RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000265339.6

UBE2B-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBE2B, Length 2,515 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-201ENST00000265339 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa18.97■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 ENKURQ8TC29 256 aa18.97■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 MARVELD3Q96A59 401 aa18.97■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 SLC41A2Q96JW4 573 aa18.97■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 ZNF285Q96NJ3 590 aa18.97■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 REEP4Q9H6H4 257 aa18.97■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 TNFRSF21O75509 655 aa18.96■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 FURINP09958 794 aa18.96■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 KIR2DL3P43628 341 aa18.96■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 ST3GAL4Q11206 333 aa18.96■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 MADCAM1Q13477 382 aa18.96■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 PRTGQ2VWP7 1150 aa18.96■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 FAM131AQ6UXB0 335 aa18.96■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 ABHD13Q7L211 337 aa18.96■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 PRSS41Q7RTY9 318 aa18.96■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 TMEM80Q96HE8 168 aa18.96■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP18.96■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 NLNQ9BYT8 704 aa18.96■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP18.96■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP18.96■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 LAMP1P11279 417 aa18.96■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 HLA-DMAP28067 261 aa18.96■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 ARL4DP49703 201 aa18.96■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 PDE7AQ13946 482 aa18.96■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP18.96■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 ZNF385BQ569K4 471 aa18.96■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP18.96■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 D2HGDHQ8N465 521 aa18.96■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 KLHL6Q8WZ60 621 aa18.96■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 HRASLS5Q96KN8 279 aa18.96■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 OR5M11Q96RB7 305 aa18.96■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 PARD6AQ9NPB6 346 aa18.96■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 ATP6V1HQ9UI12 483 aa18.96■□□□□ 0.63
UBE2B-201ENST00000265339 CUL9Q8IWT3 2517 aa18.95■□□□□ 0.62
UBE2B-201ENST00000265339 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa18.95■□□□□ 0.62
UBE2B-201ENST00000265339 ZNF250P15622 560 aa18.95■□□□□ 0.62
UBE2B-201ENST00000265339 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP18.95■□□□□ 0.62
UBE2B-201ENST00000265339 RPS19P39019 145 aaKnown RBP18.95■□□□□ 0.62
UBE2B-201ENST00000265339 KIR3DL1P43629 444 aa18.95■□□□□ 0.62
UBE2B-201ENST00000265339 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP18.95■□□□□ 0.62
UBE2B-201ENST00000265339 SLC9A5Q14940 896 aa18.95■□□□□ 0.62
UBE2B-201ENST00000265339 TATDN3Q17R31 274 aa18.95■□□□□ 0.62
UBE2B-201ENST00000265339 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa18.95■□□□□ 0.62
UBE2B-201ENST00000265339 TIGD3Q6B0B8 471 aa18.95■□□□□ 0.62
UBE2B-201ENST00000265339 CAMKMTQ7Z624 323 aa18.95■□□□□ 0.62
