318988 EPPINO95925 133 aa25.16■■□□□ 1.62
CTDNEP1-201ENST00000318988 CST1P01037 141 aa25.16■■□□□ 1.62
CTDNEP1-201ENST00000318988 UBL4AP11441 157 aa25.16■■□□□ 1.62
CTDNEP1-201ENST00000318988 ADH7P40394 386 aa25.16■■□□□ 1.62
CTDNEP1-201ENST00000318988 DEF8Q6ZN54 512 aa25.16■■□□□ 1.62
CTDNEP1-201ENST00000318988 ERMP1Q7Z2K6 904 aa25.16■■□□□ 1.62
CTDNEP1-201ENST00000318988 PIWIL3Q7Z3Z3 882 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
CTDNEP1-201ENST00000318988 COMTD1Q86VU5 262 aa25.16■■□□□ 1.62
CTDNEP1-201ENST00000318988 PQLC1Q8N2U9 271 aa25.16■■□□□ 1.62
CTDNEP1-201ENST00000318988 LRTOMTQ8WZ04 291 aa25.16■■□□□ 1.62
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF347Q96SE7 839 aa25.16■■□□□ 1.62
CTDNEP1-201ENST00000318988 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa25.16■■□□□ 1.62
CTDNEP1-201ENST00000318988 KLRF1Q9NZS2 232 aa25.16■■□□□ 1.62
CTDNEP1-201ENST00000318988 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
CTDNEP1-201ENST00000318988 CHST2Q9Y4C5 530 aa25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.1 ms