RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000229265.10

CDCA3-201, Transcript of cell division cycle associated 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CDCA3, Length 1,047 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA3-201ENST00000229265 TSPAN31Q12999 210 aa9.9□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 SEC23BQ15437 767 aa9.9□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 NR0B2Q15466 257 aa9.9□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 TGIF1Q15583 401 aa9.9□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 C3orf38Q5JPI3 329 aa9.9□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 NKAIN2Q5VXU1 208 aa9.9□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 ANKRD34AQ69YU3 496 aa9.9□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 C12orf73Q69YU5 71 aa9.9□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 FRRS1Q6ZNA5 592 aa9.9□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa9.9□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 MRGPREQ86SM8 312 aa9.9□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 VWA5B2Q8N398 1253 aa9.9□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 D2HGDHQ8N465 521 aa9.9□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 OR6T1Q8NGN1 323 aa9.9□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 ZCCHC10Q8TBK6 192 aa9.9□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 SLC7A13Q8TCU3 470 aa9.9□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 ACOT11Q8WXI4 607 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 SLC9A6Q92581 669 aa9.9□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 RIT1Q92963 219 aa9.9□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 TMIGD2Q96BF3 282 aa9.9□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 ISOC1Q96CN7 298 aa9.9□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 SLC41A2Q96JW4 573 aa9.9□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa9.9□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 SEMA4CQ9C0C4 833 aa9.9□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 PRORYQ9H606 182 aa9.9□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 CPNE5Q9HCH3 593 aa9.9□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa9.9□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 MED17Q9NVC6 651 aa9.9□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 RNF6Q9Y252 685 aa9.9□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 CLDN24A6NM45 220 aa9.89□□□□□ -0.83
CDCA3-201ENST00000229265 VGLL3A8MV65 326 aa9.89□□□□□ -0.83
CDCA3-201ENST00000229265 OR10H2O60403 315 aa9.89□□□□□ -0.83
CDCA3-201ENST00000229265 FCMRO60667 390 aa9.89□□□□□ -0.83
CDCA3-201ENST00000229265 PRAMEF2O60811 474 aa9.89□□□□□ -0.83
CDCA3-201ENST00000229265 SEMA7AO75326 666 aa9.89□□□□□ -0.83
CDCA3-201ENST00000229265 NME6O75414 186 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
CDCA3-201ENST00000229265 EPPINO95925 133 aa9.89□□□□□ -0.83
CDCA3-201ENST00000229265 CCNA2P20248 432 aa9.89□□□□□ -0.83
CDCA3-201ENST00000229265 TNFRSF1BP20333 461 aa9.89□□□□□ -0.83
CDCA3-201ENST00000229265 AGXTP21549 392 aa9.89□□□□□ -0.83
CDCA3-201ENST00000229265 SLC5A2P31639 672 aa9.89□□□□□ -0.83
CDCA3-201ENST00000229265 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
CDCA3-201ENST00000229265 YAP1P46937 504 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
