RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000253462.7

GINS2-201, Transcript of GINS complex subunit 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GINS2, Length 2,673 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS2-201ENST00000253462 CDC73Q6P1J9 531 aa15□□□□□ -0.01
GINS2-201ENST00000253462 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
GINS2-201ENST00000253462 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
GINS2-201ENST00000253462 ZFP41Q8N8Y5 198 aa15□□□□□ -0.01
GINS2-201ENST00000253462 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
GINS2-201ENST00000253462 PINK1Q9BXM7 581 aa15□□□□□ -0.01
GINS2-201ENST00000253462 HCN3Q9P1Z3 774 aa15□□□□□ -0.01
GINS2-201ENST00000253462 SLC13A4Q9UKG4 626 aa15□□□□□ -0.01
GINS2-201ENST00000253462 STUB1Q9UNE7 303 aa15□□□□□ -0.01
GINS2-201ENST00000253462 LIPT1Q9Y234 373 aa15□□□□□ -0.01
GINS2-201ENST00000253462 OR2W5A6NFC9 320 aa14.99□□□□□ -0.01
GINS2-201ENST00000253462 SLITRK5O94991 958 aa14.99□□□□□ -0.01
GINS2-201ENST00000253462 GPR75O95800 540 aa14.99□□□□□ -0.01
GINS2-201ENST00000253462 CT62P0C5K7 136 aa14.99□□□□□ -0.01
GINS2-201ENST00000253462 ACP2P11117 423 aa14.99□□□□□ -0.01
GINS2-201ENST00000253462 RACK1P63244 317 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
GINS2-201ENST00000253462 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
GINS2-201ENST00000253462 GPR68Q15743 365 aa14.99□□□□□ -0.01
GINS2-201ENST00000253462 SNAPC1Q16533 368 aa14.99□□□□□ -0.01
GINS2-201ENST00000253462 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa14.99□□□□□ -0.01
GINS2-201ENST00000253462 MEDAGQ5VYS4 303 aa14.99□□□□□ -0.01
GINS2-201ENST00000253462 GKN2Q86XP6 184 aa14.99□□□□□ -0.01
GINS2-201ENST00000253462 SYT14Q8NB59 555 aa14.99□□□□□ -0.01
GINS2-201ENST00000253462 MORN4Q8NDC4 146 aa14.99□□□□□ -0.01
GINS2-201ENST00000253462 OR52P1PQ8NH57 321 aa14.99□□□□□ -0.01
GINS2-201ENST00000253462 PIK3R3Q92569 461 aa14.99□□□□□ -0.01
GINS2-201ENST00000253462 HOXD1Q9GZZ0 328 aa14.99□□□□□ -0.01
GINS2-201ENST00000253462 UCKL1Q9NWZ5 548 aa14.99□□□□□ -0.01
GINS2-201ENST00000253462 NDUFB11Q9NX14 153 aa14.99□□□□□ -0.01
GINS2-201ENST00000253462 CNIH4Q9P003 139 aa14.99□□□□□ -0.01
GINS2-201ENST00000253462 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
GINS2-201ENST00000253462 UNC13CQ8NB66 2214 aa14.99□□□□□ -0.01
GINS2-201ENST00000253462 VPS13AQ96RL7 3174 aa14.99□□□□□ -0.01
GINS2-201ENST00000253462 A0A075B6Q4 140 aa14.99□□□□□ -0.01
GINS2-201ENST00000253462 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa14.99□□□□□ -0.01
GINS2-201ENST00000253462 A0A1W2PRQ8 180 aa14.99□□□□□ -0.01
GINS2-201ENST00000253462 DUXAA6NLW8 204 aa14.99□□□□□ -0.01
GINS2-201ENST00000253462 A8MV72 311 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
GINS2-201ENST00000253462 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa14.99□□□□□ -0.01
GINS2-201ENST00000253462 GFERP55789 205 aa14.99□□□□□ -0.01
GINS2-201ENST00000253462 CAV3P56539 151 aa14.99□□□□□ -0.01
GINS2-201ENST00000253462 DEFA1P59665 94 aa14.99□□□□□ -0.01
GINS2-201ENST00000253462 DEFA3P59666 94 aa14.99□□□□□ -0.01
GINS2-201ENST00000253462 ERV3-1Q14264 604 aa14.99□□□□□ -0.01
GINS2-201ENST00000253462 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
GINS2-201ENST00000253462 NKAIN2Q5VXU1 208 aa14.99□□□□□ -0.01
GINS2-201ENST00000253462 FRRS1Q6ZNA5 592 aa14.99□□□□□ -0.01
GINS2-201ENST00000253462 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa14.99□□□□□ -0.01
GINS2-201ENST00000253462 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
