RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000265340.11

PITX1-201, Transcript of paired like homeodomain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PITX1, Length 2,406 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1-201ENST00000265340 ALKBH2Q6NS38 261 aa20.53■□□□□ 0.88
PITX1-201ENST00000265340 PTOV1Q86YD1 416 aa20.53■□□□□ 0.88
PITX1-201ENST00000265340 ARMC10Q8N2F6 343 aa20.53■□□□□ 0.88
PITX1-201ENST00000265340 OXR1Q8N573 874 aa20.53■□□□□ 0.88
PITX1-201ENST00000265340 VN1R2Q8NFZ6 395 aa20.53■□□□□ 0.88
PITX1-201ENST00000265340 OR2AP1Q8NGE2 309 aa20.53■□□□□ 0.88
PITX1-201ENST00000265340 MOGAT1Q96PD6 335 aa20.53■□□□□ 0.88
PITX1-201ENST00000265340 HHIPQ96QV1 700 aa20.53■□□□□ 0.88
PITX1-201ENST00000265340 BOCQ9BWV1 1114 aa20.53■□□□□ 0.88
PITX1-201ENST00000265340 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
PITX1-201ENST00000265340 ISYNA1Q9NPH2 558 aa20.53■□□□□ 0.88
PITX1-201ENST00000265340 TAS2R3Q9NYW6 316 aa20.53■□□□□ 0.88
PITX1-201ENST00000265340 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa20.53■□□□□ 0.88
PITX1-201ENST00000265340 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
PITX1-201ENST00000265340 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa20.52■□□□□ 0.88
PITX1-201ENST00000265340 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa20.52■□□□□ 0.88
PITX1-201ENST00000265340 PHYHO14832 338 aa20.52■□□□□ 0.88
PITX1-201ENST00000265340 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
PITX1-201ENST00000265340 FOLR2P14207 255 aa20.52■□□□□ 0.88
PITX1-201ENST00000265340 CSNK1DP48730 415 aa20.52■□□□□ 0.88
PITX1-201ENST00000265340 RAP2BP61225 183 aa20.52■□□□□ 0.88
PITX1-201ENST00000265340 FABP5Q01469 135 aa20.52■□□□□ 0.88
PITX1-201ENST00000265340 CACNG1Q06432 222 aa20.52■□□□□ 0.88
PITX1-201ENST00000265340 ILKQ13418 452 aa20.52■□□□□ 0.88
PITX1-201ENST00000265340 DEF8Q6ZN54 512 aa20.52■□□□□ 0.88
PITX1-201ENST00000265340 SLC9B2Q86UD5 537 aa20.52■□□□□ 0.88
PITX1-201ENST00000265340 SLC44A3Q8N4M1 653 aa20.52■□□□□ 0.88
PITX1-201ENST00000265340 SPICQ8N5J4 248 aa20.52■□□□□ 0.88
PITX1-201ENST00000265340 OR5M3Q8NGP4 307 aa20.52■□□□□ 0.88
PITX1-201ENST00000265340 NR4A3Q92570 626 aa20.52■□□□□ 0.88
PITX1-201ENST00000265340 ESAMQ96AP7 390 aa20.52■□□□□ 0.88
PITX1-201ENST00000265340 PEX11GQ96HA9 241 aa20.52■□□□□ 0.88
PITX1-201ENST00000265340 IL26Q9NPH9 171 aa20.52■□□□□ 0.88
PITX1-201ENST00000265340 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
PITX1-201ENST00000265340 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
PITX1-201ENST00000265340 MEX3AA1L020 520 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.87
PITX1-201ENST00000265340 AGAP14A8MT82 685 aa20.52■□□□□ 0.87
PITX1-201ENST00000265340 SUV39H1O43463 412 aa20.52■□□□□ 0.87
PITX1-201ENST00000265340 FZD7O75084 574 aa20.52■□□□□ 0.87
PITX1-201ENST00000265340 STX11O75558 287 aa20.52■□□□□ 0.87
PITX1-201ENST00000265340 IGSF6O95976 241 aa20.52■□□□□ 0.87
PITX1-201ENST00000265340 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.87
PITX1-201ENST00000265340 ZNF660Q6AZW8 331 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.87
PITX1-201ENST00000265340 UQCC3Q6UW78 93 aa20.52■□□□□ 0.87
PITX1-201ENST00000265340 SSX9Q7RTT3 188 aa20.52■□□□□ 0.87
PITX1-201ENST00000265340 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.87
PITX1-201ENST00000265340 SERPINA12Q8IW75 414 aa20.52■□□□□ 0.87
PITX1-201ENST00000265340 LNX2Q8N448 690 aa20.52■□□□□ 0.87
