RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293826.4

TNFSF12-TNFSF13-201, Transcript of TNFSF12-TNFSF13 readthrough, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TNFSF12-TNFSF13, Length 1,816 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 COMTD1Q86VU5 262 aa22.03■■□□□ 1.12
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CYP4Z1Q86W10 505 aa22.03■■□□□ 1.12
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 IMMP1LQ96LU5 166 aa22.03■■□□□ 1.12
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ZNF354BQ96LW1 612 aa22.03■■□□□ 1.12
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 GPR87Q9BY21 358 aa22.03■■□□□ 1.12
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ZNF160Q9HCG1 818 aa22.03■■□□□ 1.12
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 Q9N2J8 555 aa22.03■■□□□ 1.12
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 MYRFQ9Y2G1 1151 aa22.03■■□□□ 1.12
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 OR10H1Q9Y4A9 318 aa22.03■■□□□ 1.12
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa22.03■■□□□ 1.12
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TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CD82P27701 267 aa22.02■■□□□ 1.12
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TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ST13P50502 369 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
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TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SLC29A4Q7RTT9 530 aa22.02■■□□□ 1.12
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TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ZNF350Q9GZX5 532 aa22.02■■□□□ 1.12
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 KCNE5Q9UJ90 142 aa22.02■■□□□ 1.12
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CBLCQ9ULV8 474 aa22.02■■□□□ 1.12
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 WDR45Q9Y484 360 aa22.02■■□□□ 1.12
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 DSPPQ9NZW4 1301 aa22.02■■□□□ 1.12
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TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 YAP1P46937 504 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SPIBQ01892 262 aa22.01■■□□□ 1.11
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 FOXB2Q5VYV0 432 aa22.01■■□□□ 1.11
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 FAHD1Q6P587 224 aa22.01■■□□□ 1.11
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 HSDL2Q6YN16 418 aa22.01■■□□□ 1.11
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 OFCC1Q8IZS5 231 aa22.01■■□□□ 1.11
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 OR4C15Q8NGM1 316 aa22.01■■□□□ 1.11
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
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TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TSC22D3Q99576 134 aa22.01■■□□□ 1.11
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PEX12O00623 359 aa22.01■■□□□ 1.11
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ZNF354AO60765 605 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 LIFP15018 202 aa22.01■■□□□ 1.11
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PIGAP37287 484 aa22.01■■□□□ 1.11
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 RPL5P46777 297 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 HMGA2P52926 109 aa22.01■■□□□ 1.11
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 HPCAP84074 193 aa22.01■■□□□ 1.11
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 MAPK14Q16539 360 aa22.01■■□□□ 1.11
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
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TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ZNF441Q8N8Z8 693 aa22.01■■□□□ 1.11
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TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 WFDC6Q9BQY6 131 aa22.01■■□□□ 1.11
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SCNM1Q9BWG6 230 aa22.01■■□□□ 1.11
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
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TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 FRG2CA6NGY1 282 aa22■■□□□ 1.11
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TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 OR6C76A6NM76 312 aa22■■□□□ 1.11
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 IGHEP01854 428 aa22■■□□□ 1.11
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa22■■□□□ 1.11
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ZNF605Q86T29 641 aa22■■□□□ 1.11
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ATG16L2Q8NAA4 619 aa22■■□□□ 1.11
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PIK3C3Q8NEB9 887 aa22■■□□□ 1.11
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 GIPC3Q8TF64 312 aa22■■□□□ 1.11
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TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa21.99■■□□□ 1.11
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 WWP2O00308 870 aa21.99■■□□□ 1.11
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 MITFO75030 526 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 Q0VFX4 171 aa21.99■■□□□ 1.11
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ATP1A4Q13733 1029 aa21.99■■□□□ 1.11
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 MRGPREQ86SM8 312 aa21.99■■□□□ 1.11
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ELP5Q8TE02 316 aa21.99■■□□□ 1.11
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 KCND3Q9UK17 655 aa21.99■■□□□ 1.11
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CHST2Q9Y4C5 530 aa21.99■■□□□ 1.11
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa21.98■■□□□ 1.11
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 A0A1W2PQ72 361 aa21.98■■□□□ 1.11
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 MICAQ29983 383 aa21.98■■□□□ 1.11
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 KCTD21Q4G0X4 260 aa21.98■■□□□ 1.11
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PLAG1Q6DJT9 500 aa21.98■■□□□ 1.11
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