CDCA3-201ENST00000229265 SMSP52788 366 aa9.89□□□□□ -0.83
CDCA3-201ENST00000229265 OR1D5P58170 312 aa9.89□□□□□ -0.83
CDCA3-201ENST00000229265 TAS2R41P59536 307 aa9.89□□□□□ -0.83
CDCA3-201ENST00000229265 EEF1A1P68104 462 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
CDCA3-201ENST00000229265 GABREP78334 506 aa9.89□□□□□ -0.83
CDCA3-201ENST00000229265 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP9.89□□□□□ -0.83
CDCA3-201ENST00000229265 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
CDCA3-201ENST00000229265 DUSP5Q16690 384 aa9.89□□□□□ -0.83
CDCA3-201ENST00000229265 CYP27C1Q4G0S4 372 aa9.89□□□□□ -0.83
CDCA3-201ENST00000229265 DCST2Q5T1A1 773 aa9.89□□□□□ -0.83
CDCA3-201ENST00000229265 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa9.89□□□□□ -0.83
CDCA3-201ENST00000229265 PGBD2Q6P3X8 592 aa9.89□□□□□ -0.83
CDCA3-201ENST00000229265 PODNL1Q6PEZ8 512 aa9.89□□□□□ -0.83
CDCA3-201ENST00000229265 ZNF613Q6PF04 617 aa9.89□□□□□ -0.83
CDCA3-201ENST00000229265 CASP12Q6UXS9 341 aa9.89□□□□□ -0.83
CDCA3-201ENST00000229265 DEF8Q6ZN54 512 aa9.89□□□□□ -0.83
CDCA3-201ENST00000229265 PTCHD4Q6ZW05 846 aa9.89□□□□□ -0.83
CDCA3-201ENST00000229265 SLITRK4Q8IW52 837 aa9.89□□□□□ -0.83
CDCA3-201ENST00000229265 SPACA3Q8IXA5 215 aa9.89□□□□□ -0.83
CDCA3-201ENST00000229265 GALNT12Q8IXK2 581 aa9.89□□□□□ -0.83
CDCA3-201ENST00000229265 ZNF440Q8IYI8 595 aa9.89□□□□□ -0.83
CDCA3-201ENST00000229265 CDK20Q8IZL9 346 aa9.89□□□□□ -0.83
CDCA3-201ENST00000229265 LSMEM1Q8N8F7 131 aa9.89□□□□□ -0.83
CDCA3-201ENST00000229265 MORN4Q8NDC4 146 aa9.89□□□□□ -0.83
CDCA3-201ENST00000229265 OR9A4Q8NGU2 314 aa9.89□□□□□ -0.83
CDCA3-201ENST00000229265 OSTF1Q92882 214 aa9.89□□□□□ -0.83
CDCA3-201ENST00000229265 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
CDCA3-201ENST00000229265 ART5Q96L15 291 aa9.89□□□□□ -0.83
CDCA3-201ENST00000229265 DGAT2Q96PD7 388 aa9.89□□□□□ -0.83
CDCA3-201ENST00000229265 CSF3RQ99062 836 aa9.89□□□□□ -0.83
CDCA3-201ENST00000229265 NUDT22Q9BRQ3 303 aa9.89□□□□□ -0.83
CDCA3-201ENST00000229265 YIPF4Q9BSR8 244 aa9.89□□□□□ -0.83
CDCA3-201ENST00000229265 CDCA4Q9BXL8 241 aa9.89□□□□□ -0.83
CDCA3-201ENST00000229265 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
CDCA3-201ENST00000229265 FANCEQ9HB96 536 aa9.89□□□□□ -0.83
CDCA3-201ENST00000229265 SLC25A19Q9HC21 320 aa9.89□□□□□ -0.83
CDCA3-201ENST00000229265 RLIMQ9NVW2 624 aa9.89□□□□□ -0.83
CDCA3-201ENST00000229265 MRTO4Q9UKD2 239 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
CDCA3-201ENST00000229265 ZNF443Q9Y2A4 671 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
CDCA3-201ENST00000229265 MRPS2Q9Y399 296 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
CDCA3-201ENST00000229265 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa9.89□□□□□ -0.83
CDCA3-201ENST00000229265 KCNE3Q9Y6H6 103 aa9.89□□□□□ -0.83
CDCA3-201ENST00000229265 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
CDCA3-201ENST00000229265 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa9.88□□□□□ -0.83
CDCA3-201ENST00000229265 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa9.88□□□□□ -0.83
CDCA3-201ENST00000229265 TRAPPC13A5PLN9 417 aa9.88□□□□□ -0.83
CDCA3-201ENST00000229265 CDHR4A6H8M9 788 aa9.88□□□□□ -0.83
CDCA3-201ENST00000229265 H3BMH7 237 aa9.88□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 103.7 ms