GINS2-201ENST00000253462 GATAD2BQ8WXI9 593 aa14.99□□□□□ -0.01
GINS2-201ENST00000253462 TM9SF4Q92544 642 aa14.99□□□□□ -0.01
GINS2-201ENST00000253462 RACGAP1Q9H0H5 632 aa14.99□□□□□ -0.01
GINS2-201ENST00000253462 FBXO34Q9NWN3 711 aa14.99□□□□□ -0.01
GINS2-201ENST00000253462 TOR4AQ9NXH8 423 aa14.99□□□□□ -0.01
GINS2-201ENST00000253462 SEC14L4Q9UDX3 406 aa14.99□□□□□ -0.01
GINS2-201ENST00000253462 WDR45Q9Y484 360 aa14.99□□□□□ -0.01
GINS2-201ENST00000253462 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
GINS2-201ENST00000253462 TMEM131Q92545 1883 aa14.98□□□□□ -0.01
GINS2-201ENST00000253462 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa14.98□□□□□ -0.01
GINS2-201ENST00000253462 CASC3O15234 703 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
GINS2-201ENST00000253462 CHST10O43529 356 aa14.98□□□□□ -0.01
GINS2-201ENST00000253462 DYRK3O43781 588 aa14.98□□□□□ -0.01
GINS2-201ENST00000253462 CH25HO95992 272 aa14.98□□□□□ -0.01
GINS2-201ENST00000253462 PROS1P07225 676 aa14.98□□□□□ -0.01
GINS2-201ENST00000253462 BCKDHBP21953 392 aa14.98□□□□□ -0.01
GINS2-201ENST00000253462 RORCP51449 518 aa14.98□□□□□ -0.01
GINS2-201ENST00000253462 TAS2R41P59536 307 aa14.98□□□□□ -0.01
GINS2-201ENST00000253462 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
GINS2-201ENST00000253462 OCLNQ16625 522 aa14.98□□□□□ -0.01
GINS2-201ENST00000253462 MANEAQ5SRI9 462 aa14.98□□□□□ -0.01
GINS2-201ENST00000253462 PROKR2Q8NFJ6 384 aa14.98□□□□□ -0.01
GINS2-201ENST00000253462 OR8D4Q8NGM9 314 aa14.98□□□□□ -0.01
GINS2-201ENST00000253462 CAPSLQ8WWF8 208 aa14.98□□□□□ -0.01
GINS2-201ENST00000253462 TGM7Q96PF1 710 aa14.98□□□□□ -0.01
GINS2-201ENST00000253462 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
GINS2-201ENST00000253462 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
GINS2-201ENST00000253462 PTGFRNQ9P2B2 879 aa14.98□□□□□ -0.01
GINS2-201ENST00000253462 MUC3AQ02505 3323 aa14.98□□□□□ -0.01
GINS2-201ENST00000253462 SEC16AO15027 2179 aa14.98□□□□□ -0.01
GINS2-201ENST00000253462 NPIPA5A0A0B4J1W7 369 aa14.98□□□□□ -0.01
GINS2-201ENST00000253462 HYKKA2RU49 373 aa14.98□□□□□ -0.01
GINS2-201ENST00000253462 NPIPA7E9PJI5 369 aa14.98□□□□□ -0.01
GINS2-201ENST00000253462 APOA1P02647 267 aa14.98□□□□□ -0.01
GINS2-201ENST00000253462 DCNP07585 359 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
GINS2-201ENST00000253462 NPIPA8P0DM63 369 aa14.98□□□□□ -0.01
GINS2-201ENST00000253462 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
GINS2-201ENST00000253462 OR2B6P58173 313 aa14.98□□□□□ -0.01
GINS2-201ENST00000253462 STARD6P59095 220 aa14.98□□□□□ -0.01
GINS2-201ENST00000253462 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
GINS2-201ENST00000253462 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa14.98□□□□□ -0.01
GINS2-201ENST00000253462 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa14.98□□□□□ -0.01
GINS2-201ENST00000253462 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa14.98□□□□□ -0.01
GINS2-201ENST00000253462 FAM26EQ8N5C1 309 aa14.98□□□□□ -0.01
GINS2-201ENST00000253462 PRRC1Q96M27 445 aa14.98□□□□□ -0.01
GINS2-201ENST00000253462 NELL2Q99435 816 aa14.98□□□□□ -0.01
GINS2-201ENST00000253462 TM9SF2Q99805 663 aa14.98□□□□□ -0.01
GINS2-201ENST00000253462 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
GINS2-201ENST00000253462 ABCB9Q9NP78 766 aa14.98□□□□□ -0.01
GINS2-201ENST00000253462 CALML5Q9NZT1 146 aa14.98□□□□□ -0.01
GINS2-201ENST00000253462 NTMQ9P121 344 aa14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 66.7 ms