PITX1-201ENST00000265340 RXFP4Q8TDU9 374 aa20.52■□□□□ 0.87
PITX1-201ENST00000265340 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.87
PITX1-201ENST00000265340 CHIAQ9BZP6 476 aa20.52■□□□□ 0.87
PITX1-201ENST00000265340 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa20.52■□□□□ 0.87
PITX1-201ENST00000265340 HMSDA8MTL9 139 aa20.51■□□□□ 0.87
PITX1-201ENST00000265340 PRAF2O60831 178 aa20.51■□□□□ 0.87
PITX1-201ENST00000265340 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
PITX1-201ENST00000265340 HEXAP06865 529 aa20.51■□□□□ 0.87
PITX1-201ENST00000265340 CBSLP0DN79 551 aa20.51■□□□□ 0.87
PITX1-201ENST00000265340 CBSP35520 551 aa20.51■□□□□ 0.87
PITX1-201ENST00000265340 PTGER3P43115 390 aa20.51■□□□□ 0.87
PITX1-201ENST00000265340 SRP9P49458 86 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
PITX1-201ENST00000265340 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
PITX1-201ENST00000265340 ATAT1Q5SQI0 421 aa20.51■□□□□ 0.87
PITX1-201ENST00000265340 SLITRK4Q8IW52 837 aa20.51■□□□□ 0.87
PITX1-201ENST00000265340 IL4I1Q96RQ9 567 aa20.51■□□□□ 0.87
PITX1-201ENST00000265340 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
PITX1-201ENST00000265340 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
PITX1-201ENST00000265340 SOCS5O75159 536 aa20.51■□□□□ 0.87
PITX1-201ENST00000265340 EGFP01133 1207 aa20.51■□□□□ 0.87
PITX1-201ENST00000265340 MUC1P15941 1255 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
PITX1-201ENST00000265340 TAS2R60P59551 318 aa20.51■□□□□ 0.87
PITX1-201ENST00000265340 RNF4P78317 190 aa20.51■□□□□ 0.87
PITX1-201ENST00000265340 C3orf33Q6P1S2 294 aa20.51■□□□□ 0.87
PITX1-201ENST00000265340 SERPINA9Q86WD7 417 aa20.51■□□□□ 0.87
PITX1-201ENST00000265340 SLC43A2Q8N370 569 aa20.51■□□□□ 0.87
PITX1-201ENST00000265340 SYNPOQ8N3V7 929 aa20.51■□□□□ 0.87
PITX1-201ENST00000265340 OR9Q2Q8NGE9 314 aa20.51■□□□□ 0.87
PITX1-201ENST00000265340 LINGO1Q96FE5 620 aa20.51■□□□□ 0.87
PITX1-201ENST00000265340 TDP1Q9NUW8 608 aa20.51■□□□□ 0.87
PITX1-201ENST00000265340 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa20.51■□□□□ 0.87
PITX1-201ENST00000265340 HS3ST2Q9Y278 367 aa20.51■□□□□ 0.87
PITX1-201ENST00000265340 TLR4O00206 839 aa20.5■□□□□ 0.87
PITX1-201ENST00000265340 SLC31A2O15432 143 aa20.5■□□□□ 0.87
PITX1-201ENST00000265340 NCR1O76036 304 aa20.5■□□□□ 0.87
PITX1-201ENST00000265340 GPX2P18283 190 aa20.5■□□□□ 0.87
PITX1-201ENST00000265340 PITPNBP48739 271 aa20.5■□□□□ 0.87
PITX1-201ENST00000265340 SPIBQ01892 262 aa20.5■□□□□ 0.87
PITX1-201ENST00000265340 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
PITX1-201ENST00000265340 GUCA2BQ16661 112 aa20.5■□□□□ 0.87
PITX1-201ENST00000265340 ZSWIM7Q19AV6 140 aa20.5■□□□□ 0.87
PITX1-201ENST00000265340 C22orf39Q6P5X5 142 aa20.5■□□□□ 0.87
PITX1-201ENST00000265340 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
PITX1-201ENST00000265340 SLC6A18Q96N87 628 aa20.5■□□□□ 0.87
PITX1-201ENST00000265340 DOHHQ9BU89 302 aa20.5■□□□□ 0.87
PITX1-201ENST00000265340 TRPS1Q9UHF7 1281 aa20.5■□□□□ 0.87
PITX1-201ENST00000265340 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa20.5■□□□□ 0.87
PITX1-201ENST00000265340 LINC01565O15544 149 aa20.49■□□□□ 0.87
PITX1-201ENST00000265340 TSPAN7P41732 249 aa20.49■□□□□ 0.87
PITX1-201ENST00000265340 CDH12P55289 794 aa20.49■□□□□ 0.87
PITX1-201ENST00000265340 HTR4Q13639 388 aa20.49■□□□□ 0.87
PITX1-201ENST00000265340 ERV3-1Q14264 604 aa20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.5 ms