UBE2B-201ENST00000265339 RNF130Q86XS8 419 aa18.95■□□□□ 0.62
UBE2B-201ENST00000265339 OR4D9Q8NGE8 314 aa18.95■□□□□ 0.62
UBE2B-201ENST00000265339 TBC1D20Q96BZ9 403 aa18.95■□□□□ 0.62
UBE2B-201ENST00000265339 HSH2DQ96JZ2 352 aa18.95■□□□□ 0.62
UBE2B-201ENST00000265339 ASPNQ9BXN1 380 aa18.95■□□□□ 0.62
UBE2B-201ENST00000265339 BARHL1Q9BZE3 327 aa18.95■□□□□ 0.62
UBE2B-201ENST00000265339 TMEM9BQ9NQ34 198 aa18.95■□□□□ 0.62
UBE2B-201ENST00000265339 NCDNQ9UBB6 729 aa18.95■□□□□ 0.62
UBE2B-201ENST00000265339 FTSJ1Q9UET6 329 aa18.95■□□□□ 0.62
UBE2B-201ENST00000265339 MAPRE3Q9UPY8 281 aa18.95■□□□□ 0.62
UBE2B-201ENST00000265339 TSPAN4O14817 238 aa18.95■□□□□ 0.62
UBE2B-201ENST00000265339 IDH2P48735 452 aaKnown RBP18.95■□□□□ 0.62
UBE2B-201ENST00000265339 TGM4P49221 684 aa18.95■□□□□ 0.62
UBE2B-201ENST00000265339 WNT3P56703 355 aa18.95■□□□□ 0.62
UBE2B-201ENST00000265339 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP18.95■□□□□ 0.62
UBE2B-201ENST00000265339 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa18.95■□□□□ 0.62
UBE2B-201ENST00000265339 KMT5CQ86Y97 462 aa18.95■□□□□ 0.62
UBE2B-201ENST00000265339 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP18.95■□□□□ 0.62
UBE2B-201ENST00000265339 OR8J2Q8NGG1 315 aa18.95■□□□□ 0.62
UBE2B-201ENST00000265339 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP18.95■□□□□ 0.62
UBE2B-201ENST00000265339 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa18.95■□□□□ 0.62
UBE2B-201ENST00000265339 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP18.95■□□□□ 0.62
UBE2B-201ENST00000265339 ASB4Q9Y574 426 aa18.95■□□□□ 0.62
UBE2B-201ENST00000265339 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa18.94■□□□□ 0.62
UBE2B-201ENST00000265339 H3BUI4 141 aa18.94■□□□□ 0.62
UBE2B-201ENST00000265339 CLIC1O00299 241 aa18.94■□□□□ 0.62
UBE2B-201ENST00000265339 TOX3O15405 576 aaPredicted RBP18.94■□□□□ 0.62
UBE2B-201ENST00000265339 GPX5O75715 221 aa18.94■□□□□ 0.62
UBE2B-201ENST00000265339 GSTM5P46439 218 aa18.94■□□□□ 0.62
UBE2B-201ENST00000265339 GPR19Q15760 415 aa18.94■□□□□ 0.62
UBE2B-201ENST00000265339 CSRP2Q16527 193 aa18.94■□□□□ 0.62
UBE2B-201ENST00000265339 PRSS53Q2L4Q9 553 aa18.94■□□□□ 0.62
UBE2B-201ENST00000265339 VMACQ2NL98 169 aa18.94■□□□□ 0.62
UBE2B-201ENST00000265339 CPTPQ5TA50 214 aa18.94■□□□□ 0.62
UBE2B-201ENST00000265339 SERPINA11Q86U17 422 aa18.94■□□□□ 0.62
UBE2B-201ENST00000265339 CDH24Q86UP0 819 aa18.94■□□□□ 0.62
UBE2B-201ENST00000265339 POP5Q969H6 163 aaKnown RBP18.94■□□□□ 0.62
UBE2B-201ENST00000265339 REEP1Q9H902 201 aa18.94■□□□□ 0.62
UBE2B-201ENST00000265339 SNTG1Q9NSN8 517 aa18.94■□□□□ 0.62
UBE2B-201ENST00000265339 ING3Q9NXR8 418 aa18.94■□□□□ 0.62
UBE2B-201ENST00000265339 SH3BP4Q9P0V3 963 aa18.94■□□□□ 0.62
UBE2B-201ENST00000265339 ATG4BQ9Y4P1 393 aa18.94■□□□□ 0.62
UBE2B-201ENST00000265339 KCNK5O95279 499 aa18.94■□□□□ 0.62
UBE2B-201ENST00000265339 FOLR1P15328 257 aa18.94■□□□□ 0.62
UBE2B-201ENST00000265339 DDCP20711 480 aa18.94■□□□□ 0.62
UBE2B-201ENST00000265339 ACP1P24666 158 aa18.94■□□□□ 0.62
UBE2B-201ENST00000265339 KDELR2P33947 212 aa18.94■□□□□ 0.62
UBE2B-201ENST00000265339 PDZK1Q5T2W1 519 aa18.94■□□□□ 0.62
UBE2B-201ENST00000265339 NAXDQ8IW45 347 aa18.94■□□□□ 0.62
UBE2B-201ENST00000265339 ZZZ3Q8IYH5 903 aa18.94■□□□□ 0.62
UBE2B-201ENST00000265339 UCN3Q969E3 161 aa18.94■□□□□ 0.62
UBE2B-201ENST00000265339 PPCDCQ96CD2 204 aa18.94■□□□□ 0.62
UBE2B-201ENST00000265339 C10orf90Q96M02 699 aa18.94■□□□□ 0.62
UBE2B-201ENST00000265339 PANX1Q96RD7 426 aa18.94■□□□□ 0.62
UBE2B-201ENST00000265339 SERINC2Q96SA4 455 aa18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.